More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0481 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0481  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 452 aa  939    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1612  NADH dehydrogenase (quinone)  58.58 
 
 		 466 aa  536  1e-151  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.709157  normal  0.640028 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.42 
 
 		 441 aa  421  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.42 
 
 		 441 aa  421  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.42 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.78 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.05 
 
 		 456 aa  401  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4083  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.94 
 
 		 446 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.323862  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1925  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.52 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  48.03 
 
 		 426 aa  394  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4077  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.9 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  45.17 
 
 		 436 aa  393  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1377  NADH dehydrogenase I chain F  46.65 
 
 		 448 aa  389  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0721979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.94 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  44.74 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.61 
 
 		 442 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.29 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.96 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.19 
 
 		 422 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0486  NADH dehydrogenase I subunit F  48.28 
 
 		 427 aa  381  1e-104  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.61 
 
 		 440 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.02 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0548  NADH dehydrogenase I subunit F  48.04 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1632  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.61 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2160  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.76 
 
 		 443 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.02 
 
 		 431 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2244  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.61 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  46.54 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  46.28 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  46.28 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1304  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.37 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.37 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.34 
 
 		 444 aa  378  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.13 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.121706  normal  0.072136 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.37 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.51 
 
 		 425 aa  378  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.61 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.26 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0932  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.26 
 
 		 431 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1295  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.37 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.41 
 
 		 427 aa  378  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2282  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.37 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.502286  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.23 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0633  NADH dehydrogenase (quinone)  46.21 
 
 		 427 aa  375  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1628  NADH dehydrogenase (quinone)  46.21 
 
 		 427 aa  375  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3188  NADH dehydrogenase (quinone)  46.21 
 
 		 427 aa  375  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.41 
 
 		 427 aa  378  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1135  NADH dehydrogenase I, F subunit  47.37 
 
 		 436 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305748  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  47.37 
 
 		 436 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0418  NADH dehydrogenase I, F subunit  47.37 
 
 		 436 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1560  NADH dehydrogenase I subunit F  50 
 
 		 429 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3209  putative NADH dehydrogenase I (chain F), NuoF  46.89 
 
 		 442 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1311  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.73 
 
 		 439 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4395  NADH dehydrogenase I subunit F  46.62 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4556  NADH dehydrogenase I subunit F  47.33 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  47.37 
 
 		 436 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.45 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.21 
 
 		 425 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.05 
 
 		 449 aa  372  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  45.01 
 
 		 428 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0966  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.49 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.12 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.48 
 
 		 426 aa  371  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3221  NADH dehydrogenase I subunit F  49.61 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  45.56 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.89 
 
 		 442 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020872  hitchhiker  0.00762126 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7014  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.8 
 
 		 454 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  45.67 
 
 		 422 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  45.33 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1033  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.49 
 
 		 436 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.970624  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.52 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0926  NADH dehydrogenase I subunit F  45.5 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04070  NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit, putative  45.97 
 
 		 534 aa  366  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1080  NADH dehydrogenase I subunit F  46.5 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0714  NADH dehydrogenase I subunit F  44.77 
 
 		 413 aa  365  1e-100  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.657968  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1014  NADH dehydrogenase I subunit F  46.73 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.74 
 
 		 467 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  45.67 
 
 		 422 aa  366  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5103  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.76 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4131  NADH dehydrogenase I subunit F  45.69 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.519753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.66 
 
 		 447 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1209  NADH dehydrogenase I subunit F  46.5 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2055  NADH dehydrogenase I subunit F  45.79 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.23 
 
 		 429 aa  365  1e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2215  NADH dehydrogenase I subunit F  46.89 
 
 		 441 aa  364  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3862  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.62 
 
 		 443 aa  365  1e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  45.5 
 
 		 432 aa  363  3e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.17 
 
 		 443 aa  363  3e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1747  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.45 
 
 		 439 aa  363  3e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.76 
 
 		 438 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1882  NADH dehydrogenase I subunit F  47 
 
 		 441 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0877  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.23 
 
 		 453 aa  362  6e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1718  NADH dehydrogenase I subunit F  45.28 
 
 		 434 aa  362  6e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.13 
 
 		 451 aa  362  9e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0962  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.01 
 
 		 453 aa  361  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089517 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.8 
 
 		 448 aa  361  1e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.5 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1357  NADH dehydrogenase I subunit F  45.99 
 
 		 434 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1179  NADH dehydrogenase I subunit F  47.26 
 
 		 431 aa  360  4e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.049393  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>