36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3234 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3234  PilT protein domain protein  100 
 
 		 138 aa  283  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3102  PilT protein domain protein  46.67 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0561  PilT protein domain protein  46.67 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183955  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0375  PilT domain-containing protein  43.51 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2481  nucleic-acid-binding protein contains PIN domain-like protein  42.64 
 
 		 136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1987  PilT protein domain protein  40.31 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000443268  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0621  PilT protein domain protein  41.18 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0197  Nucleotide binding protein PINc  41.09 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000623662  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1205  PilT protein domain protein  38.24 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00010263  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1522  PilT protein domain protein  37.12 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1056  PilT protein domain protein  34.15 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3493  PilT domain-containing protein  35.48 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3426  hypothetical protein  30.71 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3222  hypothetical protein  30.71 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333438  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2996  PilT protein domain protein  32.03 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.190317  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2399  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.108207  decreased coverage  0.00132588 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0315  PilT domain-containing protein  31.45 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0587  PilT protein domain protein  34 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1941  PilT protein domain protein  29.1 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2443  hypothetical protein  26.92 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1214  hypothetical protein  30.33 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000226808 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3084  PilT protein  31.15 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1077  hypothetical protein  26.27 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.918095  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1277  hypothetical protein  28.23 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.836734  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3352  PilT domain-containing protein  29.27 
 
 		 139 aa  47.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4815  PilT protein-like  29.27 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830494  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4164  PilT domain-containing protein  29.27 
 
 		 139 aa  47.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2285  PilT protein-like protein  28.45 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.420791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1698  PilT domain-containing protein  25.81 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.249544  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4258  PilT domain-containing protein  27.64 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25020  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  29.37 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2544  PilT protein-like  30.23 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3023  PilT domain-containing protein  26.32 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0615  hypothetical protein  27.2 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.466526  normal  0.0181742 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1153  hypothetical protein  25.41 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.948383  normal  0.0186046 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24970  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  29.37 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>