More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0418 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1033  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  97.19 
 
 
436 aa  849    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.970624  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1295  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  99.31 
 
 
436 aa  898    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  97.19 
 
 
436 aa  869    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.121706  normal  0.072136 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  88.52 
 
 
431 aa  806    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  100 
 
 
436 aa  903    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  94.61 
 
 
442 aa  842    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020872  hitchhiker  0.00762126 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  73.57 
 
 
442 aa  666    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0966  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  89.7 
 
 
431 aa  795    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  75.5 
 
 
426 aa  655    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0418  NADH dehydrogenase I, F subunit  100 
 
 
436 aa  903    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  99.54 
 
 
436 aa  900    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0877  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.28 
 
 
453 aa  675    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  89.46 
 
 
431 aa  812    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  97.42 
 
 
436 aa  870    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  83.1 
 
 
432 aa  732    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.725894  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.42 
 
 
452 aa  659    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1304  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  99.54 
 
 
436 aa  900    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5175  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.18 
 
 
452 aa  669    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82972  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  76.13 
 
 
425 aa  686    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  99.08 
 
 
436 aa  898    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1506  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.21 
 
 
452 aa  654    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00816775 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3505  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  78.55 
 
 
446 aa  674    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.2 
 
 
458 aa  669    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1747  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.46 
 
 
439 aa  657    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  76.76 
 
 
467 aa  690    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3209  putative NADH dehydrogenase I (chain F), NuoF  94.38 
 
 
442 aa  841    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489699  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  95.36 
 
 
442 aa  855    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1408  NADH dehydrogenase (quinone)  78.65 
 
 
448 aa  694    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344302  normal  0.160337 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  100 
 
 
436 aa  903    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0932  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  91.1 
 
 
431 aa  820    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5981  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1632  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  97.19 
 
 
436 aa  869    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  97.22 
 
 
440 aa  876    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2282  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  96.96 
 
 
436 aa  867    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.502286  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2244  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  97.19 
 
 
436 aa  869    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1046  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  81.92 
 
 
432 aa  726    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  89.23 
 
 
431 aa  810    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.82 
 
 
452 aa  660    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1429  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.33 
 
 
473 aa  663    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.332144  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0962  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.05 
 
 
453 aa  674    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089517 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1135  NADH dehydrogenase I, F subunit  100 
 
 
436 aa  903    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305748  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2056  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.58 
 
 
441 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  68.06 
 
 
427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.1 
 
 
425 aa  571  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.85 
 
 
425 aa  567  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.28 
 
 
426 aa  557  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  65.44 
 
 
425 aa  557  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  65.44 
 
 
425 aa  557  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.08 
 
 
429 aa  554  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  62.32 
 
 
422 aa  553  1e-156  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  62.32 
 
 
422 aa  554  1e-156  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  60.33 
 
 
427 aa  551  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  60.33 
 
 
427 aa  551  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  64.11 
 
 
426 aa  549  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  61.04 
 
 
426 aa  538  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.69 
 
 
446 aa  495  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0359658  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01292  NADH-quinone oxidoreductase, f subunit  58.48 
 
 
444 aa  496  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.314011  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0274  NADH dehydrogenase (quinone)  57.97 
 
 
444 aa  488  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0245  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.97 
 
 
444 aa  488  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57 
 
 
424 aa  435  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.2 
 
 
421 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.8 
 
 
441 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.49 
 
 
441 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.8 
 
 
441 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.03 
 
 
441 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3221  NADH dehydrogenase I subunit F  50.61 
 
 
429 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0926  NADH dehydrogenase I subunit F  50.73 
 
 
431 aa  412  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.33 
 
 
433 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.39 
 
 
456 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  52.09 
 
 
436 aa  411  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4556  NADH dehydrogenase I subunit F  49.28 
 
 
441 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0894  NADH dehydrogenase I subunit F  51.87 
 
 
434 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13206  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3224  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.26 
 
 
439 aa  409  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  50.25 
 
 
432 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4077  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.79 
 
 
454 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.03 
 
 
439 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0486  NADH dehydrogenase I subunit F  50.37 
 
 
427 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1882  NADH dehydrogenase I subunit F  49.88 
 
 
441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1560  NADH dehydrogenase I subunit F  50 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.87 
 
 
443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2215  NADH dehydrogenase I subunit F  49.88 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1377  NADH dehydrogenase I chain F  49.88 
 
 
448 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0721979  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  48.41 
 
 
449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_002978  WD0976  NADH dehydrogenase I subunit F  51.15 
 
 
417 aa  402  1e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3333  NADH dehydrogenase I subunit F  50.12 
 
 
441 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240845  normal  0.194232 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.36 
 
 
448 aa  404  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.61 
 
 
447 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  49.63 
 
 
428 aa  402  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  48.67 
 
 
428 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0633  NADH dehydrogenase (quinone)  49.64 
 
 
427 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1628  NADH dehydrogenase (quinone)  49.64 
 
 
427 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3188  NADH dehydrogenase (quinone)  49.64 
 
 
427 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6677  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.25 
 
 
431 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0783  NADH dehydrogenase I subunit F  49.63 
 
 
435 aa  402  1e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.860034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7686  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.13 
 
 
441 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  48.04 
 
 
424 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  47.85 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2518  NADH dehydrogenase I subunit F  48.65 
 
 
431 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0714  NADH dehydrogenase I subunit F  49.87 
 
 
413 aa  400  9.999999999999999e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.657968  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0548  NADH dehydrogenase I subunit F  50.38 
 
 
427 aa  401  9.999999999999999e-111  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  51.02 
 
 
433 aa  399  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>