21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3277 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3277  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  392  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0073  hypothetical protein  46.28 
 
 
196 aa  164  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  31.13 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  29.67 
 
 
191 aa  54.7  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2343  hypothetical protein  33.12 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000144588  unclonable  0.000000152413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1266  hypothetical protein  33.12 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  30.68 
 
 
191 aa  52.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3278  hypothetical protein  31.85 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423903  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4152  hypothetical protein  33.54 
 
 
191 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682619  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  27.22 
 
 
191 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  29.94 
 
 
171 aa  48.5  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0847  hypothetical protein  28.27 
 
 
200 aa  48.5  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8411  hypothetical protein  33.57 
 
 
144 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1505  hypothetical protein  28.29 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00633396  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3384  hypothetical protein  27.47 
 
 
188 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8220  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2638  hypothetical protein  28.87 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0694  hypothetical protein  27.03 
 
 
189 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0775064  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1184  hypothetical protein  28.49 
 
 
180 aa  41.2  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430255  normal  0.82383 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0233  hypothetical protein  26.63 
 
 
190 aa  41.2  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4436  hypothetical protein  24.06 
 
 
189 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713232  normal  0.574108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>