More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0720 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 545 aa  1095    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  69.06 
 
 		 539 aa  743    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  99.63 
 
 		 545 aa  1093    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  67.3 
 
 		 538 aa  756    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  53.88 
 
 		 545 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  52.26 
 
 		 607 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  52.26 
 
 		 607 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  50.94 
 
 		 610 aa  557  1e-157  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  51.03 
 
 		 602 aa  556  1e-157  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 		 597 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  52.74 
 
 		 596 aa  536  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  47.64 
 
 		 614 aa  526  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  49.72 
 
 		 597 aa  519  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  49.81 
 
 		 596 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  47.92 
 
 		 597 aa  509  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  49.62 
 
 		 597 aa  511  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  47.74 
 
 		 572 aa  509  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  47.92 
 
 		 614 aa  511  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  50.78 
 
 		 572 aa  507  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  48.3 
 
 		 595 aa  504  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  48.13 
 
 		 594 aa  498  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  52.45 
 
 		 598 aa  500  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  47.93 
 
 		 597 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  46.97 
 
 		 592 aa  489  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  51.18 
 
 		 596 aa  491  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  48.89 
 
 		 562 aa  482  1e-135  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 		 626 aa  483  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  48.06 
 
 		 624 aa  484  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1857  NADH dehydrogenase (quinone)  48.94 
 
 		 600 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  46.57 
 
 		 624 aa  479  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  47.36 
 
 		 677 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  56.03 
 
 		 485 aa  480  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  45.78 
 
 		 604 aa  474  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  51.17 
 
 		 488 aa  474  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  47.66 
 
 		 569 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  53.64 
 
 		 407 aa  473  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1545  NADH dehydrogenase (quinone)  47.7 
 
 		 668 aa  472  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  52 
 
 		 486 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  45.61 
 
 		 636 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  45.42 
 
 		 636 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  46.37 
 
 		 619 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  44.03 
 
 		 570 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1634  NADP-reducing hydrogenase chain C  51.76 
 
 		 486 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000096005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1844  NADP-reducing hydrogenase chain C  51.76 
 
 		 486 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1701  NADH dehydrogenase (quinone)  45.68 
 
 		 604 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  44.74 
 
 		 629 aa  465  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2304  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  45.44 
 
 		 623 aa  464  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4005  NADH dehydrogenase (quinone)  44.49 
 
 		 593 aa  463  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42089e-25 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  52.43 
 
 		 407 aa  464  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  43.71 
 
 		 552 aa  464  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  44.59 
 
 		 591 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3921  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  45.05 
 
 		 593 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3350  NADH dehydrogenase I, F subunit  45.15 
 
 		 591 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.051471 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4239  NADH dehydrogenase (quinone)  44.11 
 
 		 593 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0864  hydrogenase subunit HymB, putative  45.2 
 
 		 640 aa  458  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3133  NADH dehydrogenase (quinone)  44.67 
 
 		 590 aa  458  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.846536  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  44.3 
 
 		 624 aa  456  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1718  NADH dehydrogenase (quinone)  48.02 
 
 		 619 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.081204  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  42.7 
 
 		 594 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  45.83 
 
 		 603 aa  457  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  48.39 
 
 		 575 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0834  NADH dehydrogenase I, F subunit  46.08 
 
 		 617 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  44.44 
 
 		 588 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  44.17 
 
 		 635 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  45.24 
 
 		 626 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1024  NADH dehydrogenase (quinone)  52.43 
 
 		 407 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3516  NADH dehydrogenase (quinone)  51.77 
 
 		 488 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  45.05 
 
 		 626 aa  451  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  52.21 
 
 		 590 aa  451  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  44.15 
 
 		 623 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1655  NADH dehydrogenase (quinone)  44.61 
 
 		 627 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  44.44 
 
 		 640 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  44.53 
 
 		 623 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1923  NADH dehydrogenase (quinone)  46.82 
 
 		 539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  43.61 
 
 		 641 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  44.44 
 
 		 656 aa  445  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  42.4 
 
 		 569 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  44.15 
 
 		 626 aa  443  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  42.78 
 
 		 632 aa  441  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  46.03 
 
 		 535 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  46.24 
 
 		 532 aa  435  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  44.13 
 
 		 562 aa  436  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  43.59 
 
 		 623 aa  437  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  48.65 
 
 		 537 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  45.15 
 
 		 535 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  44.71 
 
 		 634 aa  433  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1086  NADH dehydrogenase (quinone)  49.17 
 
 		 526 aa  429  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1539  NADH dehydrogenase (quinone)  42.65 
 
 		 580 aa  429  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2794  NADH dehydrogenase (quinone)  48.59 
 
 		 572 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  43.57 
 
 		 535 aa  428  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0914  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  42.7 
 
 		 571 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0532  NADH dehydrogenase (quinone)  45.93 
 
 		 620 aa  427  1e-118  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0280377  normal  0.055647 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0784  NADH dehydrogenase (quinone)  51.09 
 
 		 408 aa  428  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0166  NADH dehydrogenase (quinone)  47.74 
 
 		 612 aa  428  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.16 
 
 		 421 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0088  NADH dehydrogenase (quinone)  44.01 
 
 		 628 aa  423  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.296083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  44.29 
 
 		 530 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  46.6 
 
 		 535 aa  419  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4052  NADH dehydrogenase (quinone)  44.29 
 
 		 543 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.56 
 
 		 427 aa  413  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>