More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2988 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  75 
 
 		 433 aa  645    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43184  predicted protein  71.6 
 
 		 449 aa  636    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.236516  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3293  NADH dehydrogenase I subunit F  69.91 
 
 		 441 aa  637    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0807  NADH dehydrogenase I subunit F  71.4 
 
 		 435 aa  649    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.662201  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1265  NADH dehydrogenase I subunit F  72.02 
 
 		 434 aa  656    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2418  NADH dehydrogenase I subunit F  70.02 
 
 		 435 aa  636    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1882  NADH dehydrogenase I subunit F  74.52 
 
 		 441 aa  644    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1080  NADH dehydrogenase I subunit F  74.29 
 
 		 433 aa  639    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3333  NADH dehydrogenase I subunit F  73.27 
 
 		 441 aa  647    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240845  normal  0.194232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1357  NADH dehydrogenase I subunit F  71.79 
 
 		 434 aa  656    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2394  NADH dehydrogenase I subunit F  74.29 
 
 		 436 aa  651    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.140128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4556  NADH dehydrogenase I subunit F  75 
 
 		 441 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1560  NADH dehydrogenase I subunit F  76.25 
 
 		 429 aa  662    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1014  NADH dehydrogenase I subunit F  74.05 
 
 		 433 aa  638    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2579  NADH dehydrogenase I subunit F  72.97 
 
 		 441 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  87.53 
 
 		 428 aa  776    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1179  NADH dehydrogenase I subunit F  73.81 
 
 		 431 aa  636    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.049393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2408  NADH dehydrogenase I subunit F  72.37 
 
 		 441 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0121136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2880  NADH dehydrogenase I subunit F  73.21 
 
 		 441 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.756344  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2215  NADH dehydrogenase I subunit F  73.82 
 
 		 441 aa  642    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0802  NADH dehydrogenase I subunit F  71.17 
 
 		 435 aa  647    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  100 
 
 		 432 aa  883    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4395  NADH dehydrogenase I subunit F  76.56 
 
 		 433 aa  658    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0748  NADH dehydrogenase I subunit F  74.65 
 
 		 432 aa  652    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  87.24 
 
 		 430 aa  779    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1209  NADH dehydrogenase I subunit F  74.29 
 
 		 433 aa  639    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1027  NADH dehydrogenase I subunit F  77.73 
 
 		 434 aa  683    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4131  NADH dehydrogenase I subunit F  76.08 
 
 		 433 aa  655    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.519753  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0894  NADH dehydrogenase I subunit F  72.94 
 
 		 434 aa  657    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3221  NADH dehydrogenase I subunit F  73.61 
 
 		 429 aa  665    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2055  NADH dehydrogenase I subunit F  75.12 
 
 		 433 aa  651    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2243  NADH dehydrogenase I subunit F  72.49 
 
 		 431 aa  645    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0486512  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1718  NADH dehydrogenase I subunit F  72.25 
 
 		 434 aa  654    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2923  NADH dehydrogenase I subunit F  74.52 
 
 		 436 aa  654    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4628  NADH dehydrogenase I subunit F  70.95 
 
 		 433 aa  632  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133099 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2518  NADH dehydrogenase I subunit F  69.7 
 
 		 431 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1180  NADH dehydrogenase I subunit F  69.7 
 
 		 431 aa  633  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258408  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2001  NADH dehydrogenase I subunit F  69.7 
 
 		 431 aa  631  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0926  NADH dehydrogenase I subunit F  70.83 
 
 		 431 aa  628  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2828  NADH dehydrogenase I subunit F  76.08 
 
 		 439 aa  626  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.256146  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0486  NADH dehydrogenase I subunit F  67.38 
 
 		 427 aa  624  1e-177  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0548  NADH dehydrogenase I subunit F  67.22 
 
 		 427 aa  622  1e-177  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1360  NADH dehydrogenase I subunit F  70.24 
 
 		 437 aa  616  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315276  normal  0.0477199 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05629  NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  69.6 
 
 		 497 aa  613  9.999999999999999e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0623546 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0783  NADH dehydrogenase I subunit F  69.14 
 
 		 435 aa  613  9.999999999999999e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.860034  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43944  predicted protein  68.9 
 
 		 493 aa  610  1e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323695  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0976  NADH dehydrogenase I subunit F  67.94 
 
 		 417 aa  600  1e-170  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04070  NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit, putative  65.32 
 
 		 534 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31688  NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit, mitochondrial precursor (Complex I-51KD) (CI-51KD)  64.61 
 
 		 484 aa  578  1e-164  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.472796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0714  NADH dehydrogenase I subunit F  63.07 
 
 		 413 aa  558  1e-158  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.657968  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  56.9 
 
 		 424 aa  465  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.73 
 
 		 426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.7 
 
 		 425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.07 
 
 		 425 aa  450  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.9 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.9 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.79 
 
 		 427 aa  441  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  53.69 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.68 
 
 		 429 aa  435  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.48 
 
 		 426 aa  435  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.2 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  51.23 
 
 		 425 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  51.23 
 
 		 425 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.2 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.07 
 
 		 452 aa  430  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  55.38 
 
 		 426 aa  429  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.48 
 
 		 425 aa  428  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.58 
 
 		 446 aa  426  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0359658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.51 
 
 		 443 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0932  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.46 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5175  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.14 
 
 		 452 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.46 
 
 		 442 aa  422  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0962  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.9 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089517 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.48 
 
 		 426 aa  421  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.98 
 
 		 467 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0877  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.14 
 
 		 453 aa  423  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.93 
 
 		 452 aa  422  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.76 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0966  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.45 
 
 		 431 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01292  NADH-quinone oxidoreductase, f subunit  51.45 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.314011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.49 
 
 		 706 aa  419  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.35 
 
 		 434 aa  420  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7686  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.11 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  51.11 
 
 		 422 aa  416  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.23 
 
 		 442 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  51.11 
 
 		 422 aa  416  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  49.88 
 
 		 438 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  50.87 
 
 		 445 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2056  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.6 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.78 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.23 
 
 		 440 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.98 
 
 		 436 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.86 
 
 		 433 aa  413  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3505  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.11 
 
 		 446 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.18 
 
 		 458 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3209  putative NADH dehydrogenase I (chain F), NuoF  51.48 
 
 		 442 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1632  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.74 
 
 		 436 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2244  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.74 
 
 		 436 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.98 
 
 		 436 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.121706  normal  0.072136 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.49 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>