More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2160 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2160  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  100 
 
 
443 aa  915    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.24 
 
 
427 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.24 
 
 
427 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.81 
 
 
425 aa  457  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.85 
 
 
426 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.18 
 
 
441 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.18 
 
 
441 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.18 
 
 
441 aa  438  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.9 
 
 
425 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.81 
 
 
441 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.27 
 
 
467 aa  435  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  51.48 
 
 
422 aa  432  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.54 
 
 
442 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  52.74 
 
 
426 aa  434  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.64 
 
 
429 aa  434  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  51.48 
 
 
422 aa  431  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5175  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.32 
 
 
452 aa  431  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82972  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3505  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.45 
 
 
446 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.94 
 
 
452 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0486  NADH dehydrogenase I subunit F  51.61 
 
 
427 aa  426  1e-118  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.36 
 
 
421 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.8 
 
 
458 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0962  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.5 
 
 
453 aa  427  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089517 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.64 
 
 
425 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0877  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.75 
 
 
453 aa  428  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  51 
 
 
425 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  51 
 
 
425 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.27 
 
 
427 aa  422  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.75 
 
 
452 aa  422  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.49 
 
 
444 aa  424  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.63 
 
 
447 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  50.12 
 
 
431 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.64 
 
 
426 aa  420  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.35 
 
 
431 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.35 
 
 
431 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1408  NADH dehydrogenase (quinone)  53.25 
 
 
448 aa  421  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344302  normal  0.160337 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0633  NADH dehydrogenase (quinone)  50.25 
 
 
427 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1628  NADH dehydrogenase (quinone)  50.25 
 
 
427 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3188  NADH dehydrogenase (quinone)  50.25 
 
 
427 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3221  NADH dehydrogenase I subunit F  50.5 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1747  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.21 
 
 
439 aa  416  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.77 
 
 
436 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  51.76 
 
 
438 aa  418  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.69 
 
 
443 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0548  NADH dehydrogenase I subunit F  50.62 
 
 
427 aa  418  9.999999999999999e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0932  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.86 
 
 
431 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5981  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0748  NADH dehydrogenase I subunit F  54.11 
 
 
432 aa  418  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147388  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1632  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.02 
 
 
436 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2244  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.02 
 
 
436 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43184  predicted protein  54.28 
 
 
449 aa  416  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.236516  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2243  NADH dehydrogenase I subunit F  52.66 
 
 
431 aa  418  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0486512  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1180  NADH dehydrogenase I subunit F  49.13 
 
 
431 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258408  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_002978  WD0976  NADH dehydrogenase I subunit F  51.25 
 
 
417 aa  413  1e-114  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2001  NADH dehydrogenase I subunit F  47.72 
 
 
431 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.52 
 
 
436 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.121706  normal  0.072136 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  51.26 
 
 
436 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.13 
 
 
448 aa  414  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0966  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.82 
 
 
431 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.52 
 
 
436 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.5 
 
 
433 aa  413  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2518  NADH dehydrogenase I subunit F  49.13 
 
 
431 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.52 
 
 
440 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1135  NADH dehydrogenase I, F subunit  51.26 
 
 
436 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.52 
 
 
436 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  50.37 
 
 
424 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0418  NADH dehydrogenase I, F subunit  51.26 
 
 
436 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2056  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.76 
 
 
441 aa  412  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3209  putative NADH dehydrogenase I (chain F), NuoF  50.6 
 
 
442 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489699  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  50.12 
 
 
430 aa  412  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1304  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.52 
 
 
436 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1295  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.52 
 
 
436 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2282  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.26 
 
 
436 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.502286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  51.26 
 
 
436 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  50.12 
 
 
432 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  52.25 
 
 
433 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.12 
 
 
438 aa  411  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.36 
 
 
442 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020872  hitchhiker  0.00762126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4556  NADH dehydrogenase I subunit F  53.99 
 
 
441 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  52.13 
 
 
428 aa  411  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0714  NADH dehydrogenase I subunit F  50.12 
 
 
413 aa  409  1e-113  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.657968  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3333  NADH dehydrogenase I subunit F  49.63 
 
 
441 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240845  normal  0.194232 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1429  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.15 
 
 
473 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.332144  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.06 
 
 
442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0894  NADH dehydrogenase I subunit F  50.75 
 
 
434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13206  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0783  NADH dehydrogenase I subunit F  49.37 
 
 
435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.860034  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2055  NADH dehydrogenase I subunit F  49.63 
 
 
433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517668  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1033  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.77 
 
 
436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.970624  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2923  NADH dehydrogenase I subunit F  51.76 
 
 
436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1179  NADH dehydrogenase I subunit F  51.99 
 
 
431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.049393  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43944  predicted protein  49.5 
 
 
493 aa  407  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323695  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1027  NADH dehydrogenase I subunit F  52.14 
 
 
434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1046  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.12 
 
 
432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4077  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.01 
 
 
454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.86 
 
 
424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1718  NADH dehydrogenase I subunit F  50.25 
 
 
434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0802  NADH dehydrogenase I subunit F  50.75 
 
 
435 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0807  NADH dehydrogenase I subunit F  50.75 
 
 
435 aa  403  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.662201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01292  NADH-quinone oxidoreductase, f subunit  50.25 
 
 
444 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.314011  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2408  NADH dehydrogenase I subunit F  52.66 
 
 
441 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0121136 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.66 
 
 
434 aa  402  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>