More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3084 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  100 
 
 
422 aa  868    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.24 
 
 
451 aa  559  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  64.68 
 
 
449 aa  551  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  62.26 
 
 
434 aa  549  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.41 
 
 
438 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  56.17 
 
 
448 aa  453  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.05 
 
 
421 aa  448  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  53.83 
 
 
428 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.07 
 
 
439 aa  442  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.66 
 
 
433 aa  444  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7686  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.01 
 
 
441 aa  438  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  52.15 
 
 
449 aa  438  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.06 
 
 
706 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  55.33 
 
 
445 aa  435  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.44 
 
 
442 aa  435  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  53.44 
 
 
424 aa  432  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  55.06 
 
 
428 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0979  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.92 
 
 
439 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.67 
 
 
434 aa  434  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0474  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.06 
 
 
448 aa  431  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6677  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.75 
 
 
431 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0525  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.37 
 
 
440 aa  431  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4083  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.84 
 
 
446 aa  425  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.323862  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.23 
 
 
444 aa  425  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.56 
 
 
427 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.56 
 
 
427 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2711  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.68 
 
 
444 aa  422  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.62 
 
 
443 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  50.24 
 
 
436 aa  419  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4486  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.37 
 
 
438 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144316  hitchhiker  0.0024852 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3224  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.41 
 
 
439 aa  413  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7014  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.67 
 
 
454 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4458  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.88 
 
 
443 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.29 
 
 
456 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1545  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.53 
 
 
438 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.349481  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.13 
 
 
446 aa  413  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.13 
 
 
447 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1880  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.23 
 
 
441 aa  415  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.5 
 
 
441 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4077  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.17 
 
 
454 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.5 
 
 
441 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.5 
 
 
441 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1575  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.12 
 
 
438 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1599  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.12 
 
 
438 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4060  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.16 
 
 
443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.306589 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  49.88 
 
 
438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5103  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.71 
 
 
446 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1377  NADH dehydrogenase I chain F  47.65 
 
 
448 aa  404  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0721979  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3173  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.85 
 
 
446 aa  401  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1496  NADH dehydrogenase I subunit F  49.38 
 
 
449 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.376582  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2828  NADH dehydrogenase I subunit F  47.71 
 
 
445 aa  398  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.208712  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.57 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  52.07 
 
 
432 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.15 
 
 
441 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.76 
 
 
426 aa  398  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2768  NADH dehydrogenase I subunit F  49.14 
 
 
449 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02209  NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain F  47.57 
 
 
445 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1373  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.57 
 
 
445 aa  396  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00215992  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02169  hypothetical protein  47.57 
 
 
445 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2508  NADH dehydrogenase I subunit F  47.57 
 
 
445 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  48.88 
 
 
427 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2552  NADH dehydrogenase I subunit F  47.57 
 
 
445 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2433  NADH dehydrogenase I subunit F  47.57 
 
 
445 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.28 
 
 
427 aa  396  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2670  NADH dehydrogenase I subunit F  47.57 
 
 
445 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.793863 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3423  NADH dehydrogenase I subunit F  47.57 
 
 
445 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2438  NADH dehydrogenase I subunit F  47.57 
 
 
445 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2563  NADH dehydrogenase I subunit F  47.57 
 
 
445 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2463  NADH dehydrogenase I subunit F  47.57 
 
 
445 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.560534  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1368  NADH dehydrogenase I subunit F  47.57 
 
 
445 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.104051  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2660  NADH dehydrogenase I subunit F  47.57 
 
 
445 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.142172  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2577  NADH dehydrogenase I subunit F  47.57 
 
 
445 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.47 
 
 
424 aa  393  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1718  NADH dehydrogenase I subunit F  53.19 
 
 
434 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3369  NADH dehydrogenase I, F subunit  49.88 
 
 
452 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1458  NADH dehydrogenase I subunit F  48.07 
 
 
461 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1560  NADH dehydrogenase I subunit F  52.53 
 
 
429 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  51.04 
 
 
428 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.74 
 
 
425 aa  388  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1564  NADH dehydrogenase I subunit F  48.07 
 
 
461 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1812  NADH dehydrogenase I subunit F  48.07 
 
 
461 aa  391  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.848425 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3862  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.84 
 
 
443 aa  390  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  52.52 
 
 
430 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  47.6 
 
 
422 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3201  NADH dehydrogenase I subunit F  49.63 
 
 
452 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103684  normal  0.0135586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0894  NADH dehydrogenase I subunit F  51.86 
 
 
434 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13206  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.23 
 
 
442 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  47.6 
 
 
422 aa  388  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  47.68 
 
 
426 aa  387  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1123  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.17 
 
 
429 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1612  NADH dehydrogenase (quinone)  47 
 
 
466 aa  387  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.709157  normal  0.640028 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.28 
 
 
426 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1311  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.47 
 
 
439 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  46.38 
 
 
545 aa  385  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3333  NADH dehydrogenase I subunit F  50.79 
 
 
441 aa  386  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240845  normal  0.194232 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2243  NADH dehydrogenase I subunit F  51.45 
 
 
431 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0486512  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1265  NADH dehydrogenase I subunit F  51.6 
 
 
434 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  46.8 
 
 
545 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1357  NADH dehydrogenase I subunit F  51.86 
 
 
434 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1017  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.13 
 
 
425 aa  383  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>