34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2996 on replicon NC_013206
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013206  Aaci_2996  PilT protein domain protein  100 
 
 
135 aa  278  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.190317  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1522  PilT protein domain protein  42.99 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2481  nucleic-acid-binding protein contains PIN domain-like protein  38.89 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0197  Nucleotide binding protein PINc  39.37 
 
 
136 aa  82  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000623662  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0375  PilT domain-containing protein  34.65 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1987  PilT protein domain protein  36.29 
 
 
138 aa  77  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000443268  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3234  PilT protein domain protein  32.03 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1941  PilT protein domain protein  31.71 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1056  PilT protein domain protein  29.77 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0621  PilT protein domain protein  36.45 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1205  PilT protein domain protein  34.45 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00010263  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0315  PilT domain-containing protein  29.27 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1214  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000226808 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3493  PilT domain-containing protein  28.79 
 
 
136 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2443  hypothetical protein  32.26 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2399  PilT protein domain protein  34.92 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.108207  decreased coverage  0.00132588 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0661  Pil-like protein  34.58 
 
 
136 aa  53.5  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3102  PilT protein domain protein  29.84 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0561  PilT protein domain protein  29.84 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183955  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2132  PilT protein domain protein  34.71 
 
 
130 aa  50.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1698  PilT domain-containing protein  38.46 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.249544  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2285  PilT protein-like protein  33.05 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.420791  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1917  PilT protein domain protein  29.27 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209239  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0615  hypothetical protein  29.46 
 
 
136 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.466526  normal  0.0181742 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4815  PilT protein-like  27.78 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830494  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03477  PilT-like protein  24.14 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4164  PilT domain-containing protein  27.78 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375778  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3352  PilT domain-containing protein  27.78 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4258  PilT domain-containing protein  28 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3222  hypothetical protein  28.1 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333438  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3426  hypothetical protein  28.1 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10628  hypothetical protein  26.28 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000854061  normal  0.434366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3084  PilT protein  28.68 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3023  PilT domain-containing protein  26.32 
 
 
128 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.769466 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>