20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3222 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3426  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  255  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3222  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  255  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333438  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0375  PilT domain-containing protein  32.81 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3234  PilT protein domain protein  30.71 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2481  nucleic-acid-binding protein contains PIN domain-like protein  30 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0197  Nucleotide binding protein PINc  30.23 
 
 		 136 aa  67  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000623662  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1987  PilT protein domain protein  29.23 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000443268  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1522  PilT protein domain protein  32.58 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0621  PilT protein domain protein  30.4 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1941  PilT protein domain protein  32.26 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1153  hypothetical protein  37.11 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.948383  normal  0.0186046 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1205  PilT protein domain protein  27.2 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00010263  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0561  PilT protein domain protein  35.19 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183955  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3102  PilT protein domain protein  35.19 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1430  hypothetical protein  32.04 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.443392  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1214  hypothetical protein  27.12 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000226808 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2996  PilT protein domain protein  28.1 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.190317  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0315  PilT domain-containing protein  29.17 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2399  PilT protein domain protein  33.66 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.108207  decreased coverage  0.00132588 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1698  PilT domain-containing protein  34.25 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.249544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>