More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1498 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.89 
 
 		 436 aa  690    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.121706  normal  0.072136 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  74.2 
 
 		 436 aa  684    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1295  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.2 
 
 		 436 aa  682    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0877  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  83.03 
 
 		 453 aa  756    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3505  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  81 
 
 		 446 aa  753    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  74.43 
 
 		 431 aa  694    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  74.2 
 
 		 436 aa  684    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.66 
 
 		 431 aa  694    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1304  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.43 
 
 		 436 aa  685    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0966  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.66 
 
 		 431 aa  673    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.43 
 
 		 436 aa  685    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1033  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.11 
 
 		 436 aa  672    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.970624  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0418  NADH dehydrogenase I, F subunit  74.2 
 
 		 436 aa  684    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  73.97 
 
 		 442 aa  679    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.37 
 
 		 432 aa  657    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.725894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.89 
 
 		 436 aa  690    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1408  NADH dehydrogenase (quinone)  81.42 
 
 		 448 aa  748    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344302  normal  0.160337 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  72.86 
 
 		 425 aa  655    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.43 
 
 		 436 aa  684    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.66 
 
 		 431 aa  693    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  100 
 
 		 458 aa  954    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  83.3 
 
 		 467 aa  793    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3209  putative NADH dehydrogenase I (chain F), NuoF  74.2 
 
 		 442 aa  681    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1506  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  81.28 
 
 		 452 aa  728    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00816775 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0932  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  73.92 
 
 		 431 aa  688    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  80.77 
 
 		 452 aa  760    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1632  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.66 
 
 		 436 aa  689    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.11 
 
 		 440 aa  690    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  73.97 
 
 		 442 aa  678    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020872  hitchhiker  0.00762126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5175  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  79.73 
 
 		 452 aa  740    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1046  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.14 
 
 		 432 aa  654    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2282  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.89 
 
 		 436 aa  689    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.502286  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2244  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.66 
 
 		 436 aa  689    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  82.41 
 
 		 452 aa  761    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1429  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  82.74 
 
 		 473 aa  766    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.332144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0962  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  82.81 
 
 		 453 aa  755    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089517 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1135  NADH dehydrogenase I, F subunit  74.2 
 
 		 436 aa  684    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  68.13 
 
 		 442 aa  626  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  70.19 
 
 		 426 aa  619  1e-176  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1747  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  71.67 
 
 		 439 aa  610  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2056  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.94 
 
 		 441 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.48 
 
 		 425 aa  555  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  62.3 
 
 		 426 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  62.83 
 
 		 427 aa  554  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  62.83 
 
 		 427 aa  554  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  62.53 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  64.35 
 
 		 425 aa  550  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  64.35 
 
 		 425 aa  550  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.04 
 
 		 426 aa  550  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  61.96 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  61.9 
 
 		 425 aa  541  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  59.81 
 
 		 422 aa  530  1e-149  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  59.81 
 
 		 422 aa  530  1e-149  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.99 
 
 		 426 aa  510  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01292  NADH-quinone oxidoreductase, f subunit  56.18 
 
 		 444 aa  476  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.314011  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.94 
 
 		 446 aa  474  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0359658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0274  NADH dehydrogenase (quinone)  56.8 
 
 		 444 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0245  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  56.56 
 
 		 444 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.96 
 
 		 424 aa  445  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.51 
 
 		 421 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1560  NADH dehydrogenase I subunit F  52.57 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.37 
 
 		 441 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.37 
 
 		 441 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.37 
 
 		 441 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3221  NADH dehydrogenase I subunit F  52.1 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0894  NADH dehydrogenase I subunit F  51.85 
 
 		 434 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1882  NADH dehydrogenase I subunit F  50.58 
 
 		 441 aa  428  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2215  NADH dehydrogenase I subunit F  51.05 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.09 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4556  NADH dehydrogenase I subunit F  50.58 
 
 		 441 aa  428  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.6 
 
 		 456 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0926  NADH dehydrogenase I subunit F  49.41 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  54.03 
 
 		 436 aa  422  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3333  NADH dehydrogenase I subunit F  49.88 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240845  normal  0.194232 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0486  NADH dehydrogenase I subunit F  52.76 
 
 		 427 aa  424  1e-117  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  54.71 
 
 		 433 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  49.18 
 
 		 432 aa  425  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4077  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.29 
 
 		 454 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  48.83 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.12 
 
 		 434 aa  424  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.51 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1357  NADH dehydrogenase I subunit F  50 
 
 		 434 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.44 
 
 		 439 aa  421  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  48.71 
 
 		 424 aa  418  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.75 
 
 		 443 aa  420  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  49.06 
 
 		 428 aa  421  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4083  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.88 
 
 		 446 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.323862  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.64 
 
 		 442 aa  418  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1027  NADH dehydrogenase I subunit F  54.97 
 
 		 434 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1377  NADH dehydrogenase I chain F  51.29 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0721979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2160  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.8 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1265  NADH dehydrogenase I subunit F  49.77 
 
 		 434 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1180  NADH dehydrogenase I subunit F  50.12 
 
 		 431 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258408  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0548  NADH dehydrogenase I subunit F  51.52 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1179  NADH dehydrogenase I subunit F  53.51 
 
 		 431 aa  415  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.049393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0802  NADH dehydrogenase I subunit F  51.84 
 
 		 435 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0633  NADH dehydrogenase (quinone)  51.2 
 
 		 427 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1628  NADH dehydrogenase (quinone)  51.2 
 
 		 427 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3188  NADH dehydrogenase (quinone)  51.2 
 
 		 427 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.46 
 
 		 433 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>