More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2252 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  100 
 
 
427 aa  877    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  100 
 
 
427 aa  877    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.86 
 
 
425 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  65.61 
 
 
426 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  62.62 
 
 
442 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.44 
 
 
427 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  60.33 
 
 
436 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1046  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.6 
 
 
432 aa  553  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  60.33 
 
 
436 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0418  NADH dehydrogenase I, F subunit  60.33 
 
 
436 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1135  NADH dehydrogenase I, F subunit  60.33 
 
 
436 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305748  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  62.25 
 
 
431 aa  548  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  60.71 
 
 
425 aa  550  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  60.71 
 
 
425 aa  550  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  64.86 
 
 
432 aa  548  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.725894  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  60.19 
 
 
436 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1304  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  60.19 
 
 
436 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  62.5 
 
 
431 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  61.41 
 
 
440 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  60.58 
 
 
426 aa  549  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  60.43 
 
 
436 aa  549  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0932  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  62.72 
 
 
431 aa  548  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5981  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1632  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  61.52 
 
 
436 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.53 
 
 
425 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  62.5 
 
 
431 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2244  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  61.52 
 
 
436 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  61.27 
 
 
436 aa  547  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  61.27 
 
 
436 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.121706  normal  0.072136 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  61.65 
 
 
442 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.46 
 
 
467 aa  545  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3209  putative NADH dehydrogenase I (chain F), NuoF  62.01 
 
 
442 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489699  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  62.01 
 
 
442 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020872  hitchhiker  0.00762126 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1295  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.95 
 
 
436 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2282  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  61.27 
 
 
436 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.502286  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1747  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.42 
 
 
439 aa  544  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.62 
 
 
426 aa  541  1e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0966  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.21 
 
 
431 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  62.83 
 
 
458 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1408  NADH dehydrogenase (quinone)  64.63 
 
 
448 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344302  normal  0.160337 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2056  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  60.24 
 
 
441 aa  536  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1033  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  62.25 
 
 
436 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.970624  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.85 
 
 
426 aa  532  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3505  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  64.05 
 
 
446 aa  528  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  60.78 
 
 
429 aa  528  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0962  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  64.2 
 
 
453 aa  529  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089517 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0877  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  64.2 
 
 
453 aa  530  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.63 
 
 
425 aa  529  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.32 
 
 
452 aa  527  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1429  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  62.35 
 
 
473 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.332144  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.84 
 
 
452 aa  525  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5175  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.75 
 
 
452 aa  524  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82972  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  55.69 
 
 
422 aa  521  1e-147  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  55.69 
 
 
422 aa  520  1e-146  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1506  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.57 
 
 
452 aa  516  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00816775 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01292  NADH-quinone oxidoreductase, f subunit  59.31 
 
 
444 aa  502  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.314011  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0274  NADH dehydrogenase (quinone)  58.87 
 
 
444 aa  495  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.74 
 
 
446 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0359658  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0245  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.62 
 
 
444 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.58 
 
 
424 aa  478  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.59 
 
 
433 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.61 
 
 
421 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.44 
 
 
439 aa  455  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.58 
 
 
443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3221  NADH dehydrogenase I subunit F  52.61 
 
 
429 aa  451  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  52.73 
 
 
428 aa  451  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0486  NADH dehydrogenase I subunit F  54.69 
 
 
427 aa  449  1e-125  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2160  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.24 
 
 
443 aa  448  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.85 
 
 
447 aa  450  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  53.9 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_002978  WD0976  NADH dehydrogenase I subunit F  55.29 
 
 
417 aa  442  1e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4556  NADH dehydrogenase I subunit F  52.03 
 
 
441 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0548  NADH dehydrogenase I subunit F  54.83 
 
 
427 aa  444  1e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  52.59 
 
 
424 aa  444  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  51.2 
 
 
428 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.2 
 
 
444 aa  439  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.99 
 
 
438 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.21 
 
 
446 aa  439  9.999999999999999e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1027  NADH dehydrogenase I subunit F  54.82 
 
 
434 aa  439  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.2 
 
 
434 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2243  NADH dehydrogenase I subunit F  51.18 
 
 
431 aa  439  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0486512  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0525  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.78 
 
 
440 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1180  NADH dehydrogenase I subunit F  50.59 
 
 
431 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258408  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.53 
 
 
456 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4131  NADH dehydrogenase I subunit F  52.27 
 
 
433 aa  435  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.519753  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2518  NADH dehydrogenase I subunit F  50.83 
 
 
431 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0894  NADH dehydrogenase I subunit F  54.82 
 
 
434 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13206  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.38 
 
 
448 aa  437  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2215  NADH dehydrogenase I subunit F  53.2 
 
 
441 aa  435  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0748  NADH dehydrogenase I subunit F  52.14 
 
 
432 aa  436  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147388  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  51.9 
 
 
433 aa  438  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1718  NADH dehydrogenase I subunit F  50.46 
 
 
434 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  51.08 
 
 
445 aa  433  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6677  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.11 
 
 
431 aa  433  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1882  NADH dehydrogenase I subunit F  52.96 
 
 
441 aa  432  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1560  NADH dehydrogenase I subunit F  52.84 
 
 
429 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  51.87 
 
 
428 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1179  NADH dehydrogenase I subunit F  51.3 
 
 
431 aa  433  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.049393  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0474  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50 
 
 
448 aa  433  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  51.98 
 
 
430 aa  434  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1377  NADH dehydrogenase I chain F  49.42 
 
 
448 aa  434  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0721979  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>