More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4112 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4112  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  100 
 
 		 656 aa  1298    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  49.4 
 
 		 539 aa  405  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  41.63 
 
 		 610 aa  402  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  41.54 
 
 		 572 aa  390  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  40.38 
 
 		 602 aa  390  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  38.04 
 
 		 614 aa  386  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  48.24 
 
 		 545 aa  387  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  48.9 
 
 		 545 aa  383  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  48.9 
 
 		 545 aa  384  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  38.42 
 
 		 614 aa  385  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  39.73 
 
 		 597 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  42.45 
 
 		 596 aa  385  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  39.66 
 
 		 607 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  39.66 
 
 		 607 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  39.1 
 
 		 594 aa  382  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  47.03 
 
 		 538 aa  377  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1517  NADH dehydrogenase (quinone)  48.51 
 
 		 427 aa  375  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  40.94 
 
 		 596 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0807  NADH dehydrogenase (quinone)  48.34 
 
 		 404 aa  371  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  40.19 
 
 		 629 aa  372  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  38.97 
 
 		 597 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  39.51 
 
 		 535 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  47.87 
 
 		 594 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  45.98 
 
 		 535 aa  365  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  47.99 
 
 		 590 aa  365  1e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  41.35 
 
 		 537 aa  364  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  39.13 
 
 		 535 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1024  NADH dehydrogenase (quinone)  47.04 
 
 		 407 aa  363  5.0000000000000005e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  40.41 
 
 		 604 aa  363  5.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3655  NADH dehydrogenase (quinone)  48.73 
 
 		 516 aa  362  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  38.19 
 
 		 562 aa  361  2e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2384  NADH dehydrogenase (quinone)  47.76 
 
 		 518 aa  361  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.649035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  41.21 
 
 		 532 aa  360  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  40.8 
 
 		 596 aa  360  5e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1545  NADH dehydrogenase (quinone)  49.12 
 
 		 668 aa  358  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  44.73 
 
 		 407 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  46.02 
 
 		 407 aa  359  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  39.63 
 
 		 677 aa  359  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  46.58 
 
 		 488 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0225  NADH dehydrogenase (quinone)  46.97 
 
 		 417 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  36.72 
 
 		 706 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2275  NADH dehydrogenase (quinone)  44.08 
 
 		 522 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.321914 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  38.27 
 
 		 597 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  46.21 
 
 		 485 aa  357  3.9999999999999996e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0146  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  46.97 
 
 		 417 aa  356  6.999999999999999e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  39.56 
 
 		 552 aa  356  6.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1392  formate dehydrogenase, beta subunit  47.68 
 
 		 516 aa  356  8.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_154  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  46.97 
 
 		 417 aa  355  1e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  40.49 
 
 		 626 aa  356  1e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1707  NADH dehydrogenase (quinone)  48.23 
 
 		 519 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  38.42 
 
 		 595 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  44.3 
 
 		 486 aa  353  5e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1634  NADP-reducing hydrogenase chain C  44.56 
 
 		 486 aa  353  5e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000096005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1844  NADP-reducing hydrogenase chain C  44.56 
 
 		 486 aa  353  5e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.38 
 
 		 441 aa  353  5e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.38 
 
 		 441 aa  353  5e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.38 
 
 		 441 aa  353  5e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  38.87 
 
 		 530 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3516  NADH dehydrogenase (quinone)  46.84 
 
 		 488 aa  353  8e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.39 
 
 		 421 aa  352  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3480  NADH dehydrogenase (quinone)  45.23 
 
 		 520 aa  352  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3807  normal  0.394192 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  38.81 
 
 		 624 aa  350  4e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  45.8 
 
 		 572 aa  350  4e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  40.62 
 
 		 634 aa  350  5e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3709  NADH dehydrogenase (quinone)  44.76 
 
 		 520 aa  350  5e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  38.53 
 
 		 624 aa  350  6e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3553  NADH dehydrogenase (quinone)  48.07 
 
 		 519 aa  349  7e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3350  NADH dehydrogenase I, F subunit  45.48 
 
 		 591 aa  350  7e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.051471 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0989  NADH dehydrogenase (quinone)  46.08 
 
 		 516 aa  350  7e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  37.41 
 
 		 597 aa  349  8e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2184  NADH dehydrogenase (quinone)  48.07 
 
 		 525 aa  349  9e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  48.37 
 
 		 598 aa  349  9e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  44.61 
 
 		 591 aa  348  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0388  NADH dehydrogenase (quinone)  47.65 
 
 		 523 aa  348  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  36.7 
 
 		 636 aa  348  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3090  putative formate dehydrogenase beta subunit  46.46 
 
 		 518 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1808  NADH dehydrogenase (quinone)  48.05 
 
 		 519 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.38 
 
 		 441 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  39.16 
 
 		 535 aa  347  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  37.97 
 
 		 603 aa  347  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  40.15 
 
 		 570 aa  346  6e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  40.12 
 
 		 619 aa  347  6e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  36.62 
 
 		 636 aa  346  6e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2559  NADH dehydrogenase (quinone)  44.92 
 
 		 500 aa  346  6e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.72 
 
 		 434 aa  345  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0721  NADH dehydrogenase (quinone)  44.31 
 
 		 516 aa  345  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1860  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  47.43 
 
 		 727 aa  345  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  37.81 
 
 		 588 aa  344  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1655  NADH dehydrogenase (quinone)  39.04 
 
 		 627 aa  345  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  37.69 
 
 		 575 aa  345  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0532  NADH dehydrogenase (quinone)  42.24 
 
 		 620 aa  345  2e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0280377  normal  0.055647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4868  NADH dehydrogenase (quinone)  44.74 
 
 		 519 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00138717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3018  NADH dehydrogenase (quinone)  45.89 
 
 		 519 aa  344  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1701  NADH dehydrogenase (quinone)  45.45 
 
 		 604 aa  344  2.9999999999999997e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4052  NADH dehydrogenase (quinone)  38.85 
 
 		 543 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  38.01 
 
 		 623 aa  343  4e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  40.56 
 
 		 569 aa  343  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4405  NADH dehydrogenase (quinone)  44.74 
 
 		 519 aa  344  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02970  NADH dehydrogenase I subunit F  43.96 
 
 		 408 aa  343  4e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0216  NADH dehydrogenase (quinone)  44.31 
 
 		 425 aa  343  5e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>