More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1024 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  76.11 
 
 		 407 aa  664    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1024  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 407 aa  833    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  78.62 
 
 		 407 aa  683    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0784  NADH dehydrogenase (quinone)  67.49 
 
 		 408 aa  578  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  52.29 
 
 		 545 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  52.43 
 
 		 545 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  52.44 
 
 		 607 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  52.44 
 
 		 607 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  54.15 
 
 		 597 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  52.54 
 
 		 597 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  54.01 
 
 		 485 aa  442  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  51.22 
 
 		 538 aa  444  1e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  51.95 
 
 		 614 aa  441  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  53.4 
 
 		 594 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  49.15 
 
 		 610 aa  439  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  50.85 
 
 		 602 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  52.7 
 
 		 539 aa  439  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  53.9 
 
 		 572 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  52.8 
 
 		 597 aa  437  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  51.47 
 
 		 572 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  51.82 
 
 		 619 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  49.04 
 
 		 488 aa  432  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  50.85 
 
 		 545 aa  434  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  50.98 
 
 		 614 aa  434  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  51.57 
 
 		 486 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0834  NADH dehydrogenase I, F subunit  52.78 
 
 		 617 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1634  NADP-reducing hydrogenase chain C  51.33 
 
 		 486 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000096005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1844  NADP-reducing hydrogenase chain C  51.33 
 
 		 486 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  54.24 
 
 		 596 aa  426  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1857  NADH dehydrogenase (quinone)  50.49 
 
 		 600 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  53.04 
 
 		 596 aa  422  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  49.4 
 
 		 597 aa  423  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  48.43 
 
 		 570 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  51.22 
 
 		 597 aa  420  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  50.72 
 
 		 590 aa  420  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2304  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  52.32 
 
 		 623 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  52.08 
 
 		 626 aa  417  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  54.35 
 
 		 596 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  48.79 
 
 		 594 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  49.64 
 
 		 604 aa  415  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  54.99 
 
 		 598 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  49.39 
 
 		 592 aa  414  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  50.36 
 
 		 629 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  50.85 
 
 		 575 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  51.82 
 
 		 624 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  51.82 
 
 		 623 aa  409  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  50.24 
 
 		 591 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  47.91 
 
 		 535 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3350  NADH dehydrogenase I, F subunit  50 
 
 		 591 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.051471 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  52.43 
 
 		 624 aa  408  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  46.14 
 
 		 552 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  48.66 
 
 		 562 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  47.69 
 
 		 569 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  49.39 
 
 		 530 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3516  NADH dehydrogenase (quinone)  50.24 
 
 		 488 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4239  NADH dehydrogenase (quinone)  49.52 
 
 		 593 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  49.51 
 
 		 537 aa  402  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  49.03 
 
 		 535 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3921  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  49.39 
 
 		 593 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  50.36 
 
 		 623 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1086  NADH dehydrogenase (quinone)  48.67 
 
 		 526 aa  404  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  49.03 
 
 		 535 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  50.12 
 
 		 626 aa  401  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  49.39 
 
 		 636 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  49.64 
 
 		 588 aa  401  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1545  NADH dehydrogenase (quinone)  47.82 
 
 		 668 aa  401  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  50.36 
 
 		 595 aa  398  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  47.46 
 
 		 677 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4005  NADH dehydrogenase (quinone)  48.91 
 
 		 593 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42089e-25 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  48.43 
 
 		 636 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  48.06 
 
 		 562 aa  397  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3133  NADH dehydrogenase (quinone)  49.64 
 
 		 590 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.846536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  47.92 
 
 		 603 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  49.02 
 
 		 532 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0864  hydrogenase subunit HymB, putative  49.01 
 
 		 640 aa  392  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0914  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  47.8 
 
 		 571 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0279  NADH dehydrogenase (quinone)  47.1 
 
 		 534 aa  394  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4052  NADH dehydrogenase (quinone)  47.57 
 
 		 543 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1718  NADH dehydrogenase (quinone)  52.17 
 
 		 619 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.081204  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  50.36 
 
 		 569 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0844  NADH dehydrogenase (quinone)  48.05 
 
 		 562 aa  389  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0257852  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  47.43 
 
 		 535 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  47.68 
 
 		 623 aa  386  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0471  NADH dehydrogenase (quinone)  49.51 
 
 		 620 aa  387  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000177124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1701  NADH dehydrogenase (quinone)  48.77 
 
 		 604 aa  388  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  46 
 
 		 635 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  45.89 
 
 		 656 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2794  NADH dehydrogenase (quinone)  46.47 
 
 		 572 aa  378  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  49.02 
 
 		 640 aa  381  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  48.41 
 
 		 634 aa  378  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  48.77 
 
 		 641 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1655  NADH dehydrogenase (quinone)  48.28 
 
 		 627 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  45.32 
 
 		 624 aa  378  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0225  NADH dehydrogenase (quinone)  45.26 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.12 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0388  NADH dehydrogenase (quinone)  44.07 
 
 		 523 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0146  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  45.26 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28536  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  47.04 
 
 		 626 aa  371  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  46.68 
 
 		 632 aa  369  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  46.8 
 
 		 626 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>