26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1327 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1327  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  291  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.668385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1690  hypothetical protein  44.44 
 
 
147 aa  131  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1683  hypothetical protein  44.44 
 
 
147 aa  131  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.523033  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4326  hypothetical protein  37.3 
 
 
144 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0135  hypothetical protein  34.33 
 
 
152 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.751747  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3076  hypothetical protein  41.04 
 
 
158 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204433  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0111  hypothetical protein  37.7 
 
 
173 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0343682 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0757  hypothetical protein  37.5 
 
 
146 aa  93.6  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0082661  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0880  hypothetical protein  35.2 
 
 
150 aa  92.8  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3071  hypothetical protein  41.48 
 
 
159 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3020  hypothetical protein  36.59 
 
 
149 aa  90.9  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0214  hypothetical protein  38.83 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0349  hypothetical protein  35.82 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.667953  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0498  hypothetical protein  34.15 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3253  hypothetical protein  32.84 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2866  hypothetical protein  31.65 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.486103  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0942  hypothetical protein  29.85 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0578  hypothetical protein  35.25 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0837806  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4388  hypothetical protein  33.33 
 
 
85 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979546  hitchhiker  0.0000000471014 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1702  hypothetical protein  28.24 
 
 
150 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4487  hypothetical protein  45.65 
 
 
48 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.208977  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1902  hypothetical protein  46.3 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00660694  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4389  hypothetical protein  44.74 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.900665  hitchhiker  0.000000548399 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0088  hypothetical protein  31.08 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.713807  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0086  hypothetical protein  31.08 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3686  PilT domain-containing protein  33.04 
 
 
153 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>