More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3630 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  100 
 
 
424 aa  868    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1560  NADH dehydrogenase I subunit F  61.11 
 
 
429 aa  520  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.58 
 
 
427 aa  512  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.58 
 
 
427 aa  512  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0486  NADH dehydrogenase I subunit F  58.11 
 
 
427 aa  510  1e-143  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  60 
 
 
427 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.29 
 
 
425 aa  505  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  57.88 
 
 
425 aa  503  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  57.88 
 
 
425 aa  503  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04070  NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit, putative  54.72 
 
 
534 aa  502  1e-141  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.92 
 
 
426 aa  501  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  56.9 
 
 
432 aa  502  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3221  NADH dehydrogenase I subunit F  56.77 
 
 
429 aa  502  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0548  NADH dehydrogenase I subunit F  57.28 
 
 
427 aa  500  1e-140  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05629  NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  55.8 
 
 
497 aa  494  1e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0623546 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  57.11 
 
 
422 aa  496  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0976  NADH dehydrogenase I subunit F  56.97 
 
 
417 aa  494  1e-139  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  57.11 
 
 
422 aa  496  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  56.07 
 
 
430 aa  495  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1027  NADH dehydrogenase I subunit F  58.05 
 
 
434 aa  498  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2243  NADH dehydrogenase I subunit F  55.31 
 
 
431 aa  495  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0486512  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  56.55 
 
 
433 aa  493  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  60.45 
 
 
425 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  56.2 
 
 
428 aa  493  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0926  NADH dehydrogenase I subunit F  56.34 
 
 
431 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2394  NADH dehydrogenase I subunit F  57.55 
 
 
436 aa  493  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.140128  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3333  NADH dehydrogenase I subunit F  55.96 
 
 
441 aa  493  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240845  normal  0.194232 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2001  NADH dehydrogenase I subunit F  54.74 
 
 
431 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  59.6 
 
 
431 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0894  NADH dehydrogenase I subunit F  57.32 
 
 
434 aa  490  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13206  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2518  NADH dehydrogenase I subunit F  54.5 
 
 
431 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1180  NADH dehydrogenase I subunit F  54.5 
 
 
431 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258408  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.85 
 
 
431 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43184  predicted protein  56.07 
 
 
449 aa  489  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.236516  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.85 
 
 
431 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0714  NADH dehydrogenase I subunit F  56.55 
 
 
413 aa  488  1e-136  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.657968  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0748  NADH dehydrogenase I subunit F  56.31 
 
 
432 aa  486  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147388  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.31 
 
 
425 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1360  NADH dehydrogenase I subunit F  55.8 
 
 
437 aa  485  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315276  normal  0.0477199 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2923  NADH dehydrogenase I subunit F  56.32 
 
 
436 aa  482  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1882  NADH dehydrogenase I subunit F  56.17 
 
 
441 aa  483  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1265  NADH dehydrogenase I subunit F  55.34 
 
 
434 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1357  NADH dehydrogenase I subunit F  55.58 
 
 
434 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2215  NADH dehydrogenase I subunit F  55.93 
 
 
441 aa  481  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0932  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.1 
 
 
431 aa  481  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5981  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1718  NADH dehydrogenase I subunit F  55.85 
 
 
434 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4556  NADH dehydrogenase I subunit F  55.02 
 
 
441 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43944  predicted protein  54.37 
 
 
493 aa  480  1e-134  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323695  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.56 
 
 
442 aa  478  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  57.25 
 
 
426 aa  480  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2055  NADH dehydrogenase I subunit F  56.59 
 
 
433 aa  477  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517668  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0807  NADH dehydrogenase I subunit F  56.59 
 
 
435 aa  477  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.662201  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31688  NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit, mitochondrial precursor (Complex I-51KD) (CI-51KD)  54.68 
 
 
484 aa  478  1e-133  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.472796  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.9 
 
 
456 aa  477  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1179  NADH dehydrogenase I subunit F  54.46 
 
 
431 aa  476  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.049393  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0802  NADH dehydrogenase I subunit F  56.34 
 
 
435 aa  476  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4395  NADH dehydrogenase I subunit F  56.83 
 
 
433 aa  478  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3293  NADH dehydrogenase I subunit F  54.5 
 
 
441 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.37 
 
 
426 aa  473  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4131  NADH dehydrogenase I subunit F  56.1 
 
 
433 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.519753  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.75 
 
 
436 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.121706  normal  0.072136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1080  NADH dehydrogenase I subunit F  56.34 
 
 
433 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2418  NADH dehydrogenase I subunit F  55.85 
 
 
435 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.75 
 
 
436 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.48 
 
 
452 aa  471  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.5 
 
 
436 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1209  NADH dehydrogenase I subunit F  56.34 
 
 
433 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335616  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.59 
 
 
433 aa  472  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2579  NADH dehydrogenase I subunit F  54.26 
 
 
441 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2408  NADH dehydrogenase I subunit F  54.26 
 
 
441 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0121136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2880  NADH dehydrogenase I subunit F  54.01 
 
 
441 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.756344  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1014  NADH dehydrogenase I subunit F  56.59 
 
 
433 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1632  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.75 
 
 
436 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1377  NADH dehydrogenase I chain F  54.84 
 
 
448 aa  473  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0721979  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2244  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.75 
 
 
436 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.75 
 
 
440 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4628  NADH dehydrogenase I subunit F  54.37 
 
 
433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.133099 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  57 
 
 
436 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0966  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.35 
 
 
431 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.25 
 
 
436 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  57 
 
 
436 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1295  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57 
 
 
436 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1135  NADH dehydrogenase I, F subunit  57 
 
 
436 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305748  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.99 
 
 
426 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.96 
 
 
458 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2056  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.98 
 
 
441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1304  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.25 
 
 
436 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0418  NADH dehydrogenase I, F subunit  57 
 
 
436 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2282  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.5 
 
 
436 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.502286  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4077  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.01 
 
 
454 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.11 
 
 
442 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.36 
 
 
439 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0783  NADH dehydrogenase I subunit F  53.9 
 
 
435 aa  467  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.860034  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  55.69 
 
 
445 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1408  NADH dehydrogenase (quinone)  57.18 
 
 
448 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344302  normal  0.160337 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.33 
 
 
467 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3209  putative NADH dehydrogenase I (chain F), NuoF  56.75 
 
 
442 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489699  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.14 
 
 
429 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57 
 
 
442 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020872  hitchhiker  0.00762126 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.35 
 
 
452 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>