More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0996 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2822  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  68.69 
 
 
585 aa  683    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112551  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0996  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
595 aa  1214    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1281  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  60.76 
 
 
565 aa  656    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.532683  normal  0.302449 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3925  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  55.12 
 
 
562 aa  619  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3191  NADH dehydrogenase (quinone)  58.26 
 
 
562 aa  616  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3267  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  57.4 
 
 
572 aa  610  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00072788  normal  0.294343 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4652  NADH dehydrogenase (quinone)  58.2 
 
 
580 aa  609  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198503  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2577  dehydrogenase subunit, putative  56.4 
 
 
561 aa  601  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1110  NADH dehydrogenase (quinone)  53.39 
 
 
600 aa  601  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2512  NADH dehydrogenase (quinone)  57.94 
 
 
563 aa  601  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.477577  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0825  NADH dehydrogenase (quinone)  56.24 
 
 
600 aa  598  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8359  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  58.8 
 
 
567 aa  596  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5227  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  58.8 
 
 
572 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00138692  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5042  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  55.56 
 
 
572 aa  592  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.558734  normal  0.200825 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0294  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  55.91 
 
 
572 aa  590  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.972061  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4581  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  55.56 
 
 
572 aa  591  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.531155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4073  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  54.42 
 
 
612 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6172  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  55.73 
 
 
572 aa  588  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  58.36 
 
 
566 aa  585  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235735  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3471  NADH dehydrogenase (quinone)  54.18 
 
 
640 aa  585  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.119325 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2428  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  57.22 
 
 
557 aa  580  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0338  NADH dehydrogenase (quinone)  58.82 
 
 
573 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2798  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  53.06 
 
 
661 aa  571  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0743425  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3270  NADH dehydrogenase (quinone)  56.59 
 
 
591 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4112  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  37.48 
 
 
656 aa  318  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483313  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  35.07 
 
 
614 aa  316  6e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.18 
 
 
421 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  36.73 
 
 
607 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  36.73 
 
 
607 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  36.22 
 
 
602 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  41.18 
 
 
407 aa  310  5.9999999999999995e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  39.29 
 
 
532 aa  310  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  38.66 
 
 
537 aa  309  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  40.34 
 
 
604 aa  308  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.02 
 
 
441 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.02 
 
 
441 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.02 
 
 
441 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  34.35 
 
 
597 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  37.91 
 
 
597 aa  302  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  35.5 
 
 
610 aa  301  3e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  41.39 
 
 
407 aa  301  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  41.61 
 
 
677 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  34.43 
 
 
614 aa  298  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  36.17 
 
 
626 aa  297  3e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.24 
 
 
441 aa  296  9e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  35.67 
 
 
572 aa  295  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  40.85 
 
 
656 aa  294  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1024  NADH dehydrogenase (quinone)  39.85 
 
 
407 aa  294  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  35.51 
 
 
595 aa  294  4e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  39.86 
 
 
626 aa  293  5e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  36.59 
 
 
552 aa  293  7e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  39.86 
 
 
623 aa  292  1e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  34.23 
 
 
594 aa  292  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  35.93 
 
 
535 aa  292  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  35.22 
 
 
636 aa  291  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  35.22 
 
 
636 aa  291  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  39.16 
 
 
623 aa  290  6e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.98 
 
 
447 aa  289  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  36.45 
 
 
570 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0216  NADH dehydrogenase (quinone)  40.25 
 
 
425 aa  288  2e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  38.79 
 
 
545 aa  288  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  39.27 
 
 
488 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  42.78 
 
 
428 aa  288  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  38.79 
 
 
545 aa  287  4e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  34.65 
 
 
626 aa  286  5e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0864  hydrogenase subunit HymB, putative  34.66 
 
 
640 aa  286  7e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  39.2 
 
 
594 aa  286  7e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  40.85 
 
 
592 aa  286  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  38.82 
 
 
624 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  34.65 
 
 
626 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  42.17 
 
 
427 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  39.36 
 
 
619 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.1 
 
 
426 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  34.86 
 
 
596 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.31 
 
 
422 aa  285  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1517  NADH dehydrogenase (quinone)  40.76 
 
 
427 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  35.09 
 
 
569 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  38.53 
 
 
597 aa  284  4.0000000000000003e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0748  NADH dehydrogenase I subunit F  43.55 
 
 
432 aa  283  5.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147388  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.81 
 
 
434 aa  283  6.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  40.59 
 
 
590 aa  283  7.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.95 
 
 
438 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  42.25 
 
 
430 aa  282  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24670  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  35.47 
 
 
597 aa  282  1e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  37.77 
 
 
486 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.56 
 
 
443 aa  281  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  39.33 
 
 
597 aa  281  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  43.35 
 
 
432 aa  280  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  32.32 
 
 
632 aa  280  4e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2794  NADH dehydrogenase (quinone)  41.08 
 
 
572 aa  280  5e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  38.78 
 
 
545 aa  280  5e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1634  NADP-reducing hydrogenase chain C  37.53 
 
 
486 aa  280  7e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000096005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1844  NADP-reducing hydrogenase chain C  37.53 
 
 
486 aa  280  7e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  34.1 
 
 
629 aa  280  7e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1265  NADH dehydrogenase I subunit F  42.7 
 
 
434 aa  279  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0807  NADH dehydrogenase (quinone)  40.91 
 
 
404 aa  279  9e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3862  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.87 
 
 
443 aa  279  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  33.07 
 
 
588 aa  279  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  40.76 
 
 
428 aa  279  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1545  NADH dehydrogenase (quinone)  41.33 
 
 
668 aa  279  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.569986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>