More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2577 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1110  NADH dehydrogenase (quinone)  63.26 
 
 		 600 aa  737    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2577  dehydrogenase subunit, putative  100 
 
 		 561 aa  1139    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2798  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  59.01 
 
 		 661 aa  674    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0743425  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4652  NADH dehydrogenase (quinone)  66.79 
 
 		 580 aa  736    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198503  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4581  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  61.14 
 
 		 572 aa  639    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.531155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0338  NADH dehydrogenase (quinone)  67.46 
 
 		 573 aa  738    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8359  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  63.65 
 
 		 567 aa  656    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4073  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  62.39 
 
 		 612 aa  702    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5227  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  63.65 
 
 		 572 aa  656    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00138692  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3270  NADH dehydrogenase (quinone)  62.85 
 
 		 591 aa  682    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  68.94 
 
 		 566 aa  743    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235735  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0294  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  62.02 
 
 		 572 aa  644    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.972061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2512  NADH dehydrogenase (quinone)  66.55 
 
 		 563 aa  741    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.477577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3267  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  62.73 
 
 		 572 aa  675    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00072788  normal  0.294343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5042  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  61.33 
 
 		 572 aa  642    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.558734  normal  0.200825 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1281  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  62.55 
 
 		 565 aa  657    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.532683  normal  0.302449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3471  NADH dehydrogenase (quinone)  61.04 
 
 		 640 aa  700    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119325 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0825  NADH dehydrogenase (quinone)  61.63 
 
 		 600 aa  704    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6172  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  61.51 
 
 		 572 aa  642    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3191  NADH dehydrogenase (quinone)  60.77 
 
 		 562 aa  627  1e-178  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3925  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  57.27 
 
 		 562 aa  622  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2428  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  57.81 
 
 		 557 aa  600  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0996  NADH dehydrogenase (quinone)  55.86 
 
 		 595 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2822  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  58.72 
 
 		 585 aa  552  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112551  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  35 
 
 		 602 aa  307  3e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  35.81 
 
 		 535 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.6 
 
 		 421 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  43.11 
 
 		 656 aa  301  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  40.1 
 
 		 597 aa  296  8e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  34.87 
 
 		 607 aa  295  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  34.87 
 
 		 607 aa  295  2e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  33.84 
 
 		 610 aa  295  2e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2864  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.2 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  hitchhiker  0.00675695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.65 
 
 		 434 aa  291  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.12 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.12 
 
 		 441 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.12 
 
 		 441 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  40.92 
 
 		 545 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  36.21 
 
 		 530 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  39.9 
 
 		 545 aa  286  5e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  37.55 
 
 		 532 aa  286  7e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  40.66 
 
 		 545 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  39.27 
 
 		 407 aa  285  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  35.49 
 
 		 552 aa  284  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  39.43 
 
 		 407 aa  283  5.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  39.11 
 
 		 594 aa  283  8.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3862  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.58 
 
 		 443 aa  282  1e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.59 
 
 		 426 aa  282  1e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  35.2 
 
 		 629 aa  281  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.75 
 
 		 451 aa  282  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0216  NADH dehydrogenase (quinone)  39.59 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  37.16 
 
 		 535 aa  281  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  40.25 
 
 		 539 aa  281  3e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  36.63 
 
 		 537 aa  280  4e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1517  NADH dehydrogenase (quinone)  41.39 
 
 		 427 aa  280  5e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  33.6 
 
 		 604 aa  280  6e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  38.6 
 
 		 597 aa  279  7e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3224  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.67 
 
 		 439 aa  279  8e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762011 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  35.69 
 
 		 626 aa  279  8e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.75 
 
 		 449 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1545  NADH dehydrogenase (quinone)  40.98 
 
 		 668 aa  278  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  34.3 
 
 		 597 aa  279  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0225  NADH dehydrogenase (quinone)  41.54 
 
 		 417 aa  278  2e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.2 
 
 		 441 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4112  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  34.17 
 
 		 656 aa  278  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  36.94 
 
 		 538 aa  277  3e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.48 
 
 		 422 aa  277  4e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  34.64 
 
 		 535 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_154  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  41.54 
 
 		 417 aa  276  5e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  34.64 
 
 		 535 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  33.46 
 
 		 572 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0146  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  41.28 
 
 		 417 aa  274  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28536  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  39.65 
 
 		 591 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  37.17 
 
 		 614 aa  272  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  35.63 
 
 		 570 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3921  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  39.44 
 
 		 593 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4005  NADH dehydrogenase (quinone)  39.34 
 
 		 593 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42089e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  36.05 
 
 		 592 aa  271  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  38.73 
 
 		 624 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  40.2 
 
 		 426 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  39.74 
 
 		 677 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2711  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.1 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1612  NADH dehydrogenase (quinone)  38.7 
 
 		 466 aa  269  1e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.709157  normal  0.640028 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3350  NADH dehydrogenase I, F subunit  38.64 
 
 		 591 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.051471 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  34.11 
 
 		 596 aa  268  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4239  NADH dehydrogenase (quinone)  38.4 
 
 		 593 aa  267  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  36.87 
 
 		 486 aa  267  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  39.57 
 
 		 595 aa  267  4e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1923  NADH dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 		 539 aa  267  4e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1080  NADH dehydrogenase I subunit F  42.78 
 
 		 433 aa  267  5e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  39.45 
 
 		 427 aa  266  5e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1634  NADP-reducing hydrogenase chain C  36.87 
 
 		 486 aa  267  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000096005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1844  NADP-reducing hydrogenase chain C  36.87 
 
 		 486 aa  267  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1209  NADH dehydrogenase I subunit F  42.78 
 
 		 433 aa  267  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0388  NADH dehydrogenase (quinone)  40.3 
 
 		 523 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  38.99 
 
 		 619 aa  266  7e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  38.07 
 
 		 562 aa  266  8.999999999999999e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  36.7 
 
 		 438 aa  265  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  33.99 
 
 		 569 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1024  NADH dehydrogenase (quinone)  39.06 
 
 		 407 aa  266  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>