More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2798 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2577  dehydrogenase subunit, putative  59.01 
 
 		 561 aa  674    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4652  NADH dehydrogenase (quinone)  61 
 
 		 580 aa  694    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198503  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3471  NADH dehydrogenase (quinone)  78.69 
 
 		 640 aa  1027    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4073  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  69.66 
 
 		 612 aa  856    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3270  NADH dehydrogenase (quinone)  66.45 
 
 		 591 aa  786    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0338  NADH dehydrogenase (quinone)  61.78 
 
 		 573 aa  699    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  61.16 
 
 		 566 aa  680    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235735  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0825  NADH dehydrogenase (quinone)  72.2 
 
 		 600 aa  860    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2512  NADH dehydrogenase (quinone)  57.68 
 
 		 563 aa  638    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.477577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1110  NADH dehydrogenase (quinone)  65.82 
 
 		 600 aa  823    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2798  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  100 
 
 		 661 aa  1321    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0743425  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3267  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  52.56 
 
 		 572 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00072788  normal  0.294343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5227  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  53.51 
 
 		 572 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00138692  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5042  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  53.76 
 
 		 572 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.558734  normal  0.200825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4581  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  53.92 
 
 		 572 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.531155 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8359  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  54.35 
 
 		 567 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6172  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  53.44 
 
 		 572 aa  568  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0294  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  53.26 
 
 		 572 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.972061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2428  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  52.27 
 
 		 557 aa  555  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3925  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  51.41 
 
 		 562 aa  549  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0996  NADH dehydrogenase (quinone)  53.06 
 
 		 595 aa  551  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1281  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  53.64 
 
 		 565 aa  546  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.532683  normal  0.302449 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3191  NADH dehydrogenase (quinone)  49.84 
 
 		 562 aa  527  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2822  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  52.93 
 
 		 585 aa  515  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112551  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  34.3 
 
 		 610 aa  304  4.0000000000000003e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  35.95 
 
 		 607 aa  296  7e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  35.95 
 
 		 607 aa  296  7e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  34.17 
 
 		 602 aa  296  9e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4112  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  36.7 
 
 		 656 aa  295  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  36.21 
 
 		 552 aa  293  6e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  34.76 
 
 		 535 aa  290  6e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  35.38 
 
 		 532 aa  282  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  33.99 
 
 		 537 aa  281  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  32.35 
 
 		 597 aa  281  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  32.91 
 
 		 596 aa  279  9e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  36.96 
 
 		 407 aa  278  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  33.86 
 
 		 656 aa  278  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  35.84 
 
 		 535 aa  277  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  33.09 
 
 		 595 aa  277  4e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  34.09 
 
 		 569 aa  276  6e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1923  NADH dehydrogenase (quinone)  36.18 
 
 		 539 aa  276  7e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  37.91 
 
 		 545 aa  276  8e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  33.52 
 
 		 535 aa  276  8e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  34 
 
 		 535 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  38.52 
 
 		 407 aa  276  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  31.85 
 
 		 614 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  37.86 
 
 		 545 aa  274  3e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2794  NADH dehydrogenase (quinone)  35.49 
 
 		 572 aa  272  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  34.67 
 
 		 570 aa  272  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  38.57 
 
 		 539 aa  273  1e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  37.86 
 
 		 545 aa  272  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  32.97 
 
 		 623 aa  271  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0864  hydrogenase subunit HymB, putative  33.51 
 
 		 640 aa  272  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  34.67 
 
 		 677 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  33.09 
 
 		 572 aa  271  4e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43184  predicted protein  40.15 
 
 		 449 aa  270  5e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.236516  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  32.85 
 
 		 626 aa  270  5e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  33.58 
 
 		 629 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  33.39 
 
 		 624 aa  269  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.53 
 
 		 434 aa  269  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  32.74 
 
 		 623 aa  269  1e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  31.89 
 
 		 597 aa  269  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  37.47 
 
 		 421 aa  269  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  31.24 
 
 		 614 aa  269  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  31.78 
 
 		 626 aa  268  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3224  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.43 
 
 		 439 aa  268  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762011 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  36.75 
 
 		 594 aa  266  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  34.78 
 
 		 530 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  33.52 
 
 		 597 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  36.58 
 
 		 422 aa  265  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  31.27 
 
 		 594 aa  264  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  30.53 
 
 		 706 aa  265  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0748  NADH dehydrogenase I subunit F  38.77 
 
 		 432 aa  264  4e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1560  NADH dehydrogenase I subunit F  39.01 
 
 		 429 aa  264  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  33.27 
 
 		 641 aa  263  6e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  32.18 
 
 		 597 aa  262  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  32.38 
 
 		 632 aa  262  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0926  NADH dehydrogenase I subunit F  39.14 
 
 		 431 aa  262  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  37.32 
 
 		 428 aa  263  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2864  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  34.99 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  hitchhiker  0.00675695 
 
 
-
 
NC_002978  WD0976  NADH dehydrogenase I subunit F  37.5 
 
 		 417 aa  261  4e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  38.81 
 
 		 427 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  37.56 
 
 		 430 aa  260  7e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31688  NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit, mitochondrial precursor (Complex I-51KD) (CI-51KD)  38.93 
 
 		 484 aa  260  7e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.472796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1882  NADH dehydrogenase I subunit F  38.68 
 
 		 441 aa  259  8e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  32.29 
 
 		 636 aa  259  8e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1027  NADH dehydrogenase I subunit F  37.38 
 
 		 434 aa  259  9e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.44 
 
 		 451 aa  259  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  31.94 
 
 		 636 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  37.56 
 
 		 438 aa  259  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  36.75 
 
 		 485 aa  258  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  39.01 
 
 		 433 aa  259  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  33.27 
 
 		 640 aa  259  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  38.41 
 
 		 432 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2215  NADH dehydrogenase I subunit F  38.94 
 
 		 441 aa  258  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  34.32 
 
 		 538 aa  258  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  32.11 
 
 		 562 aa  258  2e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04070  NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit, putative  39.55 
 
 		 534 aa  258  3e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  38.16 
 
 		 488 aa  257  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  31.57 
 
 		 562 aa  258  4e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>