32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3010 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3010  PilT protein-like  100 
 
 		 131 aa  257  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4258  PilT domain-containing protein  35.11 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4164  PilT domain-containing protein  39.69 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3352  PilT domain-containing protein  39.69 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4815  PilT protein-like  39.69 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830494  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2443  hypothetical protein  37.1 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5676  hypothetical protein  29.77 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.304221 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3176  hypothetical protein  36.64 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2285  PilT protein-like protein  31.78 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.420791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24970  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  35.07 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3501  PilT protein-like  34.96 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1917  PilT protein domain protein  37.6 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209239  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1698  PilT domain-containing protein  31.3 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.249544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1340  PilT protein-like  39.13 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0194017 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25020  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  30.16 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2132  PilT protein domain protein  33.9 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1153  hypothetical protein  38.81 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.948383  normal  0.0186046 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1077  hypothetical protein  32.26 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.918095  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0661  Pil-like protein  30.23 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0615  hypothetical protein  30.6 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.466526  normal  0.0181742 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3693  PilT protein-like  31.2 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1277  hypothetical protein  33.87 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.836734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3013  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2544  PilT protein-like  31.18 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4208  hypothetical protein  34.62 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3493  PilT domain-containing protein  25.42 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1522  PilT protein domain protein  24.53 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3084  PilT protein  27.27 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3023  PilT domain-containing protein  30.89 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0561  PilT protein domain protein  24.59 
 
 		 149 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183955  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3102  PilT protein domain protein  24.59 
 
 		 149 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2399  PilT protein domain protein  24.44 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.108207  decreased coverage  0.00132588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>