More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1408 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  78.32 
 
 
442 aa  701    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1304  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  78.89 
 
 
436 aa  710    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1046  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  78.32 
 
 
432 aa  679    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  77.47 
 
 
431 aa  707    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  78.65 
 
 
436 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  78.65 
 
 
436 aa  709    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  71.79 
 
 
442 aa  643    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0966  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.7 
 
 
431 aa  685    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  74.57 
 
 
426 aa  637    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  78.89 
 
 
436 aa  710    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.93 
 
 
431 aa  709    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.93 
 
 
431 aa  709    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  78.19 
 
 
442 aa  700    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020872  hitchhiker  0.00762126 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  78.65 
 
 
436 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0418  NADH dehydrogenase I, F subunit  78.65 
 
 
436 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.47 
 
 
425 aa  668    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  78.42 
 
 
436 aa  708    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1408  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
448 aa  929    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344302  normal  0.160337 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0877  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  84.49 
 
 
453 aa  758    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  81.42 
 
 
458 aa  748    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3505  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  83.37 
 
 
446 aa  746    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  82.56 
 
 
452 aa  738    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  84.93 
 
 
467 aa  778    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3209  putative NADH dehydrogenase I (chain F), NuoF  78.19 
 
 
442 aa  703    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489699  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1295  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  78.65 
 
 
436 aa  707    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0932  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.88 
 
 
431 aa  709    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5981  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1632  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  78.42 
 
 
436 aa  711    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1033  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  78.89 
 
 
436 aa  694    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.970624  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2282  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  78.65 
 
 
436 aa  712    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.502286  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2244  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  78.42 
 
 
436 aa  711    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  78.65 
 
 
436 aa  712    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.121706  normal  0.072136 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1506  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  88.25 
 
 
452 aa  778    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00816775 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5175  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  83.79 
 
 
452 aa  742    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82972  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  78.55 
 
 
432 aa  679    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.725894  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  78.89 
 
 
440 aa  714    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  86.3 
 
 
452 aa  761    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1429  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  82.62 
 
 
473 aa  737    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.332144  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0962  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  84.27 
 
 
453 aa  757    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089517 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1135  NADH dehydrogenase I, F subunit  78.65 
 
 
436 aa  709    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305748  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1747  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  73.88 
 
 
439 aa  617  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2056  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.34 
 
 
441 aa  570  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  67.41 
 
 
426 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.34 
 
 
425 aa  559  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  64.63 
 
 
427 aa  554  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  64.63 
 
 
427 aa  554  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  65.38 
 
 
425 aa  550  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  65.38 
 
 
425 aa  550  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  64.49 
 
 
426 aa  551  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.45 
 
 
427 aa  544  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.53 
 
 
425 aa  544  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.14 
 
 
429 aa  540  9.999999999999999e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  60.05 
 
 
422 aa  528  1e-149  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  60.05 
 
 
422 aa  528  1e-149  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.88 
 
 
426 aa  521  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01292  NADH-quinone oxidoreductase, f subunit  59.01 
 
 
444 aa  480  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.314011  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.27 
 
 
446 aa  475  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0359658  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0245  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.48 
 
 
444 aa  473  1e-132  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0274  NADH dehydrogenase (quinone)  58.48 
 
 
444 aa  472  1e-132  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.18 
 
 
424 aa  444  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3221  NADH dehydrogenase I subunit F  52.91 
 
 
429 aa  440  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.7 
 
 
456 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.36 
 
 
433 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1882  NADH dehydrogenase I subunit F  51.68 
 
 
441 aa  428  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0894  NADH dehydrogenase I subunit F  53.17 
 
 
434 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13206  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0926  NADH dehydrogenase I subunit F  52.37 
 
 
431 aa  426  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2215  NADH dehydrogenase I subunit F  51.68 
 
 
441 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4083  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.76 
 
 
446 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.323862  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.43 
 
 
421 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0486  NADH dehydrogenase I subunit F  53.19 
 
 
427 aa  424  1e-117  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4556  NADH dehydrogenase I subunit F  51.7 
 
 
441 aa  425  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4077  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.12 
 
 
454 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1560  NADH dehydrogenase I subunit F  53.03 
 
 
429 aa  425  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.57 
 
 
441 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.57 
 
 
441 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1377  NADH dehydrogenase I chain F  52.4 
 
 
448 aa  423  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0721979  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.57 
 
 
441 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  50.24 
 
 
424 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  50.85 
 
 
432 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.73 
 
 
442 aa  420  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  53.98 
 
 
436 aa  420  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.24 
 
 
443 aa  420  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  50.74 
 
 
428 aa  421  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3333  NADH dehydrogenase I subunit F  52.24 
 
 
441 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240845  normal  0.194232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1311  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.58 
 
 
439 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.58 
 
 
434 aa  421  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1265  NADH dehydrogenase I subunit F  50.73 
 
 
434 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0976  NADH dehydrogenase I subunit F  52.2 
 
 
417 aa  415  9.999999999999999e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0807  NADH dehydrogenase I subunit F  51.69 
 
 
435 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.662201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0802  NADH dehydrogenase I subunit F  51.69 
 
 
435 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2518  NADH dehydrogenase I subunit F  50.98 
 
 
431 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1180  NADH dehydrogenase I subunit F  50.98 
 
 
431 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258408  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1357  NADH dehydrogenase I subunit F  50.97 
 
 
434 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  50.12 
 
 
430 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1027  NADH dehydrogenase I subunit F  52.96 
 
 
434 aa  418  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1360  NADH dehydrogenase I subunit F  51.44 
 
 
437 aa  417  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315276  normal  0.0477199 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2243  NADH dehydrogenase I subunit F  51.47 
 
 
431 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0486512  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2923  NADH dehydrogenase I subunit F  50.49 
 
 
436 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.75 
 
 
447 aa  413  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0548  NADH dehydrogenase I subunit F  52.63 
 
 
427 aa  415  1e-114  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0525  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.88 
 
 
440 aa  412  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>