More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0274 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0245  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  99.77 
 
 
444 aa  922    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0274  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
444 aa  924    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  88.29 
 
 
446 aa  822    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0359658  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01292  NADH-quinone oxidoreductase, f subunit  89.41 
 
 
444 aa  839    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.314011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.56 
 
 
425 aa  584  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.92 
 
 
426 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  62.97 
 
 
425 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  61.61 
 
 
429 aa  551  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  62.03 
 
 
426 aa  554  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  63.1 
 
 
422 aa  549  1e-155  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  63.1 
 
 
422 aa  550  1e-155  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  61.43 
 
 
425 aa  546  1e-154  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  61.43 
 
 
425 aa  546  1e-154  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  61.9 
 
 
427 aa  531  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.95 
 
 
431 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.95 
 
 
431 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0932  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.71 
 
 
431 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5981  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.87 
 
 
427 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  59.71 
 
 
431 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.87 
 
 
427 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.88 
 
 
442 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3209  putative NADH dehydrogenase I (chain F), NuoF  59.46 
 
 
442 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489699  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.46 
 
 
442 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020872  hitchhiker  0.00762126 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  59.1 
 
 
426 aa  502  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.55 
 
 
425 aa  502  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.88 
 
 
440 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1135  NADH dehydrogenase I, F subunit  57.97 
 
 
436 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  57.97 
 
 
436 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  57.97 
 
 
436 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.97 
 
 
436 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.121706  normal  0.072136 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.72 
 
 
436 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0418  NADH dehydrogenase I, F subunit  57.97 
 
 
436 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.97 
 
 
436 aa  501  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1304  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.72 
 
 
436 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.97 
 
 
436 aa  500  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1632  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.72 
 
 
436 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1295  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.72 
 
 
436 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2282  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.97 
 
 
436 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.502286  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2244  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.72 
 
 
436 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.18 
 
 
442 aa  495  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0966  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.46 
 
 
431 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1033  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.71 
 
 
436 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.970624  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2056  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  56.16 
 
 
441 aa  488  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.91 
 
 
467 aa  479  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.18 
 
 
426 aa  475  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1408  NADH dehydrogenase (quinone)  58.48 
 
 
448 aa  473  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344302  normal  0.160337 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.07 
 
 
432 aa  474  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.725894  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.91 
 
 
452 aa  474  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3505  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59 
 
 
446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  56.8 
 
 
458 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.17 
 
 
452 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1046  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  56.59 
 
 
432 aa  467  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0877  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.9 
 
 
453 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0962  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.65 
 
 
453 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5175  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.16 
 
 
452 aa  463  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82972  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1747  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.73 
 
 
439 aa  464  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1429  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.89 
 
 
473 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.332144  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1506  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.15 
 
 
452 aa  449  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00816775 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1560  NADH dehydrogenase I subunit F  51.32 
 
 
429 aa  418  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0486  NADH dehydrogenase I subunit F  51.69 
 
 
427 aa  416  9.999999999999999e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  49.88 
 
 
433 aa  418  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  50.48 
 
 
432 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_002978  WD0976  NADH dehydrogenase I subunit F  50 
 
 
417 aa  412  1e-114  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2518  NADH dehydrogenase I subunit F  49.64 
 
 
431 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3221  NADH dehydrogenase I subunit F  50.36 
 
 
429 aa  415  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1180  NADH dehydrogenase I subunit F  49.64 
 
 
431 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258408  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1718  NADH dehydrogenase I subunit F  51.67 
 
 
434 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  49.17 
 
 
428 aa  413  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0548  NADH dehydrogenase I subunit F  52.81 
 
 
427 aa  413  1e-114  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1027  NADH dehydrogenase I subunit F  51.2 
 
 
434 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2243  NADH dehydrogenase I subunit F  51.2 
 
 
431 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0486512  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1179  NADH dehydrogenase I subunit F  52.77 
 
 
431 aa  410  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.049393  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3333  NADH dehydrogenase I subunit F  50.24 
 
 
441 aa  411  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240845  normal  0.194232 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0894  NADH dehydrogenase I subunit F  51.09 
 
 
434 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13206  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2001  NADH dehydrogenase I subunit F  52.38 
 
 
431 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0807  NADH dehydrogenase I subunit F  51.82 
 
 
435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.662201  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1265  NADH dehydrogenase I subunit F  49.76 
 
 
434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1357  NADH dehydrogenase I subunit F  50 
 
 
434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0802  NADH dehydrogenase I subunit F  51.82 
 
 
435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0783  NADH dehydrogenase I subunit F  50.36 
 
 
435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.860034  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0748  NADH dehydrogenase I subunit F  52.88 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147388  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.75 
 
 
441 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.75 
 
 
441 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  49.76 
 
 
430 aa  404  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.75 
 
 
441 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4556  NADH dehydrogenase I subunit F  50 
 
 
441 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0926  NADH dehydrogenase I subunit F  49.07 
 
 
431 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2418  NADH dehydrogenase I subunit F  50.61 
 
 
435 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.5 
 
 
434 aa  398  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.37 
 
 
421 aa  401  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.82 
 
 
424 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.14 
 
 
433 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43944  predicted protein  48.67 
 
 
493 aa  398  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323695  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.98 
 
 
443 aa  395  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2408  NADH dehydrogenase I subunit F  49.3 
 
 
441 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0121136 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2215  NADH dehydrogenase I subunit F  49.28 
 
 
441 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1014  NADH dehydrogenase I subunit F  50.85 
 
 
433 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.09 
 
 
456 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1209  NADH dehydrogenase I subunit F  50.85 
 
 
433 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335616  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2055  NADH dehydrogenase I subunit F  50.36 
 
 
433 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517668  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>