More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0825 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2577  dehydrogenase subunit, putative  61.63 
 
 
561 aa  704    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4652  NADH dehydrogenase (quinone)  66.49 
 
 
580 aa  738    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198503  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0338  NADH dehydrogenase (quinone)  64.19 
 
 
573 aa  724    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2798  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  72.2 
 
 
661 aa  859    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0743425  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3270  NADH dehydrogenase (quinone)  73.68 
 
 
591 aa  847    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  66.78 
 
 
566 aa  739    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235735  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1110  NADH dehydrogenase (quinone)  71.29 
 
 
600 aa  886    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2512  NADH dehydrogenase (quinone)  61.35 
 
 
563 aa  657    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.477577  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4073  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  78.52 
 
 
612 aa  952    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0825  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
600 aa  1229    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3471  NADH dehydrogenase (quinone)  75.16 
 
 
640 aa  926    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.119325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3267  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  56.97 
 
 
572 aa  615  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00072788  normal  0.294343 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8359  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  57.67 
 
 
567 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5227  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  57.67 
 
 
572 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1281  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  56.97 
 
 
565 aa  598  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.532683  normal  0.302449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5042  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  56.38 
 
 
572 aa  587  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.558734  normal  0.200825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4581  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  56.38 
 
 
572 aa  586  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.531155 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6172  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  55.75 
 
 
572 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0294  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  56.56 
 
 
572 aa  581  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.972061  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3925  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  53.87 
 
 
562 aa  581  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2428  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  54.42 
 
 
557 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0996  NADH dehydrogenase (quinone)  56.07 
 
 
595 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3191  NADH dehydrogenase (quinone)  54.75 
 
 
562 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2822  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  54.97 
 
 
585 aa  518  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112551  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  36.08 
 
 
602 aa  299  9e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  37.24 
 
 
607 aa  297  4e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  37.24 
 
 
607 aa  297  4e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4112  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  36.38 
 
 
656 aa  289  8e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483313  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  35.25 
 
 
610 aa  289  1e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  37.97 
 
 
532 aa  288  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  36.69 
 
 
552 aa  288  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  37.06 
 
 
535 aa  288  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.16 
 
 
421 aa  287  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  33.01 
 
 
597 aa  286  8e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  36.83 
 
 
535 aa  284  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
614 aa  284  4.0000000000000003e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  36.44 
 
 
537 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  33.85 
 
 
572 aa  282  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  35.78 
 
 
677 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  34.82 
 
 
569 aa  280  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2864  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.34 
 
 
454 aa  280  6e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  hitchhiker  0.00675695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.15 
 
 
434 aa  280  8e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  40.36 
 
 
656 aa  279  9e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  36.49 
 
 
530 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  32.5 
 
 
597 aa  276  7e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  35.59 
 
 
570 aa  276  9e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  34.23 
 
 
595 aa  276  9e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  39.43 
 
 
407 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  31.85 
 
 
614 aa  273  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  39.58 
 
 
407 aa  273  5.000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  40.05 
 
 
545 aa  273  6e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2794  NADH dehydrogenase (quinone)  36.06 
 
 
572 aa  272  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1923  NADH dehydrogenase (quinone)  36.28 
 
 
539 aa  272  1e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  34.3 
 
 
594 aa  272  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.77 
 
 
451 aa  272  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  34.23 
 
 
597 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  35.69 
 
 
535 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  35.66 
 
 
626 aa  271  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  34.04 
 
 
629 aa  270  5e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  37.97 
 
 
545 aa  270  5e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  37.97 
 
 
545 aa  270  5e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38 
 
 
422 aa  270  5.9999999999999995e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  33.85 
 
 
596 aa  269  8e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  33.71 
 
 
636 aa  269  8e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  35.49 
 
 
535 aa  270  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.85 
 
 
449 aa  269  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  33.9 
 
 
624 aa  269  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1517  NADH dehydrogenase (quinone)  38.94 
 
 
427 aa  268  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  33.71 
 
 
636 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1545  NADH dehydrogenase (quinone)  40.2 
 
 
668 aa  266  5.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  38.6 
 
 
428 aa  266  5.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0864  hydrogenase subunit HymB, putative  33.97 
 
 
640 aa  266  8.999999999999999e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  33.71 
 
 
624 aa  266  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43184  predicted protein  40.31 
 
 
449 aa  265  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.236516  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  35.7 
 
 
603 aa  266  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.2 
 
 
433 aa  265  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  33.72 
 
 
562 aa  264  3e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  35.38 
 
 
592 aa  264  4e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.5 
 
 
441 aa  264  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  37.05 
 
 
428 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.5 
 
 
441 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.5 
 
 
441 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  33.53 
 
 
597 aa  263  8e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  39.44 
 
 
427 aa  262  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  33.85 
 
 
597 aa  263  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  39.29 
 
 
539 aa  262  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0548  NADH dehydrogenase I subunit F  38.77 
 
 
427 aa  261  2e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1027  NADH dehydrogenase I subunit F  40.16 
 
 
434 aa  262  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  33.08 
 
 
623 aa  261  3e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31688  NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit, mitochondrial precursor (Complex I-51KD) (CI-51KD)  39.73 
 
 
484 aa  261  3e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.472796  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  34.21 
 
 
623 aa  261  3e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  34.1 
 
 
596 aa  261  3e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04070  NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit, putative  40.64 
 
 
534 aa  261  4e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  38.82 
 
 
488 aa  261  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.23 
 
 
426 aa  261  4e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  33.91 
 
 
626 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2394  NADH dehydrogenase I subunit F  39.12 
 
 
436 aa  260  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.140128  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.54 
 
 
429 aa  260  5.0000000000000005e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  37.85 
 
 
438 aa  260  6e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  38.11 
 
 
594 aa  259  7e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>