More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0991 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  71.09 
 
 
425 aa  639    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  71.09 
 
 
425 aa  639    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  100 
 
 
425 aa  876    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  69.65 
 
 
426 aa  650    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  86.08 
 
 
426 aa  768    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  78.86 
 
 
429 aa  709    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.47 
 
 
425 aa  684    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  69.65 
 
 
427 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  67.06 
 
 
426 aa  608  1e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  67.3 
 
 
426 aa  600  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  69.29 
 
 
431 aa  591  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  69.04 
 
 
431 aa  590  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.98 
 
 
442 aa  590  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  67.46 
 
 
425 aa  589  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  69.04 
 
 
431 aa  589  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  64.05 
 
 
422 aa  585  1e-166  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0932  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  68.3 
 
 
431 aa  585  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5981  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  64.05 
 
 
422 aa  585  1e-166  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01292  NADH-quinone oxidoreductase, f subunit  65.24 
 
 
444 aa  578  1e-164  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.314011  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0966  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  68.3 
 
 
431 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3209  putative NADH dehydrogenase I (chain F), NuoF  67.32 
 
 
442 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489699  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  67.57 
 
 
442 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020872  hitchhiker  0.00762126 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1304  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.75 
 
 
436 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.75 
 
 
436 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.5 
 
 
436 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1295  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.5 
 
 
436 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.01 
 
 
436 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.121706  normal  0.072136 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  66.1 
 
 
436 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  66.1 
 
 
436 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1747  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  69.27 
 
 
439 aa  569  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.26 
 
 
436 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1135  NADH dehydrogenase I, F subunit  66.1 
 
 
436 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305748  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1632  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.01 
 
 
436 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0418  NADH dehydrogenase I, F subunit  66.1 
 
 
436 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2282  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.26 
 
 
436 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.502286  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2244  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.01 
 
 
436 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.1 
 
 
440 aa  571  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.42 
 
 
442 aa  569  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1033  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.99 
 
 
436 aa  565  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.970624  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5175  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.02 
 
 
452 aa  565  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82972  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2056  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  62.38 
 
 
441 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.57 
 
 
446 aa  563  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0359658  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0274  NADH dehydrogenase (quinone)  62.97 
 
 
444 aa  558  1e-158  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0245  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  62.97 
 
 
444 aa  558  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.01 
 
 
432 aa  551  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.725894  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  64.85 
 
 
467 aa  553  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3505  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.25 
 
 
446 aa  553  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.3 
 
 
452 aa  551  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1046  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.76 
 
 
432 aa  549  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.53 
 
 
427 aa  548  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.53 
 
 
427 aa  548  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1408  NADH dehydrogenase (quinone)  66.34 
 
 
448 aa  551  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344302  normal  0.160337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.48 
 
 
458 aa  546  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  64.36 
 
 
452 aa  543  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0877  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  64.22 
 
 
453 aa  542  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0962  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.97 
 
 
453 aa  541  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089517 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1506  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.91 
 
 
452 aa  533  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00816775 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1429  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  64.56 
 
 
473 aa  533  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.332144  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.29 
 
 
424 aa  474  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_002978  WD0976  NADH dehydrogenase I subunit F  56.05 
 
 
417 aa  466  9.999999999999999e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3221  NADH dehydrogenase I subunit F  54.37 
 
 
429 aa  459  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1882  NADH dehydrogenase I subunit F  54.7 
 
 
441 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  54.7 
 
 
432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4556  NADH dehydrogenase I subunit F  54.46 
 
 
441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0926  NADH dehydrogenase I subunit F  53.44 
 
 
431 aa  450  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  53.3 
 
 
433 aa  450  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2215  NADH dehydrogenase I subunit F  53.98 
 
 
441 aa  448  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.93 
 
 
444 aa  450  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3333  NADH dehydrogenase I subunit F  54.24 
 
 
441 aa  451  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240845  normal  0.194232 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  55.5 
 
 
438 aa  447  1.0000000000000001e-124  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1560  NADH dehydrogenase I subunit F  54.25 
 
 
429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  53.03 
 
 
428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0548  NADH dehydrogenase I subunit F  54.59 
 
 
427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  53.14 
 
 
430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.88 
 
 
433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0894  NADH dehydrogenase I subunit F  54.98 
 
 
434 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13206  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0486  NADH dehydrogenase I subunit F  54.41 
 
 
427 aa  444  1e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2923  NADH dehydrogenase I subunit F  53.62 
 
 
436 aa  441  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0714  NADH dehydrogenase I subunit F  53.41 
 
 
413 aa  440  9.999999999999999e-123  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.657968  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1027  NADH dehydrogenase I subunit F  54.46 
 
 
434 aa  441  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.6 
 
 
448 aa  439  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  53.75 
 
 
449 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4395  NADH dehydrogenase I subunit F  53.72 
 
 
433 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43184  predicted protein  52.42 
 
 
449 aa  437  1e-121  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.236516  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_004310  BR0807  NADH dehydrogenase I subunit F  56.91 
 
 
435 aa  437  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.662201  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2518  NADH dehydrogenase I subunit F  50.59 
 
 
431 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.75 
 
 
447 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1180  NADH dehydrogenase I subunit F  50.59 
 
 
431 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258408  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1179  NADH dehydrogenase I subunit F  55.44 
 
 
431 aa  435  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.049393  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2394  NADH dehydrogenase I subunit F  53.14 
 
 
436 aa  437  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.140128  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4131  NADH dehydrogenase I subunit F  53.12 
 
 
433 aa  438  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.519753  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0802  NADH dehydrogenase I subunit F  56.33 
 
 
435 aa  438  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2418  NADH dehydrogenase I subunit F  55.81 
 
 
435 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0783  NADH dehydrogenase I subunit F  52.3 
 
 
435 aa  433  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.860034  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2001  NADH dehydrogenase I subunit F  50.6 
 
 
431 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1718  NADH dehydrogenase I subunit F  52.18 
 
 
434 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1360  NADH dehydrogenase I subunit F  53.48 
 
 
437 aa  433  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315276  normal  0.0477199 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2243  NADH dehydrogenase I subunit F  53.91 
 
 
431 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0486512  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1265  NADH dehydrogenase I subunit F  51.45 
 
 
434 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.11 
 
 
438 aa  429  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>