More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1110 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2577  dehydrogenase subunit, putative  63.26 
 
 
561 aa  737    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2798  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  65.82 
 
 
661 aa  821    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0743425  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4652  NADH dehydrogenase (quinone)  62.89 
 
 
580 aa  733    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198503  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0338  NADH dehydrogenase (quinone)  62.31 
 
 
573 aa  726    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3270  NADH dehydrogenase (quinone)  65.37 
 
 
591 aa  790    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  63.12 
 
 
566 aa  736    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235735  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1110  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
600 aa  1241    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2512  NADH dehydrogenase (quinone)  59.38 
 
 
563 aa  669    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.477577  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4073  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  73.69 
 
 
612 aa  902    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0825  NADH dehydrogenase (quinone)  71.29 
 
 
600 aa  886    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3471  NADH dehydrogenase (quinone)  70.17 
 
 
640 aa  865    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.119325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3267  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  55.91 
 
 
572 aa  624  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00072788  normal  0.294343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5227  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  56.26 
 
 
572 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00138692  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8359  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  56.26 
 
 
567 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6172  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  55.87 
 
 
572 aa  601  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1281  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  55.48 
 
 
565 aa  601  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.532683  normal  0.302449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5042  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  55.91 
 
 
572 aa  598  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.558734  normal  0.200825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4581  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  55.91 
 
 
572 aa  596  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.531155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0294  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  56.26 
 
 
572 aa  596  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.972061  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3191  NADH dehydrogenase (quinone)  55.01 
 
 
562 aa  587  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0996  NADH dehydrogenase (quinone)  52.88 
 
 
595 aa  581  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2428  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  52.41 
 
 
557 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3925  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  50.97 
 
 
562 aa  569  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2822  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  52.44 
 
 
585 aa  530  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112551  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  37.84 
 
 
552 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4112  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  35.81 
 
 
656 aa  303  7.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483313  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  34.98 
 
 
602 aa  302  1e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  36.17 
 
 
656 aa  299  9e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  35.88 
 
 
607 aa  299  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  35.88 
 
 
607 aa  299  1e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  41.27 
 
 
545 aa  298  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  35.31 
 
 
610 aa  298  2e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  41.27 
 
 
545 aa  298  3e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  35.61 
 
 
624 aa  297  4e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  34.68 
 
 
597 aa  296  5e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  41.94 
 
 
545 aa  296  5e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  34.99 
 
 
535 aa  294  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.1 
 
 
421 aa  293  9e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  33.91 
 
 
597 aa  291  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  41.16 
 
 
407 aa  290  5.0000000000000004e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  35.76 
 
 
570 aa  290  6e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  35.15 
 
 
569 aa  290  6e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  41.01 
 
 
538 aa  288  1e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  35.06 
 
 
532 aa  289  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  40.76 
 
 
539 aa  287  2.9999999999999996e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.29 
 
 
422 aa  286  9e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  35.76 
 
 
537 aa  286  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  39.8 
 
 
407 aa  286  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  34.38 
 
 
535 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1923  NADH dehydrogenase (quinone)  35.08 
 
 
539 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  36.13 
 
 
535 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  34.38 
 
 
535 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  35.27 
 
 
677 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  33.4 
 
 
614 aa  283  5.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  36.74 
 
 
530 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  34.62 
 
 
595 aa  282  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  34.94 
 
 
604 aa  282  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2055  NADH dehydrogenase I subunit F  40.6 
 
 
433 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517668  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.79 
 
 
451 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  33.01 
 
 
572 aa  281  3e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.75 
 
 
434 aa  281  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  34.36 
 
 
594 aa  281  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1027  NADH dehydrogenase I subunit F  41.03 
 
 
434 aa  279  8e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  34.21 
 
 
632 aa  278  2e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0864  hydrogenase subunit HymB, putative  33.46 
 
 
640 aa  278  3e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.55 
 
 
449 aa  276  6e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1209  NADH dehydrogenase I subunit F  40.1 
 
 
433 aa  276  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335616  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1357  NADH dehydrogenase I subunit F  40.77 
 
 
434 aa  276  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1080  NADH dehydrogenase I subunit F  40.1 
 
 
433 aa  276  7e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  33.91 
 
 
562 aa  276  8e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1360  NADH dehydrogenase I subunit F  38.86 
 
 
437 aa  276  8e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315276  normal  0.0477199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1265  NADH dehydrogenase I subunit F  40.51 
 
 
434 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2394  NADH dehydrogenase I subunit F  40.15 
 
 
436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.140128  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1718  NADH dehydrogenase I subunit F  41.03 
 
 
434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4395  NADH dehydrogenase I subunit F  40.1 
 
 
433 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  33.72 
 
 
597 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  40.4 
 
 
428 aa  276  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3224  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.9 
 
 
439 aa  276  1.0000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762011 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  33.46 
 
 
597 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1014  NADH dehydrogenase I subunit F  39.85 
 
 
433 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  34.04 
 
 
596 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2864  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.73 
 
 
454 aa  274  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  hitchhiker  0.00675695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4131  NADH dehydrogenase I subunit F  39.85 
 
 
433 aa  274  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.519753  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  39.03 
 
 
594 aa  274  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  39.04 
 
 
430 aa  274  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4556  NADH dehydrogenase I subunit F  39.25 
 
 
441 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_002978  WD0976  NADH dehydrogenase I subunit F  40.05 
 
 
417 aa  273  5.000000000000001e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  33.85 
 
 
626 aa  273  5.000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31688  NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit, mitochondrial precursor (Complex I-51KD) (CI-51KD)  41.62 
 
 
484 aa  273  5.000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.472796  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  33.08 
 
 
629 aa  273  6e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  35.37 
 
 
603 aa  273  8.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0748  NADH dehydrogenase I subunit F  41.76 
 
 
432 aa  273  9e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147388  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  34.23 
 
 
626 aa  272  1e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2215  NADH dehydrogenase I subunit F  40.25 
 
 
441 aa  272  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  31.41 
 
 
614 aa  272  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  33.85 
 
 
588 aa  272  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  34.04 
 
 
623 aa  271  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  33.65 
 
 
623 aa  271  2e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1882  NADH dehydrogenase I subunit F  40.51 
 
 
441 aa  271  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  40.61 
 
 
433 aa  271  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>