More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0377 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02209  NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain F  75.74 
 
 
445 aa  692    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1373  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.74 
 
 
445 aa  692    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00215992  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2563  NADH dehydrogenase I subunit F  75.51 
 
 
445 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2566  NADH dehydrogenase I subunit F  72.3 
 
 
448 aa  651    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4123  NADH dehydrogenase I subunit F  70.6 
 
 
453 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1368  NADH dehydrogenase I subunit F  75.96 
 
 
445 aa  694    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.104051  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2828  NADH dehydrogenase I subunit F  74.83 
 
 
445 aa  685    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.208712  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1017  NADH dehydrogenase I subunit F  70.39 
 
 
461 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3369  NADH dehydrogenase I, F subunit  70.99 
 
 
452 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1496  NADH dehydrogenase I subunit F  75.06 
 
 
449 aa  700    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.376582  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3201  NADH dehydrogenase I subunit F  70.75 
 
 
452 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103684  normal  0.0135586 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1398  NADH dehydrogenase I subunit F  74.38 
 
 
449 aa  676    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.940574  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2552  NADH dehydrogenase I subunit F  75.51 
 
 
445 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2546  NADH dehydrogenase I subunit F  74.38 
 
 
449 aa  671    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698943  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2768  NADH dehydrogenase I subunit F  75.51 
 
 
449 aa  703    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1564  NADH dehydrogenase I subunit F  74.55 
 
 
461 aa  704    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2660  NADH dehydrogenase I subunit F  75.96 
 
 
445 aa  694    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.142172  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1869  NADH dehydrogenase I subunit F  69.91 
 
 
458 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.123144 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3423  NADH dehydrogenase I subunit F  75.96 
 
 
445 aa  694    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28480  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  70.34 
 
 
449 aa  637    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2463  NADH dehydrogenase I subunit F  75.51 
 
 
445 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.560534  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3695  NADH dehydrogenase I subunit F  71.46 
 
 
454 aa  638    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196409  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2508  NADH dehydrogenase I subunit F  75.51 
 
 
445 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1742  NADH dehydrogenase I subunit F  70.6 
 
 
453 aa  644    Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00767478  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2433  NADH dehydrogenase I subunit F  75.96 
 
 
445 aa  694    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1458  NADH dehydrogenase I subunit F  74.55 
 
 
461 aa  704    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2577  NADH dehydrogenase I subunit F  75.96 
 
 
445 aa  694    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0377  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  100 
 
 
444 aa  911    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.372414  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1812  NADH dehydrogenase I subunit F  74.55 
 
 
461 aa  704    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.848425 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3304  NADH dehydrogenase I subunit F  75.28 
 
 
450 aa  704    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0360562  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2438  NADH dehydrogenase I subunit F  75.74 
 
 
445 aa  692    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02169  hypothetical protein  75.74 
 
 
445 aa  692    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2670  NADH dehydrogenase I subunit F  75.51 
 
 
445 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.793863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2416  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  70.12 
 
 
448 aa  630  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0718255  normal  0.148536 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3607  NADH dehydrogenase I subunit F  69.81 
 
 
451 aa  624  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29970  NADH dehydrogenase I subunit F  66.04 
 
 
449 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3128  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.62 
 
 
446 aa  514  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  59.47 
 
 
427 aa  503  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0588  NADH dehydrogenase I, F subunit  60.14 
 
 
474 aa  503  1e-141  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1695  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.81 
 
 
537 aa  504  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.316564  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0577  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  58.09 
 
 
474 aa  503  1e-141  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1123  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  56.84 
 
 
429 aa  501  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2864  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.64 
 
 
454 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  hitchhiker  0.00675695 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1017  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.65 
 
 
425 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3821  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.42 
 
 
426 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.400637  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1116  NADH dehydrogenase (quinone)  51.2 
 
 
434 aa  443  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.66 
 
 
447 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0714  NADH dehydrogenase (quinone)  54.35 
 
 
428 aa  418  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.12 
 
 
443 aa  418  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4067  NADH dehydrogenase (quinone)  50.84 
 
 
428 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0902793  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7686  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.91 
 
 
441 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.52 
 
 
421 aa  398  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.28 
 
 
438 aa  395  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.22 
 
 
706 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3441  NADH dehydrogenase I, F subunit  49.5 
 
 
423 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0208  NADH dehydrogenase I chain F  51.57 
 
 
425 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0157  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  48.67 
 
 
422 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.93 
 
 
434 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  48.46 
 
 
445 aa  388  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.17 
 
 
442 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  47.45 
 
 
424 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1740  NADH dehydrogenase (quinone)  46.3 
 
 
416 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0104  respiratory-chain NADH dehydrogenase, 51 kDa subunit  46.3 
 
 
416 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.24 
 
 
433 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6677  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.46 
 
 
431 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1693  NADH dehydrogenase (quinone)  45.35 
 
 
416 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0681624  normal  0.883791 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.12 
 
 
434 aa  379  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0329  NADH dehydrogenase (quinone)  47.39 
 
 
433 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.95 
 
 
448 aa  376  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.47 
 
 
439 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4458  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.47 
 
 
443 aa  376  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4060  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.23 
 
 
443 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.306589 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.37 
 
 
446 aa  372  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0158  NADH dehydrogenase (quinone)  47.84 
 
 
421 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0525  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.17 
 
 
440 aa  373  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0176  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  47.58 
 
 
421 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3862  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.78 
 
 
443 aa  369  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  48.45 
 
 
428 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.24 
 
 
444 aa  371  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  45.91 
 
 
449 aa  365  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.42 
 
 
422 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4739  NADH dehydrogenase (quinone)  51.2 
 
 
428 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4486  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.81 
 
 
438 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144316  hitchhiker  0.0024852 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  48.24 
 
 
438 aa  367  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  45.07 
 
 
539 aa  364  2e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1330  NADH dehydrogenase (quinone)  50.24 
 
 
428 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.220778  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  46.1 
 
 
436 aa  364  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  48.96 
 
 
428 aa  363  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1880  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.56 
 
 
441 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1279  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  47.85 
 
 
438 aa  362  6e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0474  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.17 
 
 
448 aa  359  4e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3224  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.43 
 
 
439 aa  359  5e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1575  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.43 
 
 
438 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1599  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.43 
 
 
438 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1351  NADH dehydrogenase (quinone)  50.24 
 
 
428 aa  359  6e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.169855 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1545  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.43 
 
 
438 aa  359  7e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.349481  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2711  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.74 
 
 
444 aa  358  8e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.15 
 
 
451 aa  358  9e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  44.31 
 
 
545 aa  358  9e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.1 
 
 
427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>