More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0216 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0216  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
425 aa  871    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1517  NADH dehydrogenase (quinone)  61.93 
 
 
427 aa  504  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.59 
 
 
441 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.59 
 
 
441 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.59 
 
 
441 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.57 
 
 
444 aa  366  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  45.95 
 
 
545 aa  366  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  45.95 
 
 
545 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.96 
 
 
421 aa  365  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0225  NADH dehydrogenase (quinone)  45.26 
 
 
417 aa  363  2e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.82 
 
 
434 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  44.5 
 
 
607 aa  361  1e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  44.5 
 
 
607 aa  361  1e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  44.96 
 
 
538 aa  360  3e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  44.61 
 
 
610 aa  360  3e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_154  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  44.28 
 
 
417 aa  359  4e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  46.15 
 
 
539 aa  359  5e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0146  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  43.8 
 
 
417 aa  358  8e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28536  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.08 
 
 
422 aa  358  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.19 
 
 
451 aa  357  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  45.55 
 
 
614 aa  355  1e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.61 
 
 
441 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  44.66 
 
 
438 aa  352  5e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.45 
 
 
449 aa  351  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  41.99 
 
 
604 aa  350  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  44.15 
 
 
407 aa  349  6e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2864  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.92 
 
 
454 aa  349  6e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  hitchhiker  0.00675695 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2768  NADH dehydrogenase I subunit F  45.12 
 
 
449 aa  348  8e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  45.41 
 
 
614 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1496  NADH dehydrogenase I subunit F  45.12 
 
 
449 aa  348  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.376582  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  45.06 
 
 
602 aa  347  2e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1024  NADH dehydrogenase (quinone)  44.63 
 
 
407 aa  347  2e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2463  NADH dehydrogenase I subunit F  44.5 
 
 
445 aa  345  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.560534  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2670  NADH dehydrogenase I subunit F  44.5 
 
 
445 aa  345  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.793863 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2552  NADH dehydrogenase I subunit F  44.5 
 
 
445 aa  345  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2563  NADH dehydrogenase I subunit F  44.5 
 
 
445 aa  345  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2508  NADH dehydrogenase I subunit F  44.5 
 
 
445 aa  345  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3423  NADH dehydrogenase I subunit F  44.25 
 
 
445 aa  345  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1368  NADH dehydrogenase I subunit F  44.25 
 
 
445 aa  345  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.104051  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2577  NADH dehydrogenase I subunit F  44.25 
 
 
445 aa  345  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2828  NADH dehydrogenase I subunit F  44.99 
 
 
445 aa  345  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.208712  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2433  NADH dehydrogenase I subunit F  44.25 
 
 
445 aa  345  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2660  NADH dehydrogenase I subunit F  44.25 
 
 
445 aa  345  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.142172  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.01 
 
 
456 aa  344  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02209  NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain F  44.25 
 
 
445 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1373  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.25 
 
 
445 aa  344  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00215992  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02169  hypothetical protein  44.25 
 
 
445 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2438  NADH dehydrogenase I subunit F  44.25 
 
 
445 aa  344  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  44.25 
 
 
486 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4112  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  44.31 
 
 
656 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483313  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6677  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.3 
 
 
431 aa  343  4e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4083  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.77 
 
 
446 aa  343  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.323862  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1634  NADP-reducing hydrogenase chain C  44.25 
 
 
486 aa  343  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000096005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1844  NADP-reducing hydrogenase chain C  44.25 
 
 
486 aa  343  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.07 
 
 
442 aa  343  4e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3304  NADH dehydrogenase I subunit F  44.91 
 
 
450 aa  343  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0360562  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1812  NADH dehydrogenase I subunit F  45.64 
 
 
461 aa  342  5.999999999999999e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.848425 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1612  NADH dehydrogenase (quinone)  44.13 
 
 
466 aa  342  5.999999999999999e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.709157  normal  0.640028 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1564  NADH dehydrogenase I subunit F  45.64 
 
 
461 aa  342  5.999999999999999e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1458  NADH dehydrogenase I subunit F  45.64 
 
 
461 aa  342  5.999999999999999e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  45.91 
 
 
427 aa  342  7e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  44.53 
 
 
424 aa  342  9e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  43.66 
 
 
407 aa  342  9e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.82 
 
 
447 aa  341  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1925  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.66 
 
 
445 aa  340  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.94 
 
 
446 aa  339  4e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  41.89 
 
 
436 aa  339  5e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  40.75 
 
 
594 aa  338  7e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  45.01 
 
 
597 aa  338  8e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 
626 aa  338  9e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.57 
 
 
443 aa  338  9e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1017  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.33 
 
 
425 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  45.1 
 
 
485 aa  336  3.9999999999999995e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1123  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.67 
 
 
429 aa  336  5e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  43.13 
 
 
596 aa  336  5e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1377  NADH dehydrogenase I chain F  44.98 
 
 
448 aa  336  5e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0721979  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0633  NADH dehydrogenase (quinone)  46.12 
 
 
427 aa  336  5e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1628  NADH dehydrogenase (quinone)  46.12 
 
 
427 aa  336  5e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3188  NADH dehydrogenase (quinone)  46.12 
 
 
427 aa  336  5e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1311  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.44 
 
 
439 aa  336  5.999999999999999e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3821  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.23 
 
 
426 aa  335  7.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.400637  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  42.24 
 
 
624 aa  334  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.36 
 
 
426 aa  334  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0377  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.82 
 
 
444 aa  335  1e-90  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.372414  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0807  NADH dehydrogenase (quinone)  44.67 
 
 
404 aa  335  1e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4077  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.98 
 
 
454 aa  335  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  45.29 
 
 
626 aa  333  3e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  41.81 
 
 
545 aa  333  4e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.78 
 
 
448 aa  333  4e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7014  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.65 
 
 
454 aa  333  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  43.26 
 
 
597 aa  333  5e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  43.77 
 
 
594 aa  333  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  45.29 
 
 
626 aa  333  5e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4458  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.52 
 
 
443 aa  332  6e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3862  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.52 
 
 
443 aa  332  6e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  42.46 
 
 
597 aa  332  8e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  43.15 
 
 
572 aa  332  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.05 
 
 
438 aa  331  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.24 
 
 
706 aa  331  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.39 
 
 
434 aa  330  2e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>