More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0932 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1046  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  81.35 
 
 		 432 aa  711    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1408  NADH dehydrogenase (quinone)  77.88 
 
 		 448 aa  689    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344302  normal  0.160337 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  93.26 
 
 		 431 aa  847    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  91.1 
 
 		 436 aa  820    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.76 
 
 		 452 aa  658    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  76.48 
 
 		 442 aa  689    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  93.95 
 
 		 431 aa  850    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0966  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  95.58 
 
 		 431 aa  844    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  74.26 
 
 		 426 aa  648    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  94.19 
 
 		 431 aa  852    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  91.33 
 
 		 436 aa  821    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1747  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.27 
 
 		 439 aa  653    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1304  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  91.33 
 
 		 436 aa  821    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5175  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.29 
 
 		 452 aa  656    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  90.63 
 
 		 436 aa  820    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  90.4 
 
 		 436 aa  819    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.121706  normal  0.072136 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  89.46 
 
 		 442 aa  811    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020872  hitchhiker  0.00762126 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0418  NADH dehydrogenase I, F subunit  91.1 
 
 		 436 aa  820    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1033  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  91.33 
 
 		 436 aa  804    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.970624  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.18 
 
 		 425 aa  676    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1295  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  91.1 
 
 		 436 aa  818    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  90.87 
 
 		 436 aa  818    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1135  NADH dehydrogenase I, F subunit  91.1 
 
 		 436 aa  820    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305748  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  73.92 
 
 		 458 aa  670    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.35 
 
 		 467 aa  679    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3209  putative NADH dehydrogenase I (chain F), NuoF  89.23 
 
 		 442 aa  809    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  89.33 
 
 		 442 aa  812    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0932  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  100 
 
 		 431 aa  892    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1632  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  90.4 
 
 		 436 aa  819    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1506  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  78.52 
 
 		 452 aa  664    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00816775 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  82.05 
 
 		 432 aa  710    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.725894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2282  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  90.16 
 
 		 436 aa  817    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.502286  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2244  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  90.4 
 
 		 436 aa  819    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0877  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.14 
 
 		 453 aa  662    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3505  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.16 
 
 		 446 aa  664    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  91.1 
 
 		 436 aa  820    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  90.4 
 
 		 440 aa  818    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.59 
 
 		 452 aa  660    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1429  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.69 
 
 		 473 aa  663    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.332144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0962  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  76.9 
 
 		 453 aa  662    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089517 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2056  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.83 
 
 		 441 aa  591  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  68.3 
 
 		 425 aa  585  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  68.72 
 
 		 427 aa  579  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  67.16 
 
 		 425 aa  570  1e-161  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  67.16 
 
 		 425 aa  570  1e-161  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  64.52 
 
 		 425 aa  568  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.42 
 
 		 426 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  62.75 
 
 		 422 aa  558  1e-158  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  64.3 
 
 		 426 aa  556  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  62.75 
 
 		 422 aa  558  1e-157  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  62.72 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  62.9 
 
 		 429 aa  548  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  62.72 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  61.04 
 
 		 426 aa  539  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01292  NADH-quinone oxidoreductase, f subunit  59.71 
 
 		 444 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.314011  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0274  NADH dehydrogenase (quinone)  59.71 
 
 		 444 aa  497  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0245  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.46 
 
 		 444 aa  495  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.48 
 
 		 446 aa  494  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0359658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.1 
 
 		 424 aa  449  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.03 
 
 		 421 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  52.46 
 
 		 432 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4077  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.12 
 
 		 454 aa  425  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.87 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.87 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.87 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.86 
 
 		 456 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0976  NADH dehydrogenase I subunit F  52.11 
 
 		 417 aa  420  1e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0486  NADH dehydrogenase I subunit F  51.36 
 
 		 427 aa  420  1e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3221  NADH dehydrogenase I subunit F  50.25 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1560  NADH dehydrogenase I subunit F  51.83 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0548  NADH dehydrogenase I subunit F  51.12 
 
 		 427 aa  417  9.999999999999999e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0926  NADH dehydrogenase I subunit F  51.12 
 
 		 431 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  51.77 
 
 		 436 aa  412  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.79 
 
 		 433 aa  412  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4556  NADH dehydrogenase I subunit F  50 
 
 		 441 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  50.87 
 
 		 428 aa  413  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0894  NADH dehydrogenase I subunit F  52.12 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2215  NADH dehydrogenase I subunit F  51.21 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1377  NADH dehydrogenase I chain F  51.58 
 
 		 448 aa  414  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0721979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1882  NADH dehydrogenase I subunit F  50.97 
 
 		 441 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.71 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43184  predicted protein  50.25 
 
 		 449 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.236516  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.87 
 
 		 443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0714  NADH dehydrogenase I subunit F  50.25 
 
 		 413 aa  408  1.0000000000000001e-112  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.657968  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.65 
 
 		 446 aa  408  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  49.27 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1027  NADH dehydrogenase I subunit F  50.75 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  50.5 
 
 		 433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1360  NADH dehydrogenase I subunit F  50.49 
 
 		 437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315276  normal  0.0477199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4083  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.18 
 
 		 446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.323862  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3333  NADH dehydrogenase I subunit F  49.5 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240845  normal  0.194232 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2518  NADH dehydrogenase I subunit F  50.92 
 
 		 431 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.61 
 
 		 447 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1180  NADH dehydrogenase I subunit F  50.92 
 
 		 431 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258408  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2923  NADH dehydrogenase I subunit F  50 
 
 		 436 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  49.63 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.24 
 
 		 448 aa  401  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3224  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.75 
 
 		 439 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762011 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  48.05 
 
 		 449 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2243  NADH dehydrogenase I subunit F  50.13 
 
 		 431 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0486512  normal  0.115108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>