More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1521 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1521  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
228 aa  471  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.950455  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1522  PAS sensor protein  67.26 
 
 
225 aa  328  4e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.533099  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1964  putative PAS/PAC sensor protein  54.05 
 
 
229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.705516  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1378  putative PAS/PAC sensor protein  45.36 
 
 
200 aa  196  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2525  putative PAS/PAC sensor protein  43.6 
 
 
208 aa  196  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0659487  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2936  putative PAS/PAC sensor protein  42.93 
 
 
201 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178135  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1223  signal-transduction sensor protein  46.39 
 
 
189 aa  164  9e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.658782  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4975  putative PAS/PAC sensor protein  44.03 
 
 
178 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161434  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1071  putative PAS/PAC sensor protein  36.47 
 
 
178 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0158  PAS sensor protein  40.61 
 
 
170 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00559927  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1393  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.77 
 
 
182 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4977  putative PAS/PAC sensor protein  37.89 
 
 
177 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4683  putative PAS/PAC sensor protein  39.43 
 
 
173 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1413  putative PAS/PAC sensor protein  39.63 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.026067  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4662  putative PAS/PAC sensor protein  39.38 
 
 
168 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.193201 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1233  methyl-accepting chemotaxis protein  38.36 
 
 
166 aa  124  8.000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2378  transcriptional regulator  38.37 
 
 
174 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05500  PAS domain S-box  33.33 
 
 
194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.414164  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3403  PAS sensor protein  37.21 
 
 
189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1962  methyl-accepting chemotaxis protein  39.19 
 
 
166 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0920  putative PAS/PAC sensor protein  39.26 
 
 
170 aa  119  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0368  PAS sensor protein  36.71 
 
 
168 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0044  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 
162 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2224  putative PAS/PAC sensor protein  47.22 
 
 
142 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243121  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4009  PAS  32.94 
 
 
172 aa  111  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1012  methyl-accepting chemotaxis protein  36.05 
 
 
171 aa  109  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63093  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3464  transcriptional regulator  34.88 
 
 
174 aa  108  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.38 
 
 
520 aa  108  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0964  putative PAS domain signal transduction sensor protein  35.76 
 
 
163 aa  105  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.695373  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1312  putative PAS/PAC sensor protein  32.57 
 
 
174 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal  0.171791 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1987  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with PAS/Pac sensor  43.36 
 
 
518 aa  105  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.185607  normal  0.0170041 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1204  methyl-accepting chemotaxis protein  32.1 
 
 
165 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1323  methyl-accepting chemotaxis protein  32.1 
 
 
165 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4792  putative PAS/PAC sensor protein  32.16 
 
 
174 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2577  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.59 
 
 
524 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  43.48 
 
 
1214 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0540  methyl-accepting chemotaxis protein  33.13 
 
 
166 aa  102  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1125  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42 
 
 
532 aa  102  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0532  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.17 
 
 
523 aa  102  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0374128 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1924  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.76 
 
 
901 aa  102  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0963  putative PAS domain signal transduction sensor protein  34.21 
 
 
163 aa  102  6e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.598174  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.29 
 
 
716 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0659  putative PAS/PAC sensor protein  38.52 
 
 
164 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3595  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.53 
 
 
515 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2812  putative PAS/PAC sensor protein  39.23 
 
 
166 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.494423  decreased coverage  0.000000324615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2726  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.15 
 
 
538 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  47.73 
 
 
516 aa  99.8  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.1353  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3270  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.49 
 
 
532 aa  99  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.415489  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4027  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  50 
 
 
521 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664053  normal  0.0821551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3404  methyl-accepting chemotaxis protein  39.47 
 
 
522 aa  97.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1648  aerotaxis receptor  43.33 
 
 
521 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.47 
 
 
522 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0176898 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1390  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.68 
 
 
534 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4521  aerotaxis receptor, putative  48.68 
 
 
521 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4927  methyl-accepting chemotaxis protein/sensory box protein  47.37 
 
 
511 aa  97.1  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3735  PAS  44.44 
 
 
521 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.065462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.36 
 
 
174 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0725  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.49 
 
 
495 aa  97.1  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
522 aa  97.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2233  putative PAS/PAC sensor protein  38.68 
 
 
177 aa  96.7  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.17522 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2690  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with PAS/Pac sensor  38.71 
 
 
524 aa  96.7  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487789  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1536  methyl-accepting chemotaxis protein  41.84 
 
 
716 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566253  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0376  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
412 aa  96.3  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.61 
 
 
532 aa  96.3  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1487  PAS domain-containing protein  34.93 
 
 
158 aa  96.3  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000133262  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1800  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.05 
 
 
521 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.258308  normal  0.504821 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1621  methyl-accepting chemotaxis protein  47.13 
 
 
513 aa  95.9  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113175  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1206  methyl-accepting chemotaxis protein  29.88 
 
 
164 aa  95.5  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0729  PAS  40.4 
 
 
945 aa  95.1  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0635035  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3481  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.22 
 
 
521 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.22 
 
 
521 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.378373  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1282  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.6 
 
 
522 aa  95.1  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1238  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.6 
 
 
522 aa  95.1  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0615962  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3073  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.6 
 
 
522 aa  95.1  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000166485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2257  aerotaxis receptor Aer-1  42.22 
 
 
521 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215452  normal  0.0215353 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0389  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
419 aa  95.1  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.39 
 
 
522 aa  94.7  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  48.68 
 
 
521 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.629648  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3477  aerotaxis receptor  35.22 
 
 
506 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2987  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  46.74 
 
 
522 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3511  aerotaxis receptor  35.22 
 
 
506 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000402751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.83 
 
 
533 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  46.74 
 
 
522 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  46.74 
 
 
522 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3403  aerotaxis receptor  34.81 
 
 
506 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3573  aerotaxis receptor  34.81 
 
 
506 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0352648  normal  0.227962 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  48.68 
 
 
551 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510218  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.01 
 
 
523 aa  93.6  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416992  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.79 
 
 
522 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  44.79 
 
 
522 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.160306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.83 
 
 
522 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41 
 
 
552 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0302709 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1214  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  44.58 
 
 
527 aa  94  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02941  fused signal transducer for aerotaxis sensory component/methyl accepting chemotaxis component  33.96 
 
 
506 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  33.96 
 
 
506 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1385  methyl-accepting chemotaxis protein  45.65 
 
 
520 aa  93.2  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02891  hypothetical protein  33.96 
 
 
506 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1933  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  40.21 
 
 
598 aa  93.2  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1860  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.32 
 
 
524 aa  92.8  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3253  aerotaxis receptor  33.96 
 
 
506 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>