21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2575 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2575  PilT domain-containing protein  100 
 
 
136 aa  277  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0169  PilT domain-containing protein  40.91 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2474  PilT protein-like protein  41.67 
 
 
141 aa  98.6  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000026246  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2069  PilT protein-like  40.83 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2426  PilT domain-containing protein  30.83 
 
 
137 aa  87  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0408  PilT domain-containing protein  38.81 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108029  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0195  PilT protein-like  32.31 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3732  PilT protein domain protein  37.07 
 
 
129 aa  72  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1911  PilT protein-like  28.81 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4197  PilT protein domain protein  35.66 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.694729  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1221  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4646  PilT protein domain protein  31.13 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000332576  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0249  hypothetical protein  34.25 
 
 
128 aa  47  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.216982  normal  0.362325 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0302  hypothetical protein  36.11 
 
 
119 aa  45.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.778227  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2436  PilT protein domain protein  25.47 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.76647  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1534  PilT domain-containing protein  27.73 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.281833  normal  0.0745617 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2151  PilT protein-like  32.54 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0867  PilT protein domain protein  26.55 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0392  PilT domain-containing protein  32.2 
 
 
139 aa  41.6  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2775  PilT protein domain protein  31.07 
 
 
132 aa  41.6  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.469069  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0315  PilT domain-containing protein  27.2 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>