More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2238 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  78.1 
 
 
434 aa  691    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  92.94 
 
 
451 aa  826    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  100 
 
 
449 aa  930    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  64.68 
 
 
422 aa  567  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.45 
 
 
421 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.84 
 
 
433 aa  456  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.05 
 
 
438 aa  448  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  54.32 
 
 
449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.28 
 
 
448 aa  444  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.88 
 
 
706 aa  438  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  52.38 
 
 
445 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.6 
 
 
443 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.73 
 
 
434 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7686  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.63 
 
 
441 aa  435  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.78 
 
 
447 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0474  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.55 
 
 
448 aa  434  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.57 
 
 
439 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.85 
 
 
427 aa  433  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  53.09 
 
 
428 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.85 
 
 
427 aa  433  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.47 
 
 
442 aa  434  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4083  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.59 
 
 
446 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.323862  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  53.83 
 
 
424 aa  432  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6677  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.79 
 
 
431 aa  428  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  52.58 
 
 
428 aa  430  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  51.11 
 
 
426 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.52 
 
 
441 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.52 
 
 
441 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.52 
 
 
441 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0979  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.63 
 
 
439 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1545  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.83 
 
 
438 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.349481  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4077  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.65 
 
 
454 aa  425  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1575  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.07 
 
 
438 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1599  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.07 
 
 
438 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4060  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.14 
 
 
443 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.306589 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.28 
 
 
426 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50 
 
 
444 aa  421  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2711  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.34 
 
 
444 aa  418  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  48.44 
 
 
436 aa  421  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.36 
 
 
425 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0525  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.33 
 
 
440 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.16 
 
 
425 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.03 
 
 
442 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.65 
 
 
456 aa  418  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4458  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.39 
 
 
443 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.33 
 
 
429 aa  412  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.33 
 
 
441 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1377  NADH dehydrogenase I chain F  48.48 
 
 
448 aa  415  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0721979  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.09 
 
 
426 aa  412  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4486  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.1 
 
 
438 aa  411  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144316  hitchhiker  0.0024852 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01292  NADH-quinone oxidoreductase, f subunit  50.23 
 
 
444 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.314011  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.16 
 
 
427 aa  409  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3862  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.46 
 
 
443 aa  411  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  50.37 
 
 
438 aa  409  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1880  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.59 
 
 
441 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  47.94 
 
 
545 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.77 
 
 
426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3224  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.96 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762011 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.75 
 
 
446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  47.7 
 
 
545 aa  404  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  48.19 
 
 
425 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  48.19 
 
 
425 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.88 
 
 
442 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.93 
 
 
446 aa  403  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0359658  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5103  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.3 
 
 
446 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  48.07 
 
 
422 aa  400  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.48 
 
 
467 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3209  putative NADH dehydrogenase I (chain F), NuoF  49.63 
 
 
442 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489699  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0932  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.04 
 
 
431 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5981  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  48.07 
 
 
422 aa  400  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  47.68 
 
 
610 aa  399  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  46.83 
 
 
545 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2160  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.5 
 
 
443 aa  395  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  47.96 
 
 
427 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  48.92 
 
 
431 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.16 
 
 
431 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7014  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.53 
 
 
454 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.16 
 
 
431 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.39 
 
 
442 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020872  hitchhiker  0.00762126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5175  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50 
 
 
452 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82972  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  48.21 
 
 
602 aa  397  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.51 
 
 
452 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2416  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.38 
 
 
448 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0718255  normal  0.148536 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3369  NADH dehydrogenase I, F subunit  47.47 
 
 
452 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  49.87 
 
 
436 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1123  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.6 
 
 
429 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.16 
 
 
440 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  45.16 
 
 
539 aa  393  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.92 
 
 
436 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1135  NADH dehydrogenase I, F subunit  49.87 
 
 
436 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305748  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.82 
 
 
425 aa  394  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.62 
 
 
436 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2056  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.86 
 
 
441 aa  395  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0418  NADH dehydrogenase I, F subunit  49.87 
 
 
436 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2282  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.16 
 
 
436 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.502286  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0633  NADH dehydrogenase (quinone)  48.01 
 
 
427 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1628  NADH dehydrogenase (quinone)  48.01 
 
 
427 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3188  NADH dehydrogenase (quinone)  48.01 
 
 
427 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  49.87 
 
 
436 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  46.93 
 
 
597 aa  391  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>