More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1925 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1925  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  100 
 
 		 445 aa  913    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.58 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.58 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.58 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.11 
 
 		 433 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.02 
 
 		 441 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4083  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.46 
 
 		 446 aa  418  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.323862  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.47 
 
 		 426 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.17 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  48.73 
 
 		 425 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  48.73 
 
 		 425 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.78 
 
 		 456 aa  412  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.53 
 
 		 444 aa  414  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50 
 
 		 425 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  49.53 
 
 		 428 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.17 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.46 
 
 		 448 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.53 
 
 		 447 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.42 
 
 		 421 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1311  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.46 
 
 		 439 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.31 
 
 		 425 aa  411  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4077  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.54 
 
 		 454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.3 
 
 		 443 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  49.53 
 
 		 428 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  48.8 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  48.74 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  47.18 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1179  NADH dehydrogenase I subunit F  47.6 
 
 		 431 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.049393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6677  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.96 
 
 		 431 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.88 
 
 		 424 aa  403  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  48.41 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.26 
 
 		 706 aa  398  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0474  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.45 
 
 		 448 aa  396  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7686  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.14 
 
 		 441 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1882  NADH dehydrogenase I subunit F  49.21 
 
 		 441 aa  395  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  48.14 
 
 		 449 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2711  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.93 
 
 		 444 aa  398  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0714  NADH dehydrogenase I subunit F  48.16 
 
 		 413 aa  397  1e-109  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.657968  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0748  NADH dehydrogenase I subunit F  47.83 
 
 		 432 aa  398  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1027  NADH dehydrogenase I subunit F  47.83 
 
 		 434 aa  395  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1377  NADH dehydrogenase I chain F  50 
 
 		 448 aa  395  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0721979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.97 
 
 		 434 aa  395  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0633  NADH dehydrogenase (quinone)  48.1 
 
 		 427 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1628  NADH dehydrogenase (quinone)  48.1 
 
 		 427 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3188  NADH dehydrogenase (quinone)  48.1 
 
 		 427 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2243  NADH dehydrogenase I subunit F  47.71 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0486512  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5103  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.89 
 
 		 446 aa  392  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.45 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2518  NADH dehydrogenase I subunit F  46.79 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5175  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.19 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  48.47 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  48.65 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  48.47 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1560  NADH dehydrogenase I subunit F  48.74 
 
 		 429 aa  393  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2215  NADH dehydrogenase I subunit F  48.75 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1718  NADH dehydrogenase I subunit F  47.83 
 
 		 434 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2001  NADH dehydrogenase I subunit F  47.02 
 
 		 431 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1180  NADH dehydrogenase I subunit F  46.79 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258408  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0481  NADH dehydrogenase (quinone)  46.52 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0525  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.64 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  46.76 
 
 		 438 aa  393  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.18 
 
 		 426 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.98 
 
 		 439 aa  391  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0486  NADH dehydrogenase I subunit F  46.79 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1612  NADH dehydrogenase (quinone)  47.5 
 
 		 466 aa  390  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.709157  normal  0.640028 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.7 
 
 		 442 aa  391  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0783  NADH dehydrogenase I subunit F  46.94 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.860034  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.41 
 
 		 452 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4556  NADH dehydrogenase I subunit F  49.05 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2923  NADH dehydrogenase I subunit F  49.17 
 
 		 436 aa  386  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.99 
 
 		 442 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.28 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2056  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.94 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  47.5 
 
 		 432 aa  385  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  46.8 
 
 		 430 aa  388  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1575  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.53 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1599  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.53 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0926  NADH dehydrogenase I subunit F  46.05 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0894  NADH dehydrogenase I subunit F  46.79 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.24 
 
 		 452 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7014  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.8 
 
 		 454 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01292  NADH-quinone oxidoreductase, f subunit  45.95 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.314011  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  47.17 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1545  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.07 
 
 		 438 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.349481  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0962  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.54 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089517 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0548  NADH dehydrogenase I subunit F  48.52 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1265  NADH dehydrogenase I subunit F  47.6 
 
 		 434 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.73 
 
 		 422 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1357  NADH dehydrogenase I subunit F  47.37 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43944  predicted protein  46.68 
 
 		 493 aa  383  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323695  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3505  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.29 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0877  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.78 
 
 		 453 aa  385  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.1 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0976  NADH dehydrogenase I subunit F  46.39 
 
 		 417 aa  381  1e-104  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0979  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.17 
 
 		 439 aa  381  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.92 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2394  NADH dehydrogenase I subunit F  48.24 
 
 		 436 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.140128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.23 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3224  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.15 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4486  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.08 
 
 		 438 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144316  hitchhiker  0.0024852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>