26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0506 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0506  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0731238  normal  0.493986 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  44.44 
 
 
134 aa  114  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  42.19 
 
 
146 aa  107  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  40.94 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  44.54 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  30.83 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  31.67 
 
 
141 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  31.67 
 
 
141 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  31.78 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  28.99 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0993  hypothetical protein  29.03 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  27.27 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4601  PilT protein domain protein  29.63 
 
 
152 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0345654  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1022  hypothetical protein  28 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  33.8 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2883  hypothetical protein  25.53 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  21.01 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  32.06 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1975  hypothetical protein  27.69 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1737  Nucleotide binding protein PINc  25.47 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361263  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  29.77 
 
 
136 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  27.78 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  25.37 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  28.78 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  26.81 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0103  hypothetical protein  26.28 
 
 
163 aa  40  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0252729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>