More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1147 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1304  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.74 
 
 		 436 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  73.53 
 
 		 431 aa  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.74 
 
 		 436 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.121706  normal  0.072136 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  75.5 
 
 		 436 aa  655    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.75 
 
 		 442 aa  654    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020872  hitchhiker  0.00762126 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.06 
 
 		 442 aa  670    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1747  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  78.97 
 
 		 439 aa  662    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  100 
 
 		 426 aa  884    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  75.5 
 
 		 436 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.74 
 
 		 436 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.74 
 
 		 436 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.99 
 
 		 440 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.26 
 
 		 425 aa  659    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  73.77 
 
 		 431 aa  647    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.99 
 
 		 436 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3209  putative NADH dehydrogenase I (chain F), NuoF  74.51 
 
 		 442 aa  654    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0932  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.26 
 
 		 431 aa  648    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  73.53 
 
 		 431 aa  645    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1632  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.99 
 
 		 436 aa  656    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0418  NADH dehydrogenase I, F subunit  75.5 
 
 		 436 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2282  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.74 
 
 		 436 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.502286  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2244  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.99 
 
 		 436 aa  656    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1135  NADH dehydrogenase I, F subunit  75.5 
 
 		 436 aa  655    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305748  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1295  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.5 
 
 		 436 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.75 
 
 		 442 aa  651    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1033  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  76.49 
 
 		 436 aa  642    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.970624  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2056  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  71.46 
 
 		 441 aa  634  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.18 
 
 		 432 aa  634  1e-180  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.725894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0966  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  73.76 
 
 		 431 aa  630  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1046  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.18 
 
 		 432 aa  630  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  73.02 
 
 		 467 aa  629  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  70.64 
 
 		 426 aa  618  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1408  NADH dehydrogenase (quinone)  74.57 
 
 		 448 aa  619  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344302  normal  0.160337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3505  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.31 
 
 		 446 aa  616  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0877  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75 
 
 		 453 aa  609  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5175  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  73.27 
 
 		 452 aa  609  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0962  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.75 
 
 		 453 aa  608  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089517 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  70.19 
 
 		 458 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1429  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  71.57 
 
 		 473 aa  601  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.332144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  72.14 
 
 		 452 aa  598  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  67.3 
 
 		 425 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  72.84 
 
 		 452 aa  600  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  69.62 
 
 		 427 aa  596  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  67.54 
 
 		 425 aa  593  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1506  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  72.55 
 
 		 452 aa  587  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00816775 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  68.66 
 
 		 425 aa  584  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  68.66 
 
 		 425 aa  584  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.32 
 
 		 429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.87 
 
 		 426 aa  580  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.61 
 
 		 427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.61 
 
 		 427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.75 
 
 		 426 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  61.67 
 
 		 422 aa  559  1e-158  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  61.67 
 
 		 422 aa  559  1e-158  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01292  NADH-quinone oxidoreductase, f subunit  59.1 
 
 		 444 aa  501  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.314011  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.92 
 
 		 446 aa  489  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0359658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0274  NADH dehydrogenase (quinone)  59.1 
 
 		 444 aa  491  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0245  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.87 
 
 		 444 aa  489  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.82 
 
 		 441 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.82 
 
 		 441 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.82 
 
 		 441 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.25 
 
 		 424 aa  450  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.11 
 
 		 441 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.34 
 
 		 421 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0976  NADH dehydrogenase I subunit F  56.22 
 
 		 417 aa  436  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3221  NADH dehydrogenase I subunit F  56.17 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1560  NADH dehydrogenase I subunit F  57.07 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0486  NADH dehydrogenase I subunit F  55.53 
 
 		 427 aa  431  1e-120  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.49 
 
 		 456 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0926  NADH dehydrogenase I subunit F  53.5 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  55.38 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  52.97 
 
 		 428 aa  431  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1882  NADH dehydrogenase I subunit F  53.19 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2215  NADH dehydrogenase I subunit F  53.43 
 
 		 441 aa  428  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0894  NADH dehydrogenase I subunit F  53.35 
 
 		 434 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0548  NADH dehydrogenase I subunit F  55.32 
 
 		 427 aa  425  1e-117  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  51.84 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1027  NADH dehydrogenase I subunit F  53.47 
 
 		 434 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1377  NADH dehydrogenase I chain F  51.46 
 
 		 448 aa  422  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0721979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43184  predicted protein  54.62 
 
 		 449 aa  422  1e-117  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.236516  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4556  NADH dehydrogenase I subunit F  54.74 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2160  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.74 
 
 		 443 aa  421  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4077  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.04 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  54.45 
 
 		 433 aa  420  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3333  NADH dehydrogenase I subunit F  52.62 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240845  normal  0.194232 
 
 
-
 
NC_004310  BR0807  NADH dehydrogenase I subunit F  52.72 
 
 		 435 aa  418  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.662201  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1180  NADH dehydrogenase I subunit F  50.37 
 
 		 431 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258408  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2518  NADH dehydrogenase I subunit F  50.37 
 
 		 431 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.11 
 
 		 449 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4083  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.98 
 
 		 446 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.323862  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.86 
 
 		 434 aa  417  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0802  NADH dehydrogenase I subunit F  52.72 
 
 		 435 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.36 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2001  NADH dehydrogenase I subunit F  50.62 
 
 		 431 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0633  NADH dehydrogenase (quinone)  51.72 
 
 		 427 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1628  NADH dehydrogenase (quinone)  51.72 
 
 		 427 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3188  NADH dehydrogenase (quinone)  51.72 
 
 		 427 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2243  NADH dehydrogenase I subunit F  53.54 
 
 		 431 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0486512  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4395  NADH dehydrogenase I subunit F  55.94 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  52.84 
 
 		 438 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>