More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0338 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2577  dehydrogenase subunit, putative  67.46 
 
 
561 aa  749    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4073  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  64.99 
 
 
612 aa  746    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4652  NADH dehydrogenase (quinone)  68.29 
 
 
580 aa  774    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198503  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0338  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
573 aa  1164    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3270  NADH dehydrogenase (quinone)  63.15 
 
 
591 aa  687    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1110  NADH dehydrogenase (quinone)  62.31 
 
 
600 aa  738    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  72.43 
 
 
566 aa  800    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235735  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2798  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  61.78 
 
 
661 aa  712    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0743425  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0825  NADH dehydrogenase (quinone)  64.19 
 
 
600 aa  734    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2512  NADH dehydrogenase (quinone)  65.34 
 
 
563 aa  694    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.477577  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3471  NADH dehydrogenase (quinone)  64.07 
 
 
640 aa  738    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.119325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3267  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  60 
 
 
572 aa  634  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00072788  normal  0.294343 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8359  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  60.73 
 
 
567 aa  616  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5227  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  60.73 
 
 
572 aa  616  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00138692  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6172  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  58.42 
 
 
572 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0294  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  58.97 
 
 
572 aa  595  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.972061  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1281  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  57.19 
 
 
565 aa  597  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.532683  normal  0.302449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4581  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  58.24 
 
 
572 aa  593  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.531155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5042  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  58.06 
 
 
572 aa  591  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.558734  normal  0.200825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3925  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  53.78 
 
 
562 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0996  NADH dehydrogenase (quinone)  58.59 
 
 
595 aa  569  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3191  NADH dehydrogenase (quinone)  54.03 
 
 
562 aa  565  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2428  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  55.77 
 
 
557 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2822  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  58.65 
 
 
585 aa  541  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112551  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  36.78 
 
 
602 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  36.99 
 
 
607 aa  316  8e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  36.99 
 
 
607 aa  316  8e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  42.57 
 
 
535 aa  312  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4112  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  37.12 
 
 
656 aa  311  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483313  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  35.44 
 
 
610 aa  310  4e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.53 
 
 
421 aa  309  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  40.66 
 
 
545 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  40.36 
 
 
407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.77 
 
 
422 aa  304  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  41.6 
 
 
552 aa  303  6.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  41.18 
 
 
407 aa  303  7.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  38.52 
 
 
532 aa  302  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  34.49 
 
 
597 aa  300  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  35.48 
 
 
572 aa  299  8e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  38.39 
 
 
537 aa  299  9e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1545  NADH dehydrogenase (quinone)  43.48 
 
 
668 aa  299  9e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  36.99 
 
 
530 aa  299  9e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  43 
 
 
656 aa  299  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  36.2 
 
 
535 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  35.07 
 
 
626 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  35.81 
 
 
535 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  37.86 
 
 
535 aa  298  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  35.19 
 
 
623 aa  296  7e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  35.82 
 
 
629 aa  296  9e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  35.62 
 
 
569 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  35.44 
 
 
597 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  39.65 
 
 
594 aa  296  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1024  NADH dehydrogenase (quinone)  40.21 
 
 
407 aa  295  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  36.05 
 
 
677 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  35.07 
 
 
623 aa  295  2e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  33.98 
 
 
597 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  40.95 
 
 
545 aa  293  4e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  40.95 
 
 
545 aa  293  5e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  36.29 
 
 
603 aa  292  9e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  36.38 
 
 
570 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0807  NADH dehydrogenase (quinone)  41.46 
 
 
404 aa  291  3e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1209  NADH dehydrogenase I subunit F  42.93 
 
 
433 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335616  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1080  NADH dehydrogenase I subunit F  42.93 
 
 
433 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.85 
 
 
434 aa  289  9e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1014  NADH dehydrogenase I subunit F  42.67 
 
 
433 aa  289  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  38.58 
 
 
538 aa  289  1e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.81 
 
 
451 aa  289  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1517  NADH dehydrogenase (quinone)  42.78 
 
 
427 aa  288  2e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2055  NADH dehydrogenase I subunit F  43.16 
 
 
433 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517668  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  34.47 
 
 
624 aa  288  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  34.04 
 
 
614 aa  288  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.16 
 
 
438 aa  286  5e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  40.91 
 
 
590 aa  286  5.999999999999999e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  33.4 
 
 
594 aa  286  8e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  40.56 
 
 
626 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3921  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  38.96 
 
 
593 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4005  NADH dehydrogenase (quinone)  38.71 
 
 
593 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42089e-25 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.3 
 
 
449 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.34 
 
 
447 aa  283  6.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  38.79 
 
 
488 aa  283  6.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  34.91 
 
 
626 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  40.81 
 
 
624 aa  283  8.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  35.7 
 
 
595 aa  283  8.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43184  predicted protein  42.55 
 
 
449 aa  283  8.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.236516  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  39.95 
 
 
591 aa  282  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0225  NADH dehydrogenase (quinone)  41.38 
 
 
417 aa  282  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3862  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.89 
 
 
443 aa  282  1e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  37.07 
 
 
592 aa  282  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  40 
 
 
422 aa  282  1e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  40 
 
 
422 aa  281  2e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0714  NADH dehydrogenase I subunit F  38.17 
 
 
413 aa  281  2e-74  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.657968  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  35.25 
 
 
596 aa  281  3e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  37.88 
 
 
486 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31688  NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit, mitochondrial precursor (Complex I-51KD) (CI-51KD)  38.83 
 
 
484 aa  281  3e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.472796  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_154  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  41.38 
 
 
417 aa  281  3e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  34.53 
 
 
626 aa  280  4e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  39.54 
 
 
623 aa  280  4e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.21 
 
 
434 aa  280  4e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0146  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  41.38 
 
 
417 aa  280  5e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28536  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43944  predicted protein  39.41 
 
 
493 aa  280  5e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>