More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7014 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  70.91 
 
 
456 aa  663    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7014  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  100 
 
 
454 aa  934    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4077  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  73.5 
 
 
454 aa  699    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1377  NADH dehydrogenase I chain F  74.53 
 
 
448 aa  652    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0721979  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4083  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  70.67 
 
 
446 aa  654    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.323862  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5103  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  69.12 
 
 
446 aa  621  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.12 
 
 
424 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.64 
 
 
427 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.3 
 
 
421 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.64 
 
 
427 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.88 
 
 
425 aa  421  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.67 
 
 
422 aa  419  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  48.9 
 
 
436 aa  417  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.61 
 
 
442 aa  418  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.84 
 
 
426 aa  418  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.84 
 
 
441 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.84 
 
 
441 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.14 
 
 
429 aa  412  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.84 
 
 
441 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  48.12 
 
 
422 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  47.89 
 
 
422 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.64 
 
 
431 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3209  putative NADH dehydrogenase I (chain F), NuoF  49.39 
 
 
442 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489699  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.64 
 
 
431 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.76 
 
 
425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  49.39 
 
 
431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.14 
 
 
442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020872  hitchhiker  0.00762126 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.54 
 
 
425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  51.49 
 
 
433 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  48.54 
 
 
426 aa  405  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.96 
 
 
441 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.59 
 
 
444 aa  403  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0932  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.66 
 
 
431 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5981  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2160  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.97 
 
 
443 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.92 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.25 
 
 
427 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.4 
 
 
442 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1408  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 
448 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344302  normal  0.160337 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.06 
 
 
426 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1304  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.92 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.92 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  50.49 
 
 
428 aa  401  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.88 
 
 
458 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.51 
 
 
467 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.17 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.121706  normal  0.072136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1311  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.72 
 
 
439 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1632  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.17 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1295  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.17 
 
 
436 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2244  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.17 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1612  NADH dehydrogenase (quinone)  49.64 
 
 
466 aa  400  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.709157  normal  0.640028 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.09 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.63 
 
 
452 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  47.68 
 
 
436 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0418  NADH dehydrogenase I, F subunit  47.68 
 
 
436 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  47.68 
 
 
436 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.92 
 
 
436 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1560  NADH dehydrogenase I subunit F  51.64 
 
 
429 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.68 
 
 
440 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1135  NADH dehydrogenase I, F subunit  47.68 
 
 
436 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305748  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1179  NADH dehydrogenase I subunit F  51 
 
 
431 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.049393  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0748  NADH dehydrogenase I subunit F  51 
 
 
432 aa  398  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147388  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1925  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.8 
 
 
445 aa  396  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3505  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.38 
 
 
446 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2282  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.43 
 
 
436 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.502286  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0966  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.39 
 
 
431 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2518  NADH dehydrogenase I subunit F  49.74 
 
 
431 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2001  NADH dehydrogenase I subunit F  50.51 
 
 
431 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50 
 
 
451 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.35 
 
 
426 aa  392  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.53 
 
 
449 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1180  NADH dehydrogenase I subunit F  49.74 
 
 
431 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258408  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  50.25 
 
 
432 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.71 
 
 
452 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1033  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.92 
 
 
436 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.970624  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  48.3 
 
 
425 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  48.3 
 
 
425 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2923  NADH dehydrogenase I subunit F  50.24 
 
 
436 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  49.26 
 
 
430 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0877  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.62 
 
 
453 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1027  NADH dehydrogenase I subunit F  48.48 
 
 
434 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0633  NADH dehydrogenase (quinone)  49.88 
 
 
427 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1628  NADH dehydrogenase (quinone)  49.88 
 
 
427 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3188  NADH dehydrogenase (quinone)  49.88 
 
 
427 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2243  NADH dehydrogenase I subunit F  50 
 
 
431 aa  391  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0486512  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5175  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.19 
 
 
452 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82972  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3221  NADH dehydrogenase I subunit F  51.3 
 
 
429 aa  388  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0894  NADH dehydrogenase I subunit F  50 
 
 
434 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13206  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2394  NADH dehydrogenase I subunit F  50.72 
 
 
436 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.140128  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  50.25 
 
 
438 aa  388  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.25 
 
 
438 aa  386  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0486  NADH dehydrogenase I subunit F  49.87 
 
 
427 aa  387  1e-106  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  50.12 
 
 
428 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3333  NADH dehydrogenase I subunit F  49.14 
 
 
441 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240845  normal  0.194232 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.51 
 
 
439 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1014  NADH dehydrogenase I subunit F  52.15 
 
 
433 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1080  NADH dehydrogenase I subunit F  52.41 
 
 
433 aa  388  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4131  NADH dehydrogenase I subunit F  48.51 
 
 
433 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.519753  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43944  predicted protein  49.88 
 
 
493 aa  388  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323695  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1209  NADH dehydrogenase I subunit F  52.41 
 
 
433 aa  388  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335616  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.42 
 
 
448 aa  385  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.789941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>