More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4083 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4077  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  81.12 
 
 
454 aa  728    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4083  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  100 
 
 
446 aa  919    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.323862  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5103  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  89.46 
 
 
446 aa  808    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.41 
 
 
456 aa  690    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1377  NADH dehydrogenase I chain F  75.7 
 
 
448 aa  677    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0721979  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7014  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  70.67 
 
 
454 aa  634  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.25 
 
 
433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.42 
 
 
438 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.49 
 
 
448 aa  437  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.6 
 
 
425 aa  437  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  51.42 
 
 
428 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.83 
 
 
442 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.35 
 
 
706 aa  431  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.18 
 
 
439 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  51.18 
 
 
428 aa  428  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.54 
 
 
451 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.16 
 
 
443 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.84 
 
 
422 aa  425  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.66 
 
 
426 aa  425  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  51.05 
 
 
445 aa  426  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0474  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.13 
 
 
448 aa  425  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7686  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.22 
 
 
441 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  50.83 
 
 
436 aa  424  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.87 
 
 
424 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.1 
 
 
434 aa  424  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.24 
 
 
434 aa  420  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.59 
 
 
449 aa  420  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.59 
 
 
421 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.65 
 
 
441 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.21 
 
 
427 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.21 
 
 
427 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.46 
 
 
426 aa  419  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.65 
 
 
441 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.59 
 
 
441 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1925  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.46 
 
 
445 aa  418  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.65 
 
 
441 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.06 
 
 
425 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50 
 
 
429 aa  420  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  49.19 
 
 
449 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  47.98 
 
 
426 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.39 
 
 
431 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.39 
 
 
431 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.48 
 
 
467 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0525  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.47 
 
 
440 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  48.42 
 
 
431 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  47.04 
 
 
422 aa  412  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.49 
 
 
427 aa  413  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1408  NADH dehydrogenase (quinone)  49.76 
 
 
448 aa  413  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344302  normal  0.160337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6677  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.16 
 
 
431 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  47.04 
 
 
422 aa  412  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1575  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.53 
 
 
438 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1545  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.53 
 
 
438 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.349481  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1599  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.53 
 
 
438 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.88 
 
 
452 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  48.62 
 
 
424 aa  408  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2711  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.04 
 
 
444 aa  411  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.07 
 
 
442 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0633  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 
427 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1628  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 
427 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3188  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 
427 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.91 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.121706  normal  0.072136 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.17 
 
 
444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  51.12 
 
 
433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.91 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.88 
 
 
458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2056  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.93 
 
 
441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3209  putative NADH dehydrogenase I (chain F), NuoF  48.17 
 
 
442 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489699  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.91 
 
 
440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0932  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.18 
 
 
431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5981  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.26 
 
 
447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3224  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.28 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1880  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.23 
 
 
441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  46.99 
 
 
425 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  46.99 
 
 
425 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.67 
 
 
436 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.03 
 
 
442 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1304  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.67 
 
 
436 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1295  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.91 
 
 
436 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.67 
 
 
436 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.92 
 
 
442 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020872  hitchhiker  0.00762126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0979  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.88 
 
 
439 aa  403  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3505  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.16 
 
 
446 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1632  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.67 
 
 
436 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.37 
 
 
452 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4486  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.23 
 
 
438 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144316  hitchhiker  0.0024852 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2282  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.67 
 
 
436 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.502286  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2244  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.67 
 
 
436 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1135  NADH dehydrogenase I, F subunit  47.19 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  47.19 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  47.19 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0877  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.39 
 
 
453 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0418  NADH dehydrogenase I, F subunit  47.19 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0962  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.15 
 
 
453 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089517 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.26 
 
 
425 aa  401  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1046  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.63 
 
 
432 aa  396  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  49.52 
 
 
432 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.88 
 
 
432 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.725894  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0481  NADH dehydrogenase (quinone)  47.94 
 
 
452 aa  398  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0966  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.18 
 
 
431 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.68 
 
 
426 aa  392  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>