More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1450 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  54.31 
 
 		 595 aa  673    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  60.94 
 
 		 623 aa  785    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0864  hydrogenase subunit HymB, putative  62.38 
 
 		 640 aa  854    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  50.65 
 
 		 614 aa  656    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  57.24 
 
 		 597 aa  709    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  52.52 
 
 		 610 aa  667    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  56.18 
 
 		 624 aa  691    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2304  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  50.08 
 
 		 623 aa  644    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  56.35 
 
 		 597 aa  699    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  59.73 
 
 		 596 aa  702    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  68.87 
 
 		 635 aa  935    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  50.24 
 
 		 614 aa  658    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  97.48 
 
 		 636 aa  1245    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  57.73 
 
 		 597 aa  732    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  58.76 
 
 		 592 aa  716    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  100 
 
 		 636 aa  1302    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  60.83 
 
 		 598 aa  687    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  53.47 
 
 		 656 aa  694    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1857  NADH dehydrogenase (quinone)  55.35 
 
 		 600 aa  691    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  55.11 
 
 		 602 aa  703    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  60.13 
 
 		 626 aa  777    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  56.18 
 
 		 597 aa  695    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  55 
 
 		 607 aa  692    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  53.9 
 
 		 597 aa  678    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  50.87 
 
 		 629 aa  645    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  53.7 
 
 		 619 aa  635    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  56.18 
 
 		 596 aa  680    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  62.7 
 
 		 641 aa  835    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1701  NADH dehydrogenase (quinone)  56.59 
 
 		 604 aa  686    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1655  NADH dehydrogenase (quinone)  55.27 
 
 		 627 aa  688    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  55.5 
 
 		 596 aa  678    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  51.3 
 
 		 677 aa  652    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  53.68 
 
 		 603 aa  664    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  54.79 
 
 		 594 aa  687    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  61.97 
 
 		 640 aa  835    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  59.48 
 
 		 623 aa  774    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  51.44 
 
 		 624 aa  635    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  55 
 
 		 607 aa  692    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  52.03 
 
 		 626 aa  633  1e-180  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4239  NADH dehydrogenase (quinone)  52.01 
 
 		 593 aa  620  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  51.17 
 
 		 591 aa  616  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0532  NADH dehydrogenase (quinone)  51.17 
 
 		 620 aa  615  1e-175  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0280377  normal  0.055647 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3350  NADH dehydrogenase I, F subunit  51.93 
 
 		 591 aa  615  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.051471 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3921  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  51.01 
 
 		 593 aa  618  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  51.34 
 
 		 604 aa  618  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4005  NADH dehydrogenase (quinone)  50.17 
 
 		 593 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42089e-25 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0166  NADH dehydrogenase (quinone)  51.91 
 
 		 612 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1718  NADH dehydrogenase (quinone)  53.7 
 
 		 619 aa  612  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.081204  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  51.66 
 
 		 572 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  50.34 
 
 		 588 aa  610  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24670  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  52.99 
 
 		 597 aa  603  1.0000000000000001e-171  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0834  NADH dehydrogenase I, F subunit  50.56 
 
 		 617 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3133  NADH dehydrogenase (quinone)  50.85 
 
 		 590 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.846536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  56.02 
 
 		 572 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  49.58 
 
 		 624 aa  599  1e-170  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  49.11 
 
 		 632 aa  600  1e-170  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0471  NADH dehydrogenase (quinone)  50.16 
 
 		 620 aa  598  1e-170  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000177124  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  50.08 
 
 		 623 aa  595  1e-169  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  50.92 
 
 		 626 aa  598  1e-169  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  49.92 
 
 		 590 aa  597  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  50.92 
 
 		 626 aa  598  1e-169  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0088  NADH dehydrogenase (quinone)  48.96 
 
 		 628 aa  591  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.296083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  50.18 
 
 		 552 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  52.95 
 
 		 575 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  53.45 
 
 		 569 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  49.1 
 
 		 570 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  48.38 
 
 		 634 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 		 562 aa  574  1.0000000000000001e-162  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  55.58 
 
 		 488 aa  568  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  49.49 
 
 		 594 aa  559  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  57.05 
 
 		 485 aa  560  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1634  NADP-reducing hydrogenase chain C  53.81 
 
 		 486 aa  556  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000096005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1844  NADP-reducing hydrogenase chain C  53.81 
 
 		 486 aa  556  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  53.81 
 
 		 486 aa  555  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3516  NADH dehydrogenase (quinone)  55.35 
 
 		 488 aa  553  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  49.02 
 
 		 562 aa  546  1e-154  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1489  NADH dehydrogenase (quinone)  50.46 
 
 		 570 aa  543  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  50.38 
 
 		 530 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1086  NADH dehydrogenase (quinone)  51.17 
 
 		 526 aa  536  1e-151  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1923  NADH dehydrogenase (quinone)  49.91 
 
 		 539 aa  528  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  50.19 
 
 		 535 aa  531  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  48.24 
 
 		 535 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  48.06 
 
 		 535 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  47.6 
 
 		 569 aa  524  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 		 537 aa  523  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1545  NADH dehydrogenase (quinone)  50.78 
 
 		 668 aa  523  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2794  NADH dehydrogenase (quinone)  47.92 
 
 		 572 aa  519  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4052  NADH dehydrogenase (quinone)  49.15 
 
 		 543 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  48.6 
 
 		 532 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0844  NADH dehydrogenase (quinone)  46.89 
 
 		 562 aa  514  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0257852  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  48.75 
 
 		 535 aa  508  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  45.37 
 
 		 545 aa  498  1e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0914  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  46.75 
 
 		 571 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0279  NADH dehydrogenase (quinone)  46.1 
 
 		 534 aa  488  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1539  NADH dehydrogenase (quinone)  46.09 
 
 		 580 aa  485  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  45.61 
 
 		 545 aa  484  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  45.61 
 
 		 545 aa  483  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  43.07 
 
 		 538 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  44.49 
 
 		 539 aa  441  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  50.49 
 
 		 407 aa  432  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>