More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0146 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0146  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  100 
 
 		 417 aa  862    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28536  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0225  NADH dehydrogenase (quinone)  96.64 
 
 		 417 aa  816    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_154  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  97.84 
 
 		 417 aa  823    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  49.64 
 
 		 538 aa  422  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  49.64 
 
 		 607 aa  413  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  49.03 
 
 		 545 aa  412  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  49.64 
 
 		 607 aa  413  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  49.16 
 
 		 539 aa  411  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  49.27 
 
 		 545 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  49.03 
 
 		 545 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  48.43 
 
 		 602 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  47.34 
 
 		 610 aa  391  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  46.28 
 
 		 488 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.74 
 
 		 421 aa  388  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  46.14 
 
 		 597 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  45.76 
 
 		 614 aa  384  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  46.97 
 
 		 624 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.77 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  45.01 
 
 		 407 aa  378  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  47.6 
 
 		 596 aa  379  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.06 
 
 		 427 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.06 
 
 		 427 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  44.71 
 
 		 597 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.27 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  46.1 
 
 		 614 aa  373  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  46.72 
 
 		 486 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1024  NADH dehydrogenase (quinone)  44.28 
 
 		 407 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  45.59 
 
 		 624 aa  371  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1634  NADP-reducing hydrogenase chain C  46.72 
 
 		 486 aa  371  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000096005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1844  NADP-reducing hydrogenase chain C  46.72 
 
 		 486 aa  371  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0807  NADH dehydrogenase (quinone)  46.48 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  46.49 
 
 		 592 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  45.99 
 
 		 619 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  44.28 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  45.91 
 
 		 626 aa  365  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  46.6 
 
 		 588 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.25 
 
 		 443 aa  366  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  45.57 
 
 		 572 aa  368  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  45.32 
 
 		 590 aa  365  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1517  NADH dehydrogenase (quinone)  45.28 
 
 		 427 aa  365  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  46.1 
 
 		 595 aa  365  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  44.63 
 
 		 626 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  45.89 
 
 		 624 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.21 
 
 		 425 aa  364  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.25 
 
 		 447 aa  365  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  47.73 
 
 		 535 aa  363  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4112  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  46.97 
 
 		 656 aa  363  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1311  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.57 
 
 		 439 aa  363  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  45.39 
 
 		 485 aa  363  3e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.95 
 
 		 438 aa  363  3e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  45.67 
 
 		 626 aa  363  3e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02970  NADH dehydrogenase I subunit F  45.91 
 
 		 408 aa  363  4e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  43.45 
 
 		 604 aa  362  5.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  45.01 
 
 		 594 aa  362  6e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  44.55 
 
 		 603 aa  362  6e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0216  NADH dehydrogenase (quinone)  43.8 
 
 		 425 aa  362  8e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.21 
 
 		 426 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  44.58 
 
 		 596 aa  361  1e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3862  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.32 
 
 		 443 aa  360  3e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  43.65 
 
 		 629 aa  360  3e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.3 
 
 		 426 aa  359  4e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  44.93 
 
 		 597 aa  359  4e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  43.9 
 
 		 562 aa  358  9e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  42.23 
 
 		 438 aa  358  9.999999999999999e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.88 
 
 		 422 aa  357  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.5 
 
 		 434 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.57 
 
 		 425 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  46.23 
 
 		 572 aa  356  3.9999999999999996e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2304  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  43.83 
 
 		 623 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  46.06 
 
 		 562 aa  356  5e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.46 
 
 		 448 aa  355  7.999999999999999e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  44.55 
 
 		 597 aa  355  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.79 
 
 		 433 aa  354  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  44.31 
 
 		 677 aa  354  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  45.1 
 
 		 632 aa  353  4e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  43.78 
 
 		 426 aa  352  5e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  46.97 
 
 		 596 aa  352  5e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1123  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.67 
 
 		 429 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1017  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.72 
 
 		 425 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  42.65 
 
 		 570 aa  352  8e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  46.63 
 
 		 598 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.58 
 
 		 442 aa  351  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.01 
 
 		 458 aa  352  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  45.1 
 
 		 623 aa  351  2e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.05 
 
 		 439 aa  350  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3350  NADH dehydrogenase I, F subunit  43.83 
 
 		 591 aa  350  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.051471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5175  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.58 
 
 		 452 aa  350  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.72 
 
 		 449 aa  350  3e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  44.5 
 
 		 424 aa  350  3e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  45.12 
 
 		 530 aa  350  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2160  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.5 
 
 		 443 aa  350  4e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.85 
 
 		 451 aa  349  5e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  44.85 
 
 		 636 aa  349  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.5 
 
 		 441 aa  349  6e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  41.01 
 
 		 594 aa  349  6e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  43.13 
 
 		 597 aa  349  6e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  46.68 
 
 		 537 aa  348  9e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.04 
 
 		 452 aa  348  9e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.07 
 
 		 427 aa  348  1e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.48 
 
 		 441 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>