More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND04070 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001305  ANIA_05629  NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  71.67 
 
 
497 aa  721    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0623546 
 
 
-
 
NC_006686  CND04070  NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit, putative  100 
 
 
534 aa  1108    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43184  predicted protein  71.33 
 
 
449 aa  655    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.236516  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31688  NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit, mitochondrial precursor (Complex I-51KD) (CI-51KD)  70.68 
 
 
484 aa  719    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.472796  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43944  predicted protein  63.38 
 
 
493 aa  621  1e-176  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323695  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3221  NADH dehydrogenase I subunit F  67.86 
 
 
429 aa  615  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0894  NADH dehydrogenase I subunit F  67.3 
 
 
434 aa  611  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13206  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0748  NADH dehydrogenase I subunit F  68.1 
 
 
432 aa  612  9.999999999999999e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147388  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1027  NADH dehydrogenase I subunit F  67.3 
 
 
434 aa  612  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0926  NADH dehydrogenase I subunit F  65.58 
 
 
431 aa  611  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3333  NADH dehydrogenase I subunit F  66.04 
 
 
441 aa  609  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240845  normal  0.194232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  67.86 
 
 
433 aa  607  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1560  NADH dehydrogenase I subunit F  67.7 
 
 
429 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2923  NADH dehydrogenase I subunit F  67.06 
 
 
436 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2518  NADH dehydrogenase I subunit F  66.83 
 
 
431 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1179  NADH dehydrogenase I subunit F  67.38 
 
 
431 aa  604  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.049393  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1180  NADH dehydrogenase I subunit F  66.83 
 
 
431 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258408  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  66.75 
 
 
428 aa  599  1e-170  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2001  NADH dehydrogenase I subunit F  65.87 
 
 
431 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4556  NADH dehydrogenase I subunit F  67.76 
 
 
441 aa  598  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1718  NADH dehydrogenase I subunit F  65.41 
 
 
434 aa  601  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0807  NADH dehydrogenase I subunit F  65.17 
 
 
435 aa  596  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.662201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0802  NADH dehydrogenase I subunit F  65.17 
 
 
435 aa  597  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  65.8 
 
 
430 aa  595  1e-169  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1265  NADH dehydrogenase I subunit F  64.39 
 
 
434 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1357  NADH dehydrogenase I subunit F  64.15 
 
 
434 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2579  NADH dehydrogenase I subunit F  66.82 
 
 
441 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2880  NADH dehydrogenase I subunit F  66.59 
 
 
441 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.756344  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2418  NADH dehydrogenase I subunit F  64.78 
 
 
435 aa  592  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2243  NADH dehydrogenase I subunit F  65.87 
 
 
431 aa  593  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0486512  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4628  NADH dehydrogenase I subunit F  65.18 
 
 
433 aa  590  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.133099 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3293  NADH dehydrogenase I subunit F  66.59 
 
 
441 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2055  NADH dehydrogenase I subunit F  65.33 
 
 
433 aa  590  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517668  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1209  NADH dehydrogenase I subunit F  65.65 
 
 
433 aa  585  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335616  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1080  NADH dehydrogenase I subunit F  65.65 
 
 
433 aa  585  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1014  NADH dehydrogenase I subunit F  65.18 
 
 
433 aa  585  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2394  NADH dehydrogenase I subunit F  64.24 
 
 
436 aa  585  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.140128  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4395  NADH dehydrogenase I subunit F  64.71 
 
 
433 aa  585  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0486  NADH dehydrogenase I subunit F  62.74 
 
 
427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2408  NADH dehydrogenase I subunit F  65.17 
 
 
441 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0121136 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4131  NADH dehydrogenase I subunit F  64.47 
 
 
433 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.519753  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  65.32 
 
 
432 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0783  NADH dehydrogenase I subunit F  62.8 
 
 
435 aa  578  1e-164  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.860034  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1882  NADH dehydrogenase I subunit F  65.65 
 
 
441 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2215  NADH dehydrogenase I subunit F  65.64 
 
 
441 aa  575  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1360  NADH dehydrogenase I subunit F  62.97 
 
 
437 aa  572  1.0000000000000001e-162  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315276  normal  0.0477199 
 
 
-
 
NC_002978  WD0976  NADH dehydrogenase I subunit F  64.59 
 
 
417 aa  570  1e-161  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0548  NADH dehydrogenase I subunit F  61.47 
 
 
427 aa  570  1e-161  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2828  NADH dehydrogenase I subunit F  65.49 
 
 
439 aa  556  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.256146  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0714  NADH dehydrogenase I subunit F  57.52 
 
 
413 aa  519  1e-146  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.657968  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.72 
 
 
424 aa  465  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.32 
 
 
425 aa  438  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50 
 
 
425 aa  422  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  52.8 
 
 
425 aa  422  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  52.8 
 
 
425 aa  422  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.83 
 
 
426 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.79 
 
 
427 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.79 
 
 
427 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.62 
 
 
442 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.22 
 
 
426 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.33 
 
 
429 aa  410  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.92 
 
 
427 aa  402  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.67 
 
 
425 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.4 
 
 
443 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0877  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.91 
 
 
453 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  49 
 
 
426 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.26 
 
 
452 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.9 
 
 
467 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.37 
 
 
452 aa  398  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0962  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.66 
 
 
453 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089517 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  48.33 
 
 
422 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  48.84 
 
 
424 aa  395  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  48.33 
 
 
422 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.87 
 
 
447 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.26 
 
 
426 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5175  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.14 
 
 
452 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82972  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  47.56 
 
 
431 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.61 
 
 
433 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2160  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.97 
 
 
443 aa  386  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.8 
 
 
441 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.8 
 
 
441 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.55 
 
 
434 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.98 
 
 
441 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4077  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.72 
 
 
454 aa  386  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3505  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.01 
 
 
446 aa  389  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.32 
 
 
431 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.32 
 
 
431 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  49.24 
 
 
449 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  47.81 
 
 
428 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.06 
 
 
446 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0359658  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.79 
 
 
458 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3209  putative NADH dehydrogenase I (chain F), NuoF  45.56 
 
 
442 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489699  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01292  NADH-quinone oxidoreductase, f subunit  46.21 
 
 
444 aa  385  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.314011  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.54 
 
 
442 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020872  hitchhiker  0.00762126 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0932  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.33 
 
 
431 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5981  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1377  NADH dehydrogenase I chain F  48.47 
 
 
448 aa  379  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0721979  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  47.01 
 
 
438 aa  382  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.6 
 
 
442 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.05 
 
 
444 aa  376  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.77 
 
 
441 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>