More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0294 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1281  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  60.44 
 
 		 565 aa  640    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.532683  normal  0.302449 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6172  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  92.31 
 
 		 572 aa  1062    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2577  dehydrogenase subunit, putative  62.02 
 
 		 561 aa  669    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4581  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  95.45 
 
 		 572 aa  1095    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.531155 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4652  NADH dehydrogenase (quinone)  60.43 
 
 		 580 aa  649    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198503  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5227  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  83.19 
 
 		 572 aa  961    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00138692  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3267  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  83.71 
 
 		 572 aa  997    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00072788  normal  0.294343 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  64.04 
 
 		 566 aa  652    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235735  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3191  NADH dehydrogenase (quinone)  60.47 
 
 		 562 aa  640    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5042  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  95.45 
 
 		 572 aa  1096    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.558734  normal  0.200825 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0294  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  100 
 
 		 572 aa  1167    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.972061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8359  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  83.89 
 
 		 567 aa  960    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2512  NADH dehydrogenase (quinone)  59.23 
 
 		 563 aa  632  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.477577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4073  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  57.39 
 
 		 612 aa  628  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3925  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  56.43 
 
 		 562 aa  621  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1110  NADH dehydrogenase (quinone)  56.26 
 
 		 600 aa  620  1e-176  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2428  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  57.27 
 
 		 557 aa  610  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0825  NADH dehydrogenase (quinone)  56.56 
 
 		 600 aa  606  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3471  NADH dehydrogenase (quinone)  54.97 
 
 		 640 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119325 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0338  NADH dehydrogenase (quinone)  58.97 
 
 		 573 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0996  NADH dehydrogenase (quinone)  55.38 
 
 		 595 aa  594  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3270  NADH dehydrogenase (quinone)  56.28 
 
 		 591 aa  587  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2798  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  53.26 
 
 		 661 aa  588  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0743425  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2822  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  57.66 
 
 		 585 aa  568  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112551  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  35.78 
 
 		 602 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4112  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  35.6 
 
 		 656 aa  311  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  34.88 
 
 		 610 aa  307  3e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  40.78 
 
 		 407 aa  302  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  35.6 
 
 		 552 aa  300  7e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  34.16 
 
 		 535 aa  298  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  41.21 
 
 		 545 aa  298  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  34.43 
 
 		 607 aa  295  2e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  34.43 
 
 		 607 aa  295  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  40.52 
 
 		 407 aa  295  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  34.13 
 
 		 623 aa  293  4e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3862  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.65 
 
 		 443 aa  294  4e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.65 
 
 		 434 aa  293  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  34.12 
 
 		 572 aa  293  8e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1024  NADH dehydrogenase (quinone)  41.04 
 
 		 407 aa  292  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  35.42 
 
 		 532 aa  290  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  34.36 
 
 		 626 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  35.4 
 
 		 537 aa  290  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.1 
 
 		 421 aa  289  9e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2864  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.25 
 
 		 454 aa  289  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  hitchhiker  0.00675695 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  34.27 
 
 		 597 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.6 
 
 		 422 aa  287  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  41.65 
 
 		 427 aa  286  5e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  33.98 
 
 		 623 aa  286  8e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  34.44 
 
 		 530 aa  286  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  35.11 
 
 		 570 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 629 aa  283  7.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  33.9 
 
 		 624 aa  282  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  40.05 
 
 		 624 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  36.95 
 
 		 594 aa  281  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  38.12 
 
 		 545 aa  280  4e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  38.12 
 
 		 545 aa  280  5e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  34.18 
 
 		 569 aa  279  8e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  36.43 
 
 		 535 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  34.1 
 
 		 597 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02970  NADH dehydrogenase I subunit F  40.81 
 
 		 408 aa  278  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1123  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.26 
 
 		 429 aa  278  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  34.38 
 
 		 626 aa  277  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  32.5 
 
 		 597 aa  278  3e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.63 
 
 		 443 aa  277  4e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  40.31 
 
 		 539 aa  277  4e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_154  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  40.3 
 
 		 417 aa  277  5e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0216  NADH dehydrogenase (quinone)  39.85 
 
 		 425 aa  276  6e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  33.78 
 
 		 595 aa  276  6e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  31.98 
 
 		 614 aa  276  7e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  32.64 
 
 		 596 aa  276  8e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0225  NADH dehydrogenase (quinone)  39.8 
 
 		 417 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1017  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.15 
 
 		 425 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.32 
 
 		 451 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.86 
 
 		 456 aa  274  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  38.01 
 
 		 632 aa  274  3e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  31.2 
 
 		 614 aa  274  3e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1612  NADH dehydrogenase (quinone)  38.29 
 
 		 466 aa  273  4.0000000000000004e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.709157  normal  0.640028 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  34.7 
 
 		 677 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  40.31 
 
 		 656 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0146  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  39.55 
 
 		 417 aa  272  1e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  37.84 
 
 		 635 aa  272  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1655  NADH dehydrogenase (quinone)  39.85 
 
 		 627 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  32.81 
 
 		 535 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  32.81 
 
 		 535 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  40.59 
 
 		 433 aa  270  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1517  NADH dehydrogenase (quinone)  39.29 
 
 		 427 aa  270  4e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40 
 
 		 426 aa  270  5e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.31 
 
 		 449 aa  270  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  38.27 
 
 		 538 aa  270  5e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  39.19 
 
 		 591 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  38.31 
 
 		 424 aa  270  7e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4458  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.5 
 
 		 443 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  37.87 
 
 		 426 aa  269  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  40.46 
 
 		 592 aa  269  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  33.66 
 
 		 604 aa  269  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.44 
 
 		 441 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.44 
 
 		 441 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.44 
 
 		 441 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  39.04 
 
 		 624 aa  268  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.73 
 
 		 447 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0248618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>