19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1911 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1911  PilT protein-like  100 
 
 
129 aa  261  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2575  PilT domain-containing protein  28.81 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0408  PilT domain-containing protein  32.2 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108029  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0195  PilT protein-like  29.75 
 
 
146 aa  61.6  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2426  PilT domain-containing protein  26.45 
 
 
137 aa  57.8  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0169  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0867  PilT protein domain protein  33.62 
 
 
133 aa  54.7  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2069  PilT protein-like  27.2 
 
 
143 aa  51.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0424  PilT domain-containing protein  26.32 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.437549  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2474  PilT protein-like protein  23.48 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000026246  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4197  PilT protein domain protein  25.74 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.694729  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0334  PilT protein-like  30 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184149  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2775  PilT protein domain protein  31.62 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.469069  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0389  PilT protein domain protein  26.05 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1224  PilT protein domain protein  26.77 
 
 
141 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1534  PilT domain-containing protein  26.45 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.281833  normal  0.0745617 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0026  PilT protein domain protein  25.58 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  27.56 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1221  PilT domain-containing protein  28.79 
 
 
164 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>