29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1224 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1224  PilT protein domain protein  100 
 
 		 141 aa  286  7e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0177  PilT domain-containing protein  50.78 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.872264  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0236  PilT domain-containing protein  39.57 
 
 		 136 aa  97.4  7e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0067  PilT protein domain protein  40.16 
 
 		 138 aa  97.1  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0300  hypothetical protein  38.71 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.372415  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5555  PilT protein domain protein  38.14 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0099  PilT protein domain protein  34.62 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0366  PilT domain-containing protein  36.36 
 
 		 147 aa  84  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.732059 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13700  PIN domain protein  34.62 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2141  PilT protein domain protein  33.83 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.976499 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0026  PilT protein domain protein  31.69 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0123  PilT protein domain protein  31.58 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2577  hypothetical protein  31.3 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0698  PilT domain-containing protein  34.33 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2686  PilT protein domain protein  30.94 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0887  PilT domain-containing protein  32.31 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631126  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0119  hypothetical protein  31.4 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0483151  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2306  PilT domain-containing protein  35.34 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131604 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11160  hypothetical protein  32.84 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  28 
 
 		 306 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26830  hypothetical protein  26.52 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1184  PIN domain protein, putative  31.39 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0978  PilT domain-containing protein  28.87 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.217375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1173  PilT domain-containing protein  28 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0475965  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1183  hypothetical protein  29.03 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.686907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1522  PilT protein domain protein  27.01 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1911  PilT protein-like  26.77 
 
 		 129 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3456  PilT protein domain protein  26.32 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000635696 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24240  hypothetical protein  24.14 
 
 		 145 aa  40.4  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>