More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4652 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2577  dehydrogenase subunit, putative  66.79 
 
 		 561 aa  745    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4652  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 580 aa  1177    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198503  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1110  NADH dehydrogenase (quinone)  62.89 
 
 		 600 aa  743    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3270  NADH dehydrogenase (quinone)  64.84 
 
 		 591 aa  690    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  71.58 
 
 		 566 aa  779    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235735  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3267  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  61.18 
 
 		 572 aa  672    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00072788  normal  0.294343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5227  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  63.15 
 
 		 572 aa  663    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00138692  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8359  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  63.15 
 
 		 567 aa  663    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2512  NADH dehydrogenase (quinone)  64.27 
 
 		 563 aa  700    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.477577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4073  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  65.58 
 
 		 612 aa  745    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2798  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  61 
 
 		 661 aa  706    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0743425  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0825  NADH dehydrogenase (quinone)  66.49 
 
 		 600 aa  749    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3471  NADH dehydrogenase (quinone)  63.53 
 
 		 640 aa  732    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119325 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0338  NADH dehydrogenase (quinone)  68.29 
 
 		 573 aa  771    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6172  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  60.25 
 
 		 572 aa  631  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0294  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  60.43 
 
 		 572 aa  629  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.972061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5042  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  60.25 
 
 		 572 aa  630  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.558734  normal  0.200825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4581  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  60.25 
 
 		 572 aa  629  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.531155 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3925  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  55.6 
 
 		 562 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1281  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  57.58 
 
 		 565 aa  610  1e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.532683  normal  0.302449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2428  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  58.29 
 
 		 557 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0996  NADH dehydrogenase (quinone)  58.16 
 
 		 595 aa  593  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3191  NADH dehydrogenase (quinone)  54.94 
 
 		 562 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2822  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  58.88 
 
 		 585 aa  556  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112551  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4112  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  36.61 
 
 		 656 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  43.4 
 
 		 535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  36.57 
 
 		 602 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  41.03 
 
 		 610 aa  299  8e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  41.58 
 
 		 545 aa  299  9e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  36.95 
 
 		 607 aa  299  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  36.95 
 
 		 607 aa  299  1e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  38.58 
 
 		 537 aa  298  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  40.93 
 
 		 407 aa  298  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  40.31 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  43.62 
 
 		 535 aa  295  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43944  predicted protein  42.21 
 
 		 493 aa  294  3e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323695  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  38.02 
 
 		 532 aa  292  9e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.09 
 
 		 451 aa  292  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  34.23 
 
 		 597 aa  292  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  42.13 
 
 		 552 aa  290  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.75 
 
 		 421 aa  291  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  41.71 
 
 		 624 aa  290  4e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.41 
 
 		 422 aa  290  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.65 
 
 		 434 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.01 
 
 		 441 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.01 
 
 		 441 aa  289  9e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.01 
 
 		 441 aa  289  9e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.35 
 
 		 449 aa  289  9e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  40.55 
 
 		 591 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  34.68 
 
 		 597 aa  289  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  42.93 
 
 		 656 aa  288  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3921  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  40.61 
 
 		 593 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1517  NADH dehydrogenase (quinone)  42.68 
 
 		 427 aa  288  2e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3350  NADH dehydrogenase I, F subunit  40.95 
 
 		 591 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.051471 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4005  NADH dehydrogenase (quinone)  40.1 
 
 		 593 aa  286  9e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42089e-25 
 
 
-
 
NC_002978  WD0976  NADH dehydrogenase I subunit F  41.12 
 
 		 417 aa  286  1.0000000000000001e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  41.31 
 
 		 428 aa  285  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0714  NADH dehydrogenase I subunit F  39.62 
 
 		 413 aa  285  2.0000000000000002e-75  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.657968  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  41.56 
 
 		 430 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  36.61 
 
 		 569 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  35.34 
 
 		 535 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  36.22 
 
 		 595 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  39.49 
 
 		 545 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2055  NADH dehydrogenase I subunit F  41.34 
 
 		 433 aa  283  9e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  39.49 
 
 		 604 aa  282  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  35.98 
 
 		 530 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  35.34 
 
 		 535 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  39.44 
 
 		 545 aa  282  1e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  33.27 
 
 		 614 aa  281  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  37.39 
 
 		 538 aa  281  2e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0548  NADH dehydrogenase I subunit F  39.49 
 
 		 427 aa  280  4e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4239  NADH dehydrogenase (quinone)  38.94 
 
 		 593 aa  280  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2864  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.85 
 
 		 454 aa  280  6e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  hitchhiker  0.00675695 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  34.96 
 
 		 626 aa  280  7e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  34.36 
 
 		 629 aa  279  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  42.32 
 
 		 427 aa  278  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3862  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.26 
 
 		 443 aa  278  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4395  NADH dehydrogenase I subunit F  40.59 
 
 		 433 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  40.51 
 
 		 539 aa  278  2e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  33.72 
 
 		 614 aa  278  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1080  NADH dehydrogenase I subunit F  40.59 
 
 		 433 aa  277  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1209  NADH dehydrogenase I subunit F  40.59 
 
 		 433 aa  277  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  34.83 
 
 		 570 aa  276  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  36.01 
 
 		 624 aa  277  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3133  NADH dehydrogenase (quinone)  39.8 
 
 		 590 aa  276  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.846536  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  38.81 
 
 		 594 aa  276  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1014  NADH dehydrogenase I subunit F  40.35 
 
 		 433 aa  276  6e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39 
 
 		 438 aa  276  7e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  40.3 
 
 		 432 aa  276  7e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0486  NADH dehydrogenase I subunit F  39.79 
 
 		 427 aa  276  8e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0216  NADH dehydrogenase (quinone)  40.82 
 
 		 425 aa  276  9e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43184  predicted protein  41.37 
 
 		 449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.236516  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  43.8 
 
 		 592 aa  275  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  41.01 
 
 		 596 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1360  NADH dehydrogenase I subunit F  39.95 
 
 		 437 aa  275  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315276  normal  0.0477199 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  36.33 
 
 		 603 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  38.38 
 
 		 597 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  39.85 
 
 		 488 aa  274  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0748  NADH dehydrogenase I subunit F  42.15 
 
 		 432 aa  274  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.6 
 
 		 426 aa  273  5.000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>