More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2201 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2201  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  100 
 
 		 193 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  hitchhiker  0.0000000056157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1206  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  51.11 
 
 		 190 aa  190  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3554  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  48.89 
 
 		 191 aa  184  8e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.642665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6032  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  44.39 
 
 		 199 aa  174  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.40169 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3697  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  43.85 
 
 		 201 aa  171  7.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3625  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  45.51 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.347473  normal  0.725536 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09253  RNA polymerase sigma-70 factor, ECF subfamily protein  40 
 
 		 195 aa  152  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0478381  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0162  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  40.21 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2436  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.91 
 
 		 194 aa  144  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.19296  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2338  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  36.22 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1610  RNA polymerase sigma factor  34.48 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6883  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.81 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0181  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.38 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.909527 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0241  RNA polymerase sigma factor  29.51 
 
 		 202 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.421712  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0252  RNA polymerase sigma factor  30.05 
 
 		 202 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105605  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1133  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.27 
 
 		 195 aa  91.7  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26600  RNA polymerase sigma factor  28.65 
 
 		 194 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.293886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2699  RNA polymerase sigma factor  31.75 
 
 		 190 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0775043  normal  0.196873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2258  RNA polymerase sigma factor  28.11 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1078  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.11 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000713472  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0250  RNA polymerase sigma factor  30.21 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0230  RNA polymerase sigma factor  28.42 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2972  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.98 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000407273  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3054  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.98 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.217584  normal  0.28403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3152  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.98 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.269605  normal  0.607127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0184  RNA polymerase sigma factor  27.62 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.163788  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3318  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.32 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0570165  hitchhiker  0.0011398 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0316  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  28.65 
 
 		 212 aa  85.1  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2731  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.44 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1551  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.33 
 
 		 532 aa  84  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.357255  normal  0.29633 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1039  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.81 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.148351  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0863  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.22 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  4.44823e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1083  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.42 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2068  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.14 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.903797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1106  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.81 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.59449  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3251  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.81 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145067 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0843  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.57 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000467073  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0696  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.95 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000147428  decreased coverage  0.0000446652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4757  RNA polymerase sigma factor AlgU  28.72 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54430  RNA polymerase sigma factor AlgU  28.72 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000031272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2252  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  30.6 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708239  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1130  RNA polymerase sigma-70 factor, ECF subfamily  26.11 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.938596  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1140  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.25 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.556495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1231  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  26.98 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1044  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.65 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1335  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.23 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.253237  normal  0.564329 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3551  RNA polymerase sigma-70 factor  29.94 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1467  RNA polymerase sigma factor AlgU  27.66 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000401501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3311  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  26.4 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.161259  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1159  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  26.67 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.260495  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2934  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.49 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0974  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.82 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.082273  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_002936  DET1348  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  25.97 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0115454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0150  RNA polymerase sigma factor SigW  27.46 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03970  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.88 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000171758  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1471  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.52 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133791  normal  0.688879 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4855  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.05 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1027  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  26.92 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1359  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.3 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000613584  normal  0.129885 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0154  RNA polymerase sigma factor SigW  30 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000564665  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1068  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.55 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.425267 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1427  RNA polymerase sigma factor AlgU  27.66 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0770858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2038  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.62 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1067  RNA polymerase sigma factor AlgU  27.66 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0360661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4294  RNA polymerase sigma factor AlgU  27.66 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.55493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1362  RNA polymerase sigma factor AlgU  27.66 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00625661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1521  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.02 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4380  RNA polymerase sigma factor AlgU  27.66 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200849 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2662  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.26 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.81941e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0090  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.57 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000230493  normal  0.0688251 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2544  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.51 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000329231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3958  RNA polymerase sigma factor AlgU  27.66 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0486119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1920  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.9 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0798561  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39650  RNA polymerase, sigma subunit, ECF family  27.53 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81791  normal  0.37663 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1956  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.06 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0395  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.44 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0272  Fis family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341377  normal  0.75535 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1471  RNA polymerase sigma factor RpoE  28.19 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1212  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  26.4 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.110837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4224  RNA polymerase sigma-24 factor  27.66 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4648  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.38 
 
 		 222 aa  74.3  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2022  RNA polymerase sigma factor RpoE  28.21 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000162889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0579  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.3 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2321  RNA polymerase sigma factor RpoE  28.32 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1760  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.73 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0701  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.05 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212033  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1894  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  23.44 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2019  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25.39 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1736  RNA polymerase sigma factor RpoE  27.8 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2251  RNA polymerase sigma factor AlgU  27.51 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015974  normal  0.140687 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0803  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  23.53 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3887  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.25 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.526394  normal  0.0354938 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2537  RNA polymerase sigma factor  31.35 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0856  RNA polymerase sigma factor RpoE  28.32 
 
 		 205 aa  72  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000380767  normal  0.0292756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1000  RNA polymerase sigma factor RpoE  28.32 
 
 		 205 aa  72  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000231343  normal  0.0259336 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5243  RNA polymerase sigma factor  27.54 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3158  RNA polymerase sigma factor  26.82 
 
 		 233 aa  72  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148477  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3616  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.07 
 
 		 200 aa  72  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154069  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3684  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  26.47 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.328373  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1667  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.11 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0248741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>