More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0894 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2394  NADH dehydrogenase I subunit F  76.76 
 
 		 436 aa  694    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.140128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0894  NADH dehydrogenase I subunit F  100 
 
 		 434 aa  903    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0807  NADH dehydrogenase I subunit F  81.84 
 
 		 435 aa  748    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.662201  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4131  NADH dehydrogenase I subunit F  76.16 
 
 		 433 aa  697    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.519753  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3293  NADH dehydrogenase I subunit F  74.6 
 
 		 441 aa  688    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1882  NADH dehydrogenase I subunit F  75.94 
 
 		 441 aa  669    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1080  NADH dehydrogenase I subunit F  75.35 
 
 		 433 aa  682    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2418  NADH dehydrogenase I subunit F  81.15 
 
 		 435 aa  747    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2518  NADH dehydrogenase I subunit F  75.06 
 
 		 431 aa  679    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3221  NADH dehydrogenase I subunit F  76.55 
 
 		 429 aa  695    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2923  NADH dehydrogenase I subunit F  76.64 
 
 		 436 aa  698    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1718  NADH dehydrogenase I subunit F  84.79 
 
 		 434 aa  780    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43184  predicted protein  71.36 
 
 		 449 aa  654    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.236516  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1560  NADH dehydrogenase I subunit F  72.08 
 
 		 429 aa  635    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2001  NADH dehydrogenase I subunit F  75.06 
 
 		 431 aa  675    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1209  NADH dehydrogenase I subunit F  75.35 
 
 		 433 aa  682    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2579  NADH dehydrogenase I subunit F  76.24 
 
 		 441 aa  684    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  76 
 
 		 428 aa  676    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1179  NADH dehydrogenase I subunit F  80.14 
 
 		 431 aa  699    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.049393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0783  NADH dehydrogenase I subunit F  78.29 
 
 		 435 aa  732    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.860034  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2408  NADH dehydrogenase I subunit F  75.29 
 
 		 441 aa  680    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0121136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1265  NADH dehydrogenase I subunit F  84.56 
 
 		 434 aa  780    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2880  NADH dehydrogenase I subunit F  76 
 
 		 441 aa  683    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.756344  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2215  NADH dehydrogenase I subunit F  75.94 
 
 		 441 aa  671    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4556  NADH dehydrogenase I subunit F  78.54 
 
 		 441 aa  696    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4395  NADH dehydrogenase I subunit F  77.08 
 
 		 433 aa  705    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0748  NADH dehydrogenase I subunit F  80.62 
 
 		 432 aa  711    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  73.33 
 
 		 430 aa  664    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1027  NADH dehydrogenase I subunit F  83.64 
 
 		 434 aa  764    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1014  NADH dehydrogenase I subunit F  75.12 
 
 		 433 aa  679    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1180  NADH dehydrogenase I subunit F  75.06 
 
 		 431 aa  679    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258408  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4628  NADH dehydrogenase I subunit F  78.2 
 
 		 433 aa  705    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133099 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  80.86 
 
 		 433 aa  713    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0802  NADH dehydrogenase I subunit F  82.3 
 
 		 435 aa  752    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1360  NADH dehydrogenase I subunit F  70.88 
 
 		 437 aa  635    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315276  normal  0.0477199 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  72.94 
 
 		 432 aa  657    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2828  NADH dehydrogenase I subunit F  74.31 
 
 		 439 aa  635    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.256146  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2055  NADH dehydrogenase I subunit F  75.46 
 
 		 433 aa  693    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2243  NADH dehydrogenase I subunit F  77.94 
 
 		 431 aa  694    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0486512  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3333  NADH dehydrogenase I subunit F  73.81 
 
 		 441 aa  659    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240845  normal  0.194232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1357  NADH dehydrogenase I subunit F  84.79 
 
 		 434 aa  781    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0926  NADH dehydrogenase I subunit F  69.56 
 
 		 431 aa  631  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04070  NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit, putative  67.3 
 
 		 534 aa  611  9.999999999999999e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05629  NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  65.73 
 
 		 497 aa  605  9.999999999999999e-173  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0623546 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0486  NADH dehydrogenase I subunit F  66.04 
 
 		 427 aa  590  1e-167  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43944  predicted protein  65.31 
 
 		 493 aa  586  1e-166  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323695  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31688  NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit, mitochondrial precursor (Complex I-51KD) (CI-51KD)  64.42 
 
 		 484 aa  585  1e-166  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.472796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0548  NADH dehydrogenase I subunit F  64.39 
 
 		 427 aa  578  1e-164  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0976  NADH dehydrogenase I subunit F  65.62 
 
 		 417 aa  569  1e-161  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0714  NADH dehydrogenase I subunit F  62.26 
 
 		 413 aa  541  1e-153  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.657968  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.09 
 
 		 425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.32 
 
 		 424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.98 
 
 		 426 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.98 
 
 		 425 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.06 
 
 		 442 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.82 
 
 		 427 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.82 
 
 		 427 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.51 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.74 
 
 		 452 aa  433  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  55.47 
 
 		 425 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  55.47 
 
 		 425 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.19 
 
 		 467 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3505  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.32 
 
 		 446 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0877  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.96 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0962  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.72 
 
 		 453 aa  425  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5175  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.57 
 
 		 452 aa  425  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  56.23 
 
 		 425 aa  425  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.11 
 
 		 426 aa  425  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.85 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.52 
 
 		 452 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  53.35 
 
 		 426 aa  422  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  53.12 
 
 		 431 aa  420  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.85 
 
 		 458 aa  420  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1408  NADH dehydrogenase (quinone)  53.17 
 
 		 448 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344302  normal  0.160337 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  54.4 
 
 		 422 aa  417  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.62 
 
 		 431 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  54.4 
 
 		 422 aa  418  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.62 
 
 		 431 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.5 
 
 		 442 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.24 
 
 		 436 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2056  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.67 
 
 		 441 aa  413  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0932  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.12 
 
 		 431 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.24 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1632  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.24 
 
 		 436 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2244  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.24 
 
 		 436 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.24 
 
 		 436 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.121706  normal  0.072136 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1429  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.33 
 
 		 473 aa  413  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.332144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0418  NADH dehydrogenase I, F subunit  51.87 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  51.87 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.12 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  51.87 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.33 
 
 		 446 aa  409  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0359658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.12 
 
 		 436 aa  411  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52 
 
 		 442 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020872  hitchhiker  0.00762126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3209  putative NADH dehydrogenase I (chain F), NuoF  52 
 
 		 442 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1747  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.09 
 
 		 439 aa  408  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1135  NADH dehydrogenase I, F subunit  51.87 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305748  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2282  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.99 
 
 		 436 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.502286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1304  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.12 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.16 
 
 		 443 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>