More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1012 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1012  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
171 aa  357  5e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63093  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1233  methyl-accepting chemotaxis protein  61.25 
 
 
166 aa  221  4e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1962  methyl-accepting chemotaxis protein  61.25 
 
 
166 aa  218  1.9999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0158  PAS sensor protein  53.75 
 
 
170 aa  202  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00559927  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0044  putative PAS/PAC sensor protein  51.9 
 
 
162 aa  184  5e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0368  PAS sensor protein  52.63 
 
 
168 aa  171  5e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0964  putative PAS domain signal transduction sensor protein  48.12 
 
 
163 aa  157  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.695373  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1323  methyl-accepting chemotaxis protein  46.54 
 
 
165 aa  150  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1204  methyl-accepting chemotaxis protein  46.54 
 
 
165 aa  150  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4009  PAS  40.49 
 
 
172 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0540  methyl-accepting chemotaxis protein  46.88 
 
 
166 aa  149  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0963  putative PAS domain signal transduction sensor protein  43.75 
 
 
163 aa  147  9e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.598174  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1393  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
182 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3403  PAS sensor protein  41.88 
 
 
189 aa  143  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0920  putative PAS/PAC sensor protein  44.94 
 
 
170 aa  142  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1206  methyl-accepting chemotaxis protein  44.3 
 
 
164 aa  142  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1325  methyl-accepting chemotaxis protein  43.67 
 
 
164 aa  140  9e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0735034  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1413  putative PAS/PAC sensor protein  41.51 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.026067  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05500  PAS domain S-box  39.38 
 
 
194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.414164  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1071  putative PAS/PAC sensor protein  39.62 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4975  putative PAS/PAC sensor protein  40.88 
 
 
178 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161434  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2378  transcriptional regulator  40.24 
 
 
174 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1223  signal-transduction sensor protein  41.51 
 
 
189 aa  137  7e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.658782  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4662  putative PAS/PAC sensor protein  38.99 
 
 
168 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.193201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4977  putative PAS/PAC sensor protein  39.49 
 
 
177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4683  putative PAS/PAC sensor protein  40.88 
 
 
173 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1312  putative PAS/PAC sensor protein  39.13 
 
 
174 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal  0.171791 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2233  putative PAS/PAC sensor protein  40.35 
 
 
177 aa  131  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.17522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4792  putative PAS/PAC sensor protein  39.13 
 
 
174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3464  transcriptional regulator  37.2 
 
 
174 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.27 
 
 
174 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2525  putative PAS/PAC sensor protein  34.91 
 
 
208 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0659487  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2936  putative PAS/PAC sensor protein  36.65 
 
 
201 aa  121  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178135  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2726  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.19 
 
 
538 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1522  PAS sensor protein  38.16 
 
 
225 aa  118  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.533099  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0729  PAS  46.34 
 
 
945 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0635035  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1150  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  49.18 
 
 
522 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  49.18 
 
 
522 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2812  putative PAS/PAC sensor protein  43.08 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.494423  decreased coverage  0.000000324615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  49.18 
 
 
522 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.737349  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1378  putative PAS/PAC sensor protein  37.04 
 
 
200 aa  115  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2577  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.86 
 
 
524 aa  114  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.04 
 
 
556 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3404  methyl-accepting chemotaxis protein  47.11 
 
 
522 aa  112  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2113  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  47.15 
 
 
550 aa  112  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1238  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.77 
 
 
522 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0615962  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0995  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 
517 aa  112  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1282  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.77 
 
 
522 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3073  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  46.77 
 
 
522 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000166485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0674  PAS  41.6 
 
 
544 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0602  methyl-accepting chemotaxis protein  45.9 
 
 
536 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6942  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.98 
 
 
566 aa  111  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.84 
 
 
519 aa  111  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.77 
 
 
522 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0176898 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1363  PAS  37.78 
 
 
544 aa  110  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer, Pas/Pac sensor  43.44 
 
 
565 aa  110  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.98 
 
 
522 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06258  hypothetical protein  44.19 
 
 
520 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000496  methyl-accepting chemotaxis protein  43.51 
 
 
520 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0232366  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.74 
 
 
520 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1521  putative PAS/PAC sensor protein  36.05 
 
 
228 aa  109  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.950455  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  44.03 
 
 
523 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.04 
 
 
551 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510218  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0532  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.62 
 
 
523 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0374128 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1933  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.44 
 
 
598 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3407  aerotaxis receptor  39.37 
 
 
506 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3403  aerotaxis receptor  39.37 
 
 
506 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3573  aerotaxis receptor  39.37 
 
 
506 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0352648  normal  0.227962 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3511  aerotaxis receptor  38.58 
 
 
506 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000402751 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1618  chemotaxis sensory transducer  42.74 
 
 
557 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.126465 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3477  aerotaxis receptor  38.58 
 
 
506 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  46.09 
 
 
543 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112151 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1860  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  44.35 
 
 
524 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3595  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.13 
 
 
515 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03783  Methyl-accepting chemotaxis protein (PAS/PAC and MSP doamins)  40 
 
 
527 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24380  aerotaxis receptor Aer  41.27 
 
 
567 aa  105  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  44.25 
 
 
714 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3023  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  46.96 
 
 
514 aa  104  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.52 
 
 
521 aa  104  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00326538  normal  0.948878 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2987  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  44.44 
 
 
522 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0749  aerotaxis sensor receptor  39.69 
 
 
669 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2685  methyl-accepting chemotaxis protein  39.69 
 
 
580 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394636  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0264  methyl-accepting chemotaxis protein  39.69 
 
 
580 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0927  methyl-accepting chemotaxis protein  39.69 
 
 
623 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0389  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.1 
 
 
419 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0760  aerotaxis sensor receptor  39.69 
 
 
583 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2390  methyl-accepting chemotaxis protein  39.69 
 
 
580 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.790589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2473  methyl-accepting chemotaxis protein  39.69 
 
 
580 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  40.32 
 
 
521 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2111  aerotaxis receptor Aer-2  39.52 
 
 
521 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0317394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3735  PAS  40.87 
 
 
521 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.065462 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1487  PAS domain-containing protein  39.2 
 
 
158 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000133262  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1800  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.48 
 
 
521 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.258308  normal  0.504821 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.86 
 
 
954 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1214  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.65 
 
 
527 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2372  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  44.72 
 
 
579 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.85 
 
 
552 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0302709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4521  aerotaxis receptor, putative  41.13 
 
 
521 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3406  PAS  37.9 
 
 
521 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387271  normal  0.671486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3770  aerotaxis receptor Aer  39.52 
 
 
521 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>