38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0621 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0621  PilT protein domain protein  100 
 
 
134 aa  273  7e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1205  PilT protein domain protein  88.81 
 
 
134 aa  251  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00010263  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3102  PilT protein domain protein  41.98 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0561  PilT protein domain protein  41.98 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3234  PilT protein domain protein  41.18 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0375  PilT domain-containing protein  35.82 
 
 
137 aa  94  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2481  nucleic-acid-binding protein contains PIN domain-like protein  34.38 
 
 
136 aa  87  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1987  PilT protein domain protein  33.59 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000443268  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1522  PilT protein domain protein  34.09 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0197  Nucleotide binding protein PINc  33.59 
 
 
136 aa  84  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000623662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3493  PilT domain-containing protein  34.51 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2399  PilT protein domain protein  39.32 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.108207  decreased coverage  0.00132588 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2996  PilT protein domain protein  36.45 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.190317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0587  PilT protein domain protein  36.84 
 
 
101 aa  62.8  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2205  PilT protein domain protein  30.89 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000141921 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0315  PilT domain-containing protein  30.08 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1056  PilT protein domain protein  28.69 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1340  PilT protein-like  36.92 
 
 
136 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0194017 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3222  hypothetical protein  30.4 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333438  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3426  hypothetical protein  30.4 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1214  hypothetical protein  27.27 
 
 
125 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000226808 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3084  PilT protein  32.65 
 
 
129 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2443  hypothetical protein  29.63 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1698  PilT domain-containing protein  27.97 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.249544  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2155  hypothetical protein  25.19 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0334  PilT protein-like  30.77 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184149  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1153  hypothetical protein  25.21 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.948383  normal  0.0186046 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2544  PilT protein-like  31.78 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2285  PilT protein-like protein  34.85 
 
 
133 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.420791  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1941  PilT protein domain protein  23.53 
 
 
132 aa  43.5  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3352  PilT domain-containing protein  27.2 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4815  PilT protein-like  27.2 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830494  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4164  PilT domain-containing protein  27.2 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375778  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4258  PilT domain-containing protein  28.18 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2132  PilT protein domain protein  29.59 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1917  PilT protein domain protein  32.43 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209239  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0661  Pil-like protein  28.79 
 
 
136 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1077  hypothetical protein  27.27 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.918095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>