More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5175 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1033  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  78.12 
 
 		 436 aa  671    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.970624  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1304  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.41 
 
 		 436 aa  688    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0418  NADH dehydrogenase I, F subunit  77.18 
 
 		 436 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5175  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  100 
 
 		 452 aa  939    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82972  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  75.53 
 
 		 431 aa  675    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.41 
 
 		 442 aa  686    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  77.18 
 
 		 436 aa  686    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  76.47 
 
 		 442 aa  677    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020872  hitchhiker  0.00762126 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0966  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.29 
 
 		 431 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.41 
 
 		 436 aa  688    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1046  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.19 
 
 		 432 aa  653    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  78.12 
 
 		 440 aa  692    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1295  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.18 
 
 		 436 aa  685    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  76 
 
 		 431 aa  679    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.88 
 
 		 436 aa  691    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  73.65 
 
 		 425 aa  637    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.41 
 
 		 436 aa  687    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  79.73 
 
 		 458 aa  741    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  83.63 
 
 		 467 aa  790    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3209  putative NADH dehydrogenase I (chain F), NuoF  76.24 
 
 		 442 aa  680    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0932  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.29 
 
 		 431 aa  673    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.65 
 
 		 436 aa  690    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.121706  normal  0.072136 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  76 
 
 		 431 aa  678    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1632  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.65 
 
 		 436 aa  690    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0877  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  88.51 
 
 		 453 aa  810    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1408  NADH dehydrogenase (quinone)  83.79 
 
 		 448 aa  742    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344302  normal  0.160337 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2282  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.88 
 
 		 436 aa  690    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.502286  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2244  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.65 
 
 		 436 aa  690    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  77.18 
 
 		 436 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  82.54 
 
 		 452 aa  775    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3505  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  84.47 
 
 		 446 aa  759    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1506  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  82.7 
 
 		 452 aa  737    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00816775 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.42 
 
 		 432 aa  655    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.725894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  86.06 
 
 		 452 aa  793    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1429  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  83.89 
 
 		 473 aa  773    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.332144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0962  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  88.29 
 
 		 453 aa  809    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089517 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1135  NADH dehydrogenase I, F subunit  77.18 
 
 		 436 aa  686    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  70.31 
 
 		 442 aa  627  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  73.27 
 
 		 426 aa  626  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1747  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.38 
 
 		 439 aa  611  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.02 
 
 		 425 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.7 
 
 		 426 aa  571  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2056  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.35 
 
 		 441 aa  558  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  64.34 
 
 		 425 aa  555  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  62.89 
 
 		 426 aa  550  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  65.22 
 
 		 425 aa  543  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  65.22 
 
 		 425 aa  543  1e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.75 
 
 		 427 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.75 
 
 		 427 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.95 
 
 		 426 aa  536  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  62.32 
 
 		 429 aa  536  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  61.36 
 
 		 427 aa  521  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  60.74 
 
 		 422 aa  516  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  60.74 
 
 		 422 aa  515  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01292  NADH-quinone oxidoreductase, f subunit  59.85 
 
 		 444 aa  477  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.314011  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.87 
 
 		 446 aa  467  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0359658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0245  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.91 
 
 		 444 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0274  NADH dehydrogenase (quinone)  59.16 
 
 		 444 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3221  NADH dehydrogenase I subunit F  53.43 
 
 		 429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1882  NADH dehydrogenase I subunit F  52.47 
 
 		 441 aa  443  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2215  NADH dehydrogenase I subunit F  52.72 
 
 		 441 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0926  NADH dehydrogenase I subunit F  50.94 
 
 		 431 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4556  NADH dehydrogenase I subunit F  51.87 
 
 		 441 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1560  NADH dehydrogenase I subunit F  53.48 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  52.97 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0894  NADH dehydrogenase I subunit F  52.57 
 
 		 434 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  51.79 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1027  NADH dehydrogenase I subunit F  52.34 
 
 		 434 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.1 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3333  NADH dehydrogenase I subunit F  51.44 
 
 		 441 aa  433  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240845  normal  0.194232 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2518  NADH dehydrogenase I subunit F  50.96 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1180  NADH dehydrogenase I subunit F  50.96 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258408  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  50.71 
 
 		 428 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  53.75 
 
 		 433 aa  432  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.21 
 
 		 421 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2923  NADH dehydrogenase I subunit F  52.14 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0807  NADH dehydrogenase I subunit F  51.16 
 
 		 435 aa  429  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.662201  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2001  NADH dehydrogenase I subunit F  50.96 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0486  NADH dehydrogenase I subunit F  53.56 
 
 		 427 aa  429  1e-119  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1718  NADH dehydrogenase I subunit F  50.12 
 
 		 434 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2394  NADH dehydrogenase I subunit F  52.38 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.140128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0802  NADH dehydrogenase I subunit F  51.05 
 
 		 435 aa  430  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1357  NADH dehydrogenase I subunit F  50.59 
 
 		 434 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  54.3 
 
 		 436 aa  430  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4628  NADH dehydrogenase I subunit F  50.6 
 
 		 433 aa  428  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133099 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.66 
 
 		 456 aa  429  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1265  NADH dehydrogenase I subunit F  50.35 
 
 		 434 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4395  NADH dehydrogenase I subunit F  53.96 
 
 		 433 aa  428  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2160  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.32 
 
 		 443 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51 
 
 		 447 aa  428  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_002978  WD0976  NADH dehydrogenase I subunit F  51.81 
 
 		 417 aa  427  1e-118  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4131  NADH dehydrogenase I subunit F  53.22 
 
 		 433 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.519753  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.5 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.5 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2408  NADH dehydrogenase I subunit F  49.88 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0121136 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1360  NADH dehydrogenase I subunit F  53.49 
 
 		 437 aa  426  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315276  normal  0.0477199 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.5 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0783  NADH dehydrogenase I subunit F  49.77 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.860034  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2579  NADH dehydrogenase I subunit F  49.41 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2880  NADH dehydrogenase I subunit F  49.41 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.756344  normal  0.115348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>