More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1844 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  64.4 
 
 
597 aa  651    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  66.46 
 
 
614 aa  666    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  63.49 
 
 
607 aa  657    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  67.49 
 
 
596 aa  672    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  63.41 
 
 
597 aa  648    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  99.38 
 
 
486 aa  988    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1634  NADP-reducing hydrogenase chain C  100 
 
 
486 aa  993    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000096005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1844  NADP-reducing hydrogenase chain C  100 
 
 
486 aa  993    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  75.98 
 
 
488 aa  798    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  63.49 
 
 
607 aa  657    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  65.35 
 
 
597 aa  656    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  62.27 
 
 
602 aa  659    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  68.75 
 
 
614 aa  682    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  66.46 
 
 
595 aa  663    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  62.47 
 
 
610 aa  657    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3516  NADH dehydrogenase (quinone)  74.74 
 
 
488 aa  738    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  63.07 
 
 
594 aa  635    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  66.25 
 
 
596 aa  636    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  62.11 
 
 
485 aa  628  1e-179  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  65.01 
 
 
598 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  62.19 
 
 
596 aa  613  9.999999999999999e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1718  NADH dehydrogenase (quinone)  65.22 
 
 
619 aa  608  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.081204  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  59.01 
 
 
604 aa  604  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0834  NADH dehydrogenase I, F subunit  61.83 
 
 
617 aa  600  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  57.71 
 
 
597 aa  592  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  57.11 
 
 
597 aa  587  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  57.44 
 
 
677 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  60.17 
 
 
619 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1857  NADH dehydrogenase (quinone)  57 
 
 
600 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  66.9 
 
 
575 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1086  NADH dehydrogenase (quinone)  57.05 
 
 
526 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  59.34 
 
 
624 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  58.42 
 
 
588 aa  572  1.0000000000000001e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  58.13 
 
 
592 aa  574  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  56.17 
 
 
590 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  55.9 
 
 
594 aa  566  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  57.41 
 
 
634 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  55.6 
 
 
626 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2304  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  55.42 
 
 
623 aa  560  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1655  NADH dehydrogenase (quinone)  58.33 
 
 
627 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  56.13 
 
 
629 aa  553  1e-156  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  61.37 
 
 
572 aa  554  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  55.35 
 
 
656 aa  553  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0532  NADH dehydrogenase (quinone)  54.98 
 
 
620 aa  551  1e-156  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0280377  normal  0.055647 
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  55.93 
 
 
623 aa  549  1e-155  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  54.58 
 
 
591 aa  550  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3350  NADH dehydrogenase I, F subunit  55 
 
 
591 aa  550  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.051471 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  55.51 
 
 
623 aa  550  1e-155  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  56.73 
 
 
603 aa  551  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  63.74 
 
 
572 aa  545  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  55.3 
 
 
626 aa  544  1e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  54.15 
 
 
624 aa  543  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3133  NADH dehydrogenase (quinone)  55.21 
 
 
590 aa  543  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.846536  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0166  NADH dehydrogenase (quinone)  54.66 
 
 
612 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  53.81 
 
 
636 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4239  NADH dehydrogenase (quinone)  54.79 
 
 
593 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3921  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  53.96 
 
 
593 aa  536  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  53.4 
 
 
636 aa  535  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0088  NADH dehydrogenase (quinone)  54.41 
 
 
628 aa  536  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.296083  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1701  NADH dehydrogenase (quinone)  53.96 
 
 
604 aa  536  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4005  NADH dehydrogenase (quinone)  53.75 
 
 
593 aa  534  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42089e-25 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  54.72 
 
 
624 aa  533  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  53.07 
 
 
635 aa  532  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  56.87 
 
 
552 aa  528  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  59.42 
 
 
535 aa  521  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  55.36 
 
 
626 aa  523  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  55.36 
 
 
626 aa  524  1e-147  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0864  hydrogenase subunit HymB, putative  51.86 
 
 
640 aa  520  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  55.15 
 
 
623 aa  518  1e-146  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  54.72 
 
 
632 aa  515  1.0000000000000001e-145  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  55.69 
 
 
570 aa  513  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  60.24 
 
 
537 aa  514  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  52.07 
 
 
640 aa  510  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  59.19 
 
 
530 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  61.61 
 
 
569 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  51.86 
 
 
641 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  58.8 
 
 
532 aa  503  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24670  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  51.13 
 
 
597 aa  501  1e-141  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  55.98 
 
 
562 aa  504  1e-141  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  54.93 
 
 
569 aa  499  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  57.18 
 
 
535 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  57.18 
 
 
535 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1923  NADH dehydrogenase (quinone)  58.22 
 
 
539 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4052  NADH dehydrogenase (quinone)  59.32 
 
 
543 aa  491  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0279  NADH dehydrogenase (quinone)  56.8 
 
 
534 aa  491  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2794  NADH dehydrogenase (quinone)  55.08 
 
 
572 aa  488  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1545  NADH dehydrogenase (quinone)  56.66 
 
 
668 aa  489  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  58.09 
 
 
535 aa  484  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  53.05 
 
 
545 aa  480  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0471  NADH dehydrogenase (quinone)  50.72 
 
 
620 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000177124  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  52 
 
 
545 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  53.77 
 
 
562 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  51.76 
 
 
545 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0844  NADH dehydrogenase (quinone)  54.48 
 
 
562 aa  462  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0257852  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0914  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  55.18 
 
 
571 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  49.65 
 
 
538 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  50.71 
 
 
539 aa  441  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1539  NADH dehydrogenase (quinone)  50.71 
 
 
580 aa  435  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  52.54 
 
 
407 aa  431  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1489  NADH dehydrogenase (quinone)  51.28 
 
 
570 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>